基于高通量测序技术的恶性疟原虫plasmodium falciparum3d7虫株红内期新的长链非编码rna的分析与初步验证

《基于高通量测序技术的恶性疟原虫plasmodium falciparum3d7虫株红内期新的长链非编码rna的分析与初步验证》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、京诚如ｔｆ促中画赛３刘硕＋研究生学位论文臟ｌｉｐｉ北京协和陵学院研究生院…０２３学校代码：２０２００５０５６学号：Ｓ１硕±学位论文基于高通量测巧技术的恶性拒原虫仪３迎？０出Ｕ瓜／ａＪｃｊ如２＾３０７虫株红内期新的长链非编码ＲＮＡ的分析与巧步验证所院：北京协和医学院基础学院姓名：姚瑶指导教师：王恒导师小组：刘力、许雪梅科专业：．学病原生物学ＲＮＡ研究方向；恶性拒原虫长链非编码表达研巧完成日期：２０巧年已月北京协和

2、医学院硕±研巧生学位论文目录２蚊摘要Ａｂｓｔｒａｃｔ３１前胃５１５．１拒疾和炬原虫简介１６．２恶性茫原虫体外同步化培养１．３长链非编码ＲＮＡ概述６１．４恶性拒原虫ＩｎｃＲＮＡ研究进展１０２研充策略和技术路线１３４３实验方法１７１５３．１戶．孤体外培养－ａＪｃ３２７／曲３Ｄ３．２５％Ｄ山梨醇体外同步化培养户．／如７虫株１７３．／ａ化ｒａｍ孤７ＲＮＡ１８．３户如ｉ；虫体收集和提取３．４ＤＮａｓｅ消化去除ＲＮ

3、Ａ样品残留的ＤＮＡ２０３２０．５ＲＮＡ祥品凝胶电泳检测３．６生物信息学分析２１３．７逆转录ＰＣＲ验证ＩｎｃＲＮＡ２２２６４实验结果－４１．／ａ／ｃｊａｒｕ助３Ｄ７．户ｐ虫株体外同步化培养结果％４．２户７－伯ｉｃ如ａｎ／说ＤＲＮＡ的提取与质量检测２８．ｕｍｎａ／Ｓｏｘａ双末端测序结果分析２９４３ｉｌｌｉｌｅ－４．４ＩｎｃＲＮＡｓＲＴＰＣＲ巧验证？５讨３９５．１恶性拒原虫同步化方法巧ｎｃＲＮＡｓ９ｔ２高通量

4、测序与生物信息学结合预测新的Ｉ３．５３戶．向知如３Ｄ７的ＩｎｃＲＮＡｓ特点与期特异性表达４０５．４Ｐ．ｆａｌｃｉｐａｒｕｍ３Ｄ７ＱｔｌＩｎｃＲＮＡｓＨｉＥ４１５．５本研巧存在不足与展望４１＾ｉｔ４２参考：￥：献４３附录比硕±期间发表的文章和参加的会议４８ｍ．谢４９５０独创性声明学位论文版权使用授权书５０１北京协和医学院硕±研巧生学位论文基于高通量测序技术的恶性痕原虫於的３Ｄ７虫株红内期新的长链非编码ＲＮＡ的分

5、析与巧步验证姚瑶Ｃ北京协和医学院，１００００５北京）中文摘要一追疾是由拒原虫引起的种严重的寄生虫病。其中，恶性拒原虫是导致人类拒疾感染致死率最高的病原体。恶性炬原虫的生活史包括在人体内的无性繁殖阶段（红外期和红内期）Ｗ及在蚊体内的有性繁殖期（蚊期）。恶性茫原虫在红细胞内期的裂体增殖是炬疾发作的基础，包括从裂殖子侵入红细胞开始的裂殖子期、环状体期、早期和晚期滋养体期直至裂殖体期。研巧恶性拒原虫在红细胞内的生长发育过程具有非常重要的意义。ＲＮＡ一长链非编码是类长度大于

6、２００核巧酸并且不具有蛋白编码能力的转录本，占全部非编码ＲＮＡ的近８０％。研究表明，ＩｎｃＲＮＡ可通过繁复的机制参与有机体的各种活动，如表观遗传学修饰、转录和翻译调控Ｗ及剪切拼接控制细胞周期、细胞分化和细胞调亡等。恶性痕原虫基因组转录大量的ＩｎｃＲＮＡ，但这些ＩｎｃＲＮＡ在恶性拒原虫的增殖发育过程中的作用却知之甚少。为了探索恶性拒原虫红内期不同发育阶段的ＩｎｃＲＮＡ表达谱及其特异性。本研巧采用山梨醇连续多次处理体外培养并处于环状体的恶性拒原虫虫株，获得高度同步化、窗口小、虫血

7、率高并处于不同生长阶段的恶性拒原虫虫株，选取环期及裂殖体期构建了２个时期的链特异性文库，并进行Ｉｌｌｕｍｉｎａ／Ｓｏｌｅｘａ双末端测序。通一过进步对环期与裂殖体期的测序数据进行生物信息学分析，序列比对、序列拼接、编码潜能分析预测了５５条在红内期特异性表达的ＩｎｃＲＮＡ。其中１３条ＩｎｃＲＭ通过ＲＴ－ＰＣＲ一得到验证，为后期进步研巧恶性拒原虫红内期期特异性表达的ＩｎｃＲＭｓ的功能提供了基本的数据信息。－关键词：恶性拒原虫红内期同步化长链非编码ＲＮＡＲＭｓｅｑ２北京协和

8、医学院硕±研充生学位论文ＡｎａｌｓｉｓｏｆＰｌａｓｍｏｄｉｕｍａｌｃｉａｒｕｍｔｒａｎｓｃｒｉｔｏｍｅｙｆｐｐｕ－－ｓｉｎＲＮＡｓｅｕｅｎｃｅｔｏｄｉｓｃｏｖｅｒｎｏｖｅｌｌｏｎｎｏｎｃｏｄｉｎｇｑｇｇＲＮＡｓｉｎｉｎｔｒａｅｉｙｔｈｒｏｃｙｔｉｃｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｓｔａｇｅＹａｏＹａｏ（Ｉｎｓｔｉｔｕ化ｏｆＢａｓｉｃＭｅｄｉｃａｌＳｃｉｅ打ｃｅｓ，ＣＡＭＳａｎｄＰＵＭＣ