利用snp标记构建苦荞高密度遗传图谱及重要农艺性状的qtl分析

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1、学校代码：10663学号：4201210000529贵州师范大学硕士学位论文利用SNP标记构建苦荞高密度遗传图谱及重要农艺性状的QTL分析ConstructionofTartaryBuckwheatHigh-DensityGeneticMapwithSNPmarkersandQTLanalysisforimportantagronomictraits专业名称：遗传学专业代码：071007研究方向：植物遗传、进化与育种申请人姓名：闫玉莹导师姓名：陈庆富教授宋驰副研究员二零一五年五月十五日CodeofUniversity:10663CodeofStudent:42012100

2、00529GraduationDissertationforMasterDegreeGuizhouNormalUniversityConstructionofTartaryBuckwheatHigh-DensityGeneticMapwithSNPmarkersandQTLanalysisforimportantagronomictraitsSpecialityName：GeneticsSpecialityCode：071007ResearchalDirection：PlantGenetics,EvolutionandBreedingGraduate：YanYu-Ying

3、Tutor：Prof.Dr.ChenQing-FuAssoc.Prof.SongChiInstitute:InstituteofPlantGeneticsandBreeding,ResearchCenterofBuckwheatIndustryTechnologySchool:SchoolofLifeSciencesMay15,2015,inGuiyang,China摘要苦荞是一种重要的药食兼用的小宗作物，因其富含黄酮类物质，具有降血糖、降血脂、降血压等作用而日益受到人们的重视。苦荞产量及重要品质性状大多数为复杂的数量性状，受微效多基因和环境的共同作用，遗传改良难度较大。

4、目前苦荞育种主要是传统育种方法如系统育种、诱变育种等，育种效率低、育种周期长。遗传图谱的构建，可找到与目标性状紧密连锁或共分离的分子标记，即可借助标记辅助选择来缩短荞麦育种周期，进而提高其育种效率。本研究以苦荞栽培品种“小米荞”为母本和“晋荞2号”作为父本，采用有性杂交所得杂种后代再经“一粒传法”创制而得到分离群体F3代，从中随机选取200份单株材料作为作图群体，对亲本和分离群体分别进行限制性酶切位点相关的DNA（Restriction-siteassociatedDNA，RAD）酶切测序，以此开发大量SNP标记从而构建苦荞高密度遗传图谱，并对株高、单株粒重、百粒重等农艺

5、性状进行QTL分析，研究结果如下：1.采用RAD酶切测序技术对苦荞亲本和200个F3单株进行简化基因组测序，通过生物信息学分析的方法，在亲本与200个子代中共检测到3614个SNP位点。利用卡方过滤掉偏分离位点，得到了可信度较高的SNP位点共1179个SNP位点。2.利用上述标记对苦荞进行遗传连锁图谱的构建，去掉位点很少的散列连锁群后，构建的连锁图得到的包含了10个连锁群的连锁图谱，有974个标记，总覆盖遗传距离为1095.88cM，标记间平均距离为0.89cM。3.通过主要农艺性状的收集及统计，应用QTLIciMapping软件对株高、单株粒重、百粒重进行QTL分析，共

6、检测到27个QTL，检测到与株高相关的QTLs有两个，分别位于第1、7连锁群上，表型贡献率为12.56%-17.14%。I与百粒重相关的QTLs有4个，分别位于第1、2连锁群上，解释表型变异率为9.09%-24.52%。与单株粒重相关的QTLs有21个，分别位于第2、3连锁群上，解释表型变异率为35.40%-48.50%。关键词：苦荞，限制性酶切位点相关的DNA，单核苷酸多态性，遗传图谱，数量性状位点IIABSTRACTTartarybuckwheat[Fagopyrumtataricum(L.)Gaertn]istraditionallycultivatedcropfo

7、redibleandmedicinalutilizationinchina.Mainbioactivephytochemicalsflavonoidswererichinitsseedthanothercrops,whichcanreducethebloodcholesterol,regulatingthebloodsugar,bloodlipidandbloodpressureinhumanbody.Itattractsmoreandmoreattentionsinthefoodindustry.Theyieldoftart