面向计算的非关系生物数据平台的设计与实现

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1、：２０１４１０２５３１１０２００研巧生学号举校代码：分类号Ｐ３９巧巧！：Ｔ感么Ａ多硕：ｔ学位论文西向计其的乂生物教话平合巧巧计与实现ＴｈｅＤｅｓｉｎａｔｉｏｎａｎｄＩｍｐｌｅｍｅｎｔａｔｉｏｎｏｆＢｉｏｌｏｇｉｃａｌＤａｔａｇＰｌａｔｆｏｒｍ化ｒＣｏｍｐｕ化ｔｉｏｎａｌＲｅｓｅａｒｃｈｅｓ作者：汪巧欢指导教师：马志巧教？专业学位类别：工运巧±专业学位领域：针ｇ机技术＇学位类型：专业学位东北师巧大学学位评定委员会２０１６年３月？？学校代码：１０２００研究生学号：２０１４１０２巧１分类号；

2、ＴＰ３９密级；戀东批作給ｆ邊硕±学位论文面向计算的非关系生物数据平台的设计与实现ＴｈｅＤｅｓｉｎａｔｉｏｎａｎｄＩｍｌｅｍｅｎｔａｔｉｏｎｏｆＢｉｏｌｏｉｃａｌＤａｔａｇｐｇＰｌａｔｆｏｒｍ化ｒＣｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌＲｅｓｅａｒｃｈｅｓ作者：汪欢欢指导教师：马志强教授专业学位类别：工程硕±专业学位领域：计算机技术学位类型：专业学位东北师范大学学位评定委员会２０１６年３月独创性声明本人郑重声明：所提交的学位论文是本人在导师指导下独立进行研究工作所取得的成果。据我所知，除了特别加Ｗ标注和致谢的地方

3、外，论文中不包含其他人己经发表或撰写过的研究成果。对本人的研究做出重要贡。献的个人和集体，均已在文中作了明确的说明本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：７至辦娘日期：学位论文使用授权书本学位论文作者完全了解东北师范大学有关保留、使用学位论文的规定；，即东北师范大学有权保留并向国家有关部口或机构送交学位论文的。复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅本人授权东北师范大学可Ｗ将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可Ｗ采用影印、缩印或其芭复制手段保存、汇编本学位论文。（保密的学位论文在解密后适用本授权书）学位论文作者签名：３神浊

4、指导教师签名：矜《、日期；２ｎ曰期：ｌｈＪ＾学位论文作者毕业后去向：工作单位：电话：通讯地址：：邮编Ｉ摘要在生物科学与信息科学都飞速发展的今天，海量生物信息数据不断累加，将生物学和计算机科学知识相结合，发现生物数据中包含的重要生物信息，并探索生物的内在发展规律。因此也就产生了新兴学科计算生，这已经是自然科学研究中的重要课题物学，也称为生物信息学。汁算生物学研究的首要问题是为计算提供稳定全面的生物数据源，包括：如何对、存储、整理与维护如此庞大的数据信息进行收集，同时还要能为生物学研究者提供高效的数据服务。然而。面

5、对这些Ｗ指数，目前国内外面向计算的生物数据平台很少级増长的生物数据，传统的存储方式已表现出为不从必，许多计算生物学研究者也在一苦恼个方便、快捷、商效、灵活的生物数据平台为他们提供数据服务。因此，，没有开发面向计算的相应生物数据平台具有及其重要的意义。一个面向计算的非关系型数据平台本文主要的研究内容是设计与实现，将现有的各类生物信息数据进行整合、，满足计算生物学研究者的需求，对生物数据进行收集整理、存储及维护。将生物学研究过程中，常用的生物信息通过最简单快捷的方式提供给用户，从而能够让研究者只关注问题本身，而无需操也数据处理问题。本系统采用Ｐｙｔｈｏｎ编程

6、语言进巧代码编写，使用最符合现如今生物大数据的非关ｏＤＢ一系型生物数据库Ｍｏｎｇ，通过建立整套的数据管理，数据访问流程，完成了蛋白相关的数据平台建设。关键词：计算生物学；ＭｏｎｇｏＤＢ；蛋白质结构ＩＡｂｓｔｒａｃｔＷｉｔｈｔｈｅｒａｐｉｄｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｏｆｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｓｃｉｅｎｃｅａｎｄｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎｓｃｉｅｎｃｅ，ｈｕｇｅａｍｏｕｎｔｓｏｆｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｄａｔａｗｉｌｌｃｏｎｔｉｎｕｅｔｏａｃｃｕｍｕｌａｔｅ．Ｔｈｅｆｉｒｓｔｔａｓｋｉｎｎａｔｕｒａｌｓｃｉｅｎｃｅｒｅｓｅａｒ

7、ｃｈｉｓｔｏｃｏｍｂｉｎｅｂｉｏｌｏｇｙａｎｄｃｏｍｕｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅｋｎｏｗｌｅｄｅｔｏｆｉｎｄｔｈｅｐｇ，ｉｍｏｒｔａｎｔｂｉｏｌｏｉｃａｌｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎｃｏｎｔａｉｎｅｄｉｎｂｉｏｌｏｉｃａｌｄａｔａａｎｄｔｏｅｘｌｏｒｅｔｈｅｐｇｇ，ｐｉｎｈｅｒｅｎｔｌａｗｏｆｄｅｖｅｌｏｐ風ｅｎｔ．Ｔｈｕｓ，汪ｎｅｗｓｃｉｅｎｃｅｃａｌｌｅｄｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌｂｉ