抗黑条矮缩病转基因水稻新品系的鉴定和感病植株转录组分析

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2、‘－＾技术马？．＂＾户壬学科专业名称：植物生物．，７；硕、串请学位级别？１＾；＇：―５２０１５之：年５月论文提交日期：２０１５年月论文答辩日期＿＿Ｊｆ《孚‘记大学学位授予日期：２０１５年６＾学位授予单化扬州；巧＿＾１２令＾＾：一答辩委员会主席：王姑木研究易＿－￣扛斬鄭和、誦插濤巧巧公：■＇：乂、、．％：滅瓜脇义、％：卞±权抗黑条凌缩病转基因水稻新品系的鉴定和感病植株转录组分析１目录４摘要ＡＢＳＴＲＡＣＴ６符号说明８一第章文献综述１０１．１水稻黑条矮缩病研究进展１０

3、１丄１水稻黑条矮缩病病毒的生物学和分子生物学特征１１１．１．Ｕ呼肠孤病毒科１１１丄１．２ＲＢＳＤＶ病毒粒子结构与特性１２１．ＢＶ的病原及其同属病毒进化关系１３１丄３ＲＳＤ１丄１１３．４ＲＢＳＤＶ病毒基因组．５１丄１ＲＢＳＤＶ蛋白组成及功能１４１丄２ＲＢＳＤＶ在水稻上的病情特征化及病毒检测１５１丄２．１ＲＢＳＤＶ在水稻上病情特征５１１丄２．２ＲＢＳＤＶ分子检澳Ｉ１６Ｉ方法１丄３水稻黑条矮缩病病毒（ＲＢＳＤＶ）的发生和防治方法１６１丄３．１ＲＢＳＤＶ的自然传播规律１６１丄

4、３．２ＲＢＳＤＶ的物理和化学防治措施１７１丄３．３培育抗ＲＢＳＤＶ水稻品种新思路１８１丄４研究展望１９－－１：ｓｅ．２基因研究的新方向转录子测序ＲＮＡｑ２０－１．２．１转录组研究的重要性Ｗ及ＲＮＡｓｅｑ的优势２０２２－Ｒ２１１．．ＮＡｓｅｑ的实验原理和试验流程－１．２．３ＲＮＡｓｅ在转录组研究中的广泛应用及存在的问题２２ｑ－１ＲＮＡｓｅ２．２．４ｑ研究展望２１．３本研究的目的与意义２３第二章抗水稻黑条矮缩病新品系的选育２４２．１前胃２４２．２材料与方法２５２１

5、２５．２．实验材料２．２丄１供体水稻材料２５２２１２７Ｃ２５．．．ｊ稻黑条矮缩病病毒２．２．１．３载体２５２扬州大学硕±学位论文２２２．．实验方法６２２．２．２．１无标记纯系筛选２６２．．．２．２１１水稻植株叶片总ＤＮＡ的提取２６２．２．２丄２转基因植株纯系及去标记筛选２６２２７．２．２．２转基因植株抗性自然鉴定及统计２．２．２．２．１抗性自然鉴定２７２－．２．２．２．２发病情况调查及病株ＲＴＰＣＲ鉴定统计２８２Ｒ－ｔ．２．２３ｅａｌｉｍｅＰＣＲ分析２９

6、２．２．２．３．１水稻叶片总ＲＮＡ的提取２９２．２．２．３．２去除ＲＮＡ分离物中的基因组ＤＮＡ２９２．２ＮＡ２．２．３．Ｓ将Ｒ反转录成ｃＤＮＡ９一２．２．２．３．４第链ｃＤＮＡ的合成２９２２２ＰＣＲ．．．３．Ｓ特异性引物实时定量扩增３０２．２．２．４农艺性状调查３０２．３结果与分析３１２．３．１无选择标记转基因水稻的筛选３１２．３．２转基因植株抗性自然鉴定３３２．３．２．１自然鉴定田间发病情况调查３３ＲＴ－ＰＣ民鉴定２３．３．２．２自然鉴定病株的ｑ４２５．３．

7、３转基因植株的农艺性状调查３２．４小结与讨论巧２．４．１小结３７２．４．２讨论３７第Ｈ章感病植株的转录组差异表达分析４０１４０３．前言３４１．２材料与方法３．２．１实验材料４１３１．２．２实验方法４３．２．２．１总ＲＮＡ的提取４１３－．２．２．２病株的ＲＴＰＣＲ鉴定４２－３．２．２．３病株及其对照亲本的ＲＮＡｓｅｑ测序４２３．２．３．４数据处理与分析４２３．２３．．．４１去除杂质数据４３４２４４３．２．３．．测序数据与参考序列对比３．２．３．

8、４．３基因表达量统计４４卡±权抗黑条矮缩病转基因水賴新品系的鉴定和感病植株转录组分析３Ｓ．２．３．４．４差异表达基因（ＤＧＥｓ）的筛选４４３．