先天性心脏病标记物组关系模型的建立及其血清因子与易感基因关联的go功能解析

先天性心脏病标记物组关系模型的建立及其血清因子与易感基因关联的go功能解析

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时间:2019-03-15

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1、学校代码10459学号或申请号密级公开专业博士学位论文先天性心脏病标记物组关系模型的建立及其血清因子与易感基因关联的GO功能解析作者姓名:刘敏导师姓名:赵洛沙学科门类:医学专业学位名称:心血管内科培养院系:郑州大学第一附属医院完成时间:2015年5月Athesis(dissertation)submittedtoZhengzhouUniversityforthedegreeofMaster(doctor)Establishmentofcongenitalheartdiseasemarkersrelati

2、onalmodelandGOfunctionalanalysisoftheassociationbetweenitsserumfactorsandsusceptiblegenesByMinLIUSupervisor:Prof.LuoshaZHAOMajor:CardiovascularMedicineMay,2015学位论文原创性声明本人郑重声明:所呈交的学位论文,是本人在导师的指导下,独立进行研究所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外,本论文不包含任何其他个人或集体己经发表或撰写过的科研

3、成果。对本文的研究作出重要贡献的个人和集。体,均已在文中W明确方式标明本声明的法律责任由本人承担。学位论文作者;激曰期;〇1^^月i曰7学位论文使用授权声明本人在导师指导下完成的论文及相关的职务作品,知识产权归属郑州大学。根据郑州大学有关保留、使用学位论文的规定,同意学校保留或向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子版,允许论文被查阅和借阅;本人授权郑州大学可W将本学位论文的全部或部分编入有关数据库进行检索,可W采用影印、缩印或者其他复制手段保存论文和汇编本学位

4、论文。本人离校后发表、使用学一位论文或与该学位论文直接相关的学术论文或成果时,第署名单位仍然为郑州大学。保密论文在解密后应遵守此规定。学位论文作者;円期月円艰【巧t王中文摘要先天性心脏病标记物组关系模型的建立及其血清因子与易感基因关联的GO功能解析研究生:刘敏导师:赵洛沙郑州450052中文摘要研究背景:随着精准医学的提出和发展,个体化医疗模式的逐步建立,基因测序技术快速发展,临床大数据及生物学网络不断建立,通过跨学科协同完成的技术应用在疾病预测、诊断与疾病病因分析方面,被不断完善,

5、这些技术使实现对疾病和特定患者个体化精准治疗成为可能,也在提高疾病的预防中具有重要意义。先天性心脏病是目前最为常见的先天畸形,同时也是引起婴幼儿死亡的首要原因。在新生儿中发病率约为0.7%~1%,严重危害婴幼儿的健康。在心脏的发育过程中涉及到多种因素在时间和空间上的相互作用,而胚胎期遗传因素和环境因素共同作用导致心脏的发育异常。由于先天性心脏病遗传机制的复杂性,对如何导致心脏畸形的原因仍不清楚。先天性心脏病的种类复杂多样,给先天性心脏病的治疗和预防造成了极大的难题。临床研究表明血清学指标可以反映心功能状

6、态,临床检测指标主要有高敏C反应蛋白、脂蛋白a、心肌肌钙蛋白、钠尿肽等,心脏的异常可导致血清学标记物的水平异常变化,通过先天性心脏病相关血清标记物组的优化建模可以为先天性心脏病的病因分析、早期诊断和治疗提供理论依据。越来越多的研究表明先天性心脏病的发病机制和某些转录因子有关,而先天性心脏病的易感基因和血清学标记之间的关系目前尚未报道。而随着生物信息学的快速应用,GO(GeneOntology)已成为生物信息领域中一个重要的工具和方法。GO数据库是一个结构化的标准生物学模型,涵括了基因的细胞组分中文摘要(

7、cellularcomponent)、分子功能(molecularfunction)、生物学过程(biologicalprocess)。在基因功能注释方面,GO发挥着巨大的作用,GO可以分析基因或蛋白质在细胞中的位置、分子功能及其参与的生物学过程,从而将基因及其产物的注释简化为标准化的词汇。本研究拟采用Meta分析方法从近年来的国内外研究中筛选出先天性心脏病的易感基因及血清危险因素;基于临床血清标记物水平,利用Logistic回归及支持向量机两种方法建立先天性心脏病的标记物组关系模型;通过GO分析对先天

8、性心脏病易感基因及血清学标记物进行功能注释,建立易感基因及血清标记物之间的功能关系。本研究运用临床医学、Meta分析及生物信息学GO分析等多学科结合的研究方法,为寻找与疾病病因相关基因表达和血清标志物的相关性提供了理论依据。利用血清标志物等指标建立的标记物组关系模型,也可能为其他疾病的早期预测提供技术支持。该研究主要分为以下三个部分:第一部分先天性心脏病易感基因及临床研究血清危险因素的Meta分析目的:筛选先天性心脏病的易感基因及血清危险因

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