苎麻纤维细度关联分析

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1、论文编号:密级:中囯农业科学院学位论文苎麻纤维细度关联分析AssociationAnalysisofFiberFinenessinRamie硕士研究生：刘晨晨指导教师：陈建华研究员申请学位类别：农学硕士专业：作物种质资源学研究方向：鉴定评价与种质创新培养单位：中国农业科学院麻类研究所中国农业科学院研究生院提交日期2015年4月独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人己经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得中国农业科学院或其它教I机构的学位或证书而使用过的材料。与我

2、一同工作的同志对本研究所做的任何贝献均己在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名：4时间:2〇/石年令月q曰关于论文使用授权的声明本人完全了解中国农业科学院有关保留、使用学位论文的规疋，即：中^农业科学院有权保留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以米用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意中国农业科学院可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。研究生签名：时间：工咐年么月1日曰时间：年Y月中国农业科学院硕士学位论文评阅人、答辩委员会签名表论文题目苎麻纤维细度关联分析作物种质资鉴定评价与论文作者刘晨晨专业研究方向源学种质

3、创新培养单位（研究所)麻类研究所指导教师陈建华硕（博)姓名职称导师评硕导口博导口阅硕导口人博导口答辩主席硕导口生物化学与分陈信波教授湖南农业大学博导■子生物学硕导口作物栽培学与崔国贤教授湖南农业大学博导■耕作学硕导■中国农业科学院喻春明研究员作物遗传育种博导口麻类研究所答硕导■中国农业科学院龚友才研究员作物遗传育种博导口麻类研究所辩硕导■中国农业科学院刘头明副研究员作物遗传育种博导口麻类研究所委硕导口博导口员硕导口博导口硕导口博导口会议记录（秘书）黄思齐2015.5.26麻类研究所6楼会议室论文答辩时间地点Secrecy:No.ChineseAcademyofAgric

4、ulturalSciencesDissertationAssociationAnalysisofFiberFinenessinRamieM.S.Candidate：LiuChenchenAdvisor：Prof.ChenJianhuaMajor：CropGermplasmResourcesSpecialty：IdentificationandInnovationofGermplasmChineseAcademyofAgriculturalSciencesApril2015摘要本研究利用93对多态性SSR引物对104份苎麻核心种质进行全基因组多态性位点扫描，在其三季麻混合

5、样纤维细度得到精细测量的基础上，对苎麻的群体结构进行分析，同时利用关联分析的方法，获得了与纤维细度显著关联的位点，为今后筛选优良种质、基因定位和克隆以及分子标记辅助育种打下基础。主要结果如下：1.利用93对SSR引物在104份苎麻核心种质中扩增出255个位点，多态性很高，这104份核心种质遗传多样性丰富；2.根据基于遗传相似系数的UPGMA聚类法、PCA主坐标分析法和Structure软件的后验概率对数模型的群体结构分析法对群体分层分析发现，104个苎麻核心种质分为明显的两大类，而又可细分为6个亚类；3.试验共得到93个标记的4278个组合，当P<0.05时，348个位

6、点组合处于LD，占总位点2组合数的8.13%；当P<0.01时，仅102个位点处于LD，占总位点组合数的2.4%；按R的范围，22R>0.01的位点组合有2583个，占总位点组合数的60.4%；R>0.05的位点组合有127个，占总2位点组合数的3.0%；R>0.1的位点组合有11个，占总位点组合数的0.25%；4.本研究通过K=2和K=6的Q+K+MLM和PCA+K+MLM分析模型共同定位消除假阳性关联，在P<0.05的显著性水平，最终得到了RAM0298、b38和b64等3个与纤维细度显著相关的分子标记。并且3个关联标记对表型变异解释率都在5%以上，其中RAM029

7、8在3个分析模型中对表型变异解释率都达到了20%以上。关键词：苎麻，纤维细度，SSR，关联分析IAbstractInthisstudy,wescannedforwholegenomepolymorphismlociof104ramiecorecollectionbyusing93pairsofpolymorphicprimers,basedonthefinemeasurementoframiefiberfinenessinitscombinationofthreeseasonsoframie,onthebasisofanalysisofp