玉米穗部低氮响应可变剪接的鉴定

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5、物学基础培养单位：作物科学研究所中国农业科学院研究生院2015年11月Secrecy:No.ChineseAcademyofAgriculturalSciencesDissertationCharacterizationofAlternativeSplicinginResponsetoLow-nitrogeninMaizeEarsM.S.Candidate：YangHailongAdvisor：Prof.XieChuanxiaoMajor：CropGeneticsandBreedingSpecialty：BiologicalBasisforLow

6、-nitrogenToleranceinMaizeNovember2015摘要可变剪接是高等植物基因转录后表达调控的重要方式之一，在植物发育、逆境适应性等方面扮演着重要角色。目前，可变剪接响应低氮适应性的调节还未得到鉴定。因此，本研究以氮敏感自交系掖478和耐低氮自交系许178为材料，分别于授粉前后进行氮处理，对穗部进行RNA测序与可变剪接分析。通过对不同处理样本的可变剪接生物信息学分析，结论如下：1.内含子保留是玉米穗部可变剪接的主要类型。八种样品中，内含子保留事件所占的比例最高，约为50%-60%。玉米中基因发生内含子保留事件多为一到两次，发

7、生次数越高，所占的比例越少。2.授粉前低氮条件下，许178和掖478分别有20.83%、26.66%的低氮响应内含子保留基因。GO生物过程分类中分别有222、275个基因表现与氮代谢过程有关，196、272个基因表现与生物合成过程有关，146、186个基因与逆境响应有关，此外还有基因与蛋白修饰、形态建成、生殖发育过程有关。授粉后10天低氮条件下，许178和掖478分别有26.17%、25.44%的低氮响应内含子保留基因。GO生物过程分类中分别有255、240个基因表现与氮代谢过程有关，241、224个基因表现与生物合成过程有关，218、177个基

8、因与逆境响应有关，此外还有基因与碳水化合物代谢、蛋白修饰、氨基酸代谢、酯类代谢、转运、催化过程、信号转导、形态建成、胚胎发育、生殖发育过