丹参赤霉素合成与代谢相关基因家族的鉴定、分子克隆及表达分析

丹参赤霉素合成与代谢相关基因家族的鉴定、分子克隆及表达分析

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1、《碱如皆f化中刘《巧>博±研究生学位论文W北京协和医学院研究生院—中国輕学科学院约用牠物研究所2012级博±研究生杜淸丹參赤霉素合成与代谢相关基因家族的鉴定、分子克隆及表达分析学号;B2012009006学校代码;10023学号:博±学位论文丹参赤霉素合成与代谢相关基因家族的整定、分子克隆及表达分析Identi巧cationmolecularcloninandexressionanalsisofene,gpygfamiliesinvolvedinibberellinmetabolismin

2、Salviamilotiorrhizag所院:中閨跨学科学院巧用植物研究所.姓名:杜巧学号:B2012009006指导教师:卢善发研究巧导师小组:学科专业:生药学研究方向:药用巧物分乎生物学--完成日期:20155271中国臣学科学院药用植物研究所20口级博±研究生杜清丹参赤霉素合成与代谢相关基因家族的鉴定、学号分子克隆及表达分析;B20口009006独创性声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。论文中除了特别加W禄注和致谢的地方外,不包含其他人已经发表

3、或撰写过的研究成果,也不包含为获得其他教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名:签字日期:兴月日fT年(学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解北京协和医学院有关保存、使用学位论文的管理办法,。有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和磁盘允许论文被查阅和借阅。本人授权北京协和医学院可W将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可W采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。(保密的学位论文在解密后适用本授权书)

4、学位论文作巧签名;清导师签名:和寺签字日期:;年^月曰签字曰期年^月日学位论文作巧毕业后去向:工作单位:化话:通讯地址:邮编:2中国医学科学院药用植物研究所2012级博±研究生杜清、学号丹参赤霉素合成与代谢相关基因家族的鉴定分子克隆及表达分析:B2012Q09006摘要一赤霉素为种重要的植物生长激素,属于四环二荫类化合物,是稚类化合物生一MEP--(2C物合成途径的下游产物。赤霉素生物合成过程中,般先通过质体中-D--4-甲基赤菊糖醇磯酸)途径合成中间产物GGPP(極牛儿基化牛儿基焦磯酸),一再在系列

5、酶的催化下,形成不同种类的赤霉素。细胞质和线粒体中合成GGPP的MVA一(甲哲戊酸扣M过)途径在赤霉素生物合成过程中也有定作巧。本论文从丹参(/B-/m7化wibaunge)全基因姐数据库中鉴定了内根贝壳杉婦氣化酶(S/wKO)、贝壳-x)-杉巧酸氧化酶(&W必40)、赤霉素20氧化酶(SmG^20o、赤霉素3氧化酶-(疏G心OJC)和赤霉素2氧化酶(加G心OX)等参与赤霉素合成与代谢相关的基因,基于PCR技术对鉴定得到的基因进行了分子克隆,对cDNA和蛋白质的序列特性W及亚细胞定位进行了分析,构建了系统进化树,研究了它们在丹参根、茎、叶和花

6、等多组织中的表达,分析了古己焦磯酸合成酶口mC化)、内根壳杉猜合成酶-iSmKSL)、内根贝壳杉巧氧化酶(5>?1必或、巧壳杉巧酸氧化酶(&W心巧、赤霉素20-3-氧化酶2-氧化酶乂赤霉素(讯和赤霉素氧化酶(疏G如OX)等基困对外源赤霉素GA3处理的响应情况。另外,对丹参赤霉素生物合成途径上游基因/0/》(足//游/D/2)进行了克隆及转基因的初步分析。结果如下:(0基于丹参全基因组序列,通过同源比对,鉴定了1个讯嫩9、2个疏抑化6个加G420o;c、2个&WG430JC和n个疏G心OJC基因;采用PCR技术对所有鉴定出来的新基因进行了克

7、隆,获得全部22个基因的开放读码框序列(ORF)。(2)基于化物信息学分析了cDNA和推断的氨基酸序列的特征,结果表明22ORF长933--1557b之间538943之间个基因的度在p,理论等电点在..,推测的蛋白质长度在311和519氨基酸残基之间,偏酸、碱性氨基酸都有,分子量为34-.3657.73KDa。基于TargetP巧测了22个蛋白质的亚细胞定位,发现讯沁0、筑和奶沁402氨基酸序列的氮端含有分泌途径的信号化,可能定位于内质网;SmG心0x7和5>wG42ox5氨基酸序列的氮端含有叶绿体转运肋,可

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