厚荚相思器官发生途径microrna及其靶基因的鉴定与表达研究

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1、纖宅级ＵＤＣ农力ｄｉｓｓｅｒｔａｔｉｏｎ厚荚相思器官发生途径ｍｉｃｒｏＲＮＡ及其勒基因的鉴定与表达研究（中文题名）ＩｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎａｎｄＥｘｒｅｓｓｉｏｎｏｆＭｉｃｒｏＲＮＡｓａｎｄｔｈｅｉｒＴａｒｅｔｓｉｎｐｇＡｃａｃｉａｃｒａｓｓｉｃａｒｐａＯｒａｎｏｅｎｅｓｉｓｇｇ（英文题名）刘伟娜（作者姓名）胸日月教授指导教师捕＋申请学位级别！＾—＝微佩生物学＾学科专业名称—林木与微生物互作＾＾＾＾研究方向

2、２０１５论文提交日期＿２０１５￥６Ｈ论文答辩日期＿学位授予日期答辩委员会主席：评阅人：博士论文同意发表的声明研究生院：本人及导师完全同意《中国优秀博硕士学位论文全文数据库“”出版章程》（以下简称章程）及我校与中国学术期刊（光盘版）电子杂志社签定的《ＣＮＫＩ共建共享中国优秀博硕士学位论文全文数据库（ＣＤＭＤ）和北京林业大学研究生院博硕士学位论文全文数“”据库（ＤＭＤ）协议书》（以下简称协议书）的有关内容，愿意将本人的博士学位论文委托研究生院向中国学术期刊（光盘

3、版）电子杂志社的《中国优秀博硕士学位论文全文数据库》投稿。所在学科为：微生物学，论文题目为：厚荚相思器官发生途径ｍｉｃｒｏＲＮＡ及其ＩＥ基因的鉴定与表达研宄。希望《中国优秀博硕士学位论文全文数据库》给予出版，并同意在《中国博硕士学位论、文评价数据库》和ＣＮＫＩ系列数据库中使用，同意按章程和协议书规定孚受相关权益。？导师签名作者签名：州和：？／月ｙ曰永久联系地址（邮编）：永久联系电话：注：《中国优秀博硕士学位论文全文数据库出版章程》可从ｈｔｔｐ：／／ｇｒａｄｕａｔｅ，ｂｊ

4、ｆｕ．ｅｕｄ．ｃｎ中学位工作／学位论文栏目下浏览独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研宄成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人己经发表或撰写过的研宄成果，也不包含为获得北京林业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料一。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示了谢意。签名：如辦期：关于论文使用授权的说明、ｇ：本人完全了解北京林业大学有关保留使用学位论文的规定，卩学校有权保留送

5、交论文的复印件，允许论文被查阅和借阅学校可以公布论文的全部或部分内；容，可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文。（保密的论文在解密后应遵守此规定）签名，师签名？摘要一器官发生是植物无性繁殖和遗传转化的重要途径之，也是研究植物细胞全能性一、器官分化及形态建成的理想实验体系。这复杂而有序的过程受到了多种内外因素的影响，其中基因的表达调控是最重要和最根本的因素。迄今，植物器官发生的精确分子调控机制仍不甚明晰。植物ｍｉｃｒｏＲＮＡ是广泛分布于植物基因组中的长度约２２ｎｔ的内源非编

6、码小ＲＮＡ，在植物生长发育及细胞增殖与分化过程起着重要的调控作用。对重要生态经济树种ｍｉｃｒｏＲＮＡ的研宄，可在转录后水平解释更多的重要生命现象，达到有效调控或利用重要功能基因的目的。本研宄以豆科经济树种厚荚相思为研究材料，采用高通量测序与生物信息学分析结合的方法，鉴定参与其＇器官发生途径的ｍ－ｉｃｒｏＲＮＡ及祀基因，并应用基因芯片、ｑＲＴＰＣＲ和５ＲＡＣＥ技术对鉴定结果进行多方法的实验验证与分析ｒｏＲＮＡ及其紀基因。研究结果分析了ｍｉｃ在器官发生途径的不同发育阶段的表达，为豆科植物ｍｉｃｒｏ

7、ＲＮＡ研究提供重要的信息资源。本文的主要结果和结论如下：（１）应用高通量测序技术（Ｉｌｈｉｍｉｎａ）对厚荚相思器官发生途径的６个发育阶段组织构成的小ＲＮＡ文库进行测序，产生１０，３７８，６１５条原始序列；经过去除低质量序列ｔ３０ｎｔ，５９８７、接头序列、小于１５ｎ和大于的序列筛选后获得７，３１，条序列，比对到植物已知ｍｉｃｒｏＲＮＡ的序列数为３，０６２，６２８（２９．１５％），其中仅有３．３％能够进行保守与新ｍｉｃｒｏＲＮＡ鉴定，表明厚荚相思中还有很多ｍｉＲＮＡ有待发现。（２）基于ｍｉ

8、ｃｒｏＲＮＡ相似性序列和二级结构预测，运用生物信息学鉴定了厚荚相思保守ｍｉｃｒｏＲＮＡ１８９个，属于５７个ｍｉｃｒｏＲＮＡ家族；发现了７个新的ｍｃｏＲ，ｃｒｏ＊。ｉｒＮＡ其中２个检测具有ｍｉＲＮＡ序列（３）基因芯片表达分析结果显示２３个ｍｉｃｒｏＲＮＡ在厚荚相思器官发生旳不同发育阶段的显著性（Ｐ〈０．０１％，Ｆ