假单胞菌dll-e4中pnp基因簇lysr家族调控因子分析

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1、分类号９３９Ｑ学＾２０１３８１６１４４為奇，泉違乂磋硕壬学位论文＊，．．．假单胞菌Ｄ－Ｅ４ｎ基因簇Ｌｓ民ＩＸ中ｐｐｙ家族调控因子分析．．，苗．王，；．、？－－１．，＊＇？，’？指导教师崔中利教授．－－－专业名称生物工程研究方向环境微生物学与环境微生物工程答辩日期二０—五年六月？？．，Ｓ．■心：．；？—－■ＡＮＡＬＹ別ＳＯＦＬＹＳ民ＦＡＭＩＬＹＴＲＡＮＳＣＲＩＰＴＩＯＮＲＥＧＵＬＡＴＯＲＹＦＡＣＴＯＲＳ

2、ＯＦＰＮＰＧＥＮＥＣＬＵＳＴＥＲＩＮＰＳＥＵＤＯＭＯＮＡＳＰＵＴＩＤＡＤＬＬ－Ｅ４ＢｙＪｕｅＷａｎｇＳｕｐｅｒｖｉｓｅｄｂｙＰｒｏｆｅｓｓｏｒＺｈｏｎｇｌｉＣｕｉＡＤＩＳＳＥＲＴＡＴＩＯＮＳｕｂｍｉｔｅｄｔｏＮＡＮＪＩＮＧＡＧＲＩＣＵＬＴＵＲＡＬＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹＩＮＰＡＲＴＩＡＬＦＵＦＩＬＬＭＥＮＴＯＦＴＨＥＲＥＱＵＩＲＥＭＥＮＴＳｆｏｒＭＡＳＴＥＲＤＥＧＲＥＥＣｏｌｌｅｅｏｆＬｉｆｅＳｃｉｅｎｃｅｓｇＮａｎｉｎＡｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉ

3、ｖｅｒｓｉｔ，Ｎａｎｉｎ，２１００９５ｊｇｇｙｊｇＣｏｍｐｌｅｔｅｄｉｎＡｐｒｉｌ，２０１５ＣｏｍｍｅｎｃｅｍｅｎｔｉｎＪｕｎｅ２０１５，原创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研巧工作所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体己经发表或撰写过的作品成果。对本文的巧究做出重要贡献的个人和集体。本人完全意识到本声明的法律结果由本，均已在文中Ｗ明确方式标明人承担。■文日学位论文作者（需亲笔）签名；备：年６月学位论文版权使用

4、授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅。本人授权菌京农业大学可将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可Ｗ采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□，在年解密后适用本授权书。本学位论文属于不保密口。＿＿＂＂（请在上方框内打Ｖ）学位论文作者（需亲笔）签名；２＾／Ｊ年Ａ月心日导师（需亲笔）签名：年＾月＞日目录摘要Ｉ符号与缩略语说明Ｖ前ＢＶＩＩ篇

5、综述１一、对硝基苯龄的来源和危害１二、对硝基苯龄的基本处理方法２Ｈ、微生物代谢对硝基苯酪的研究进展２四、微生物降解对硝基苯酪代谢基因研究进展５五、ＬｙｓＲ家族转录调控蛋白６第二章转座子标签法筛选的调控因子１３１材料与方法１３１．１实验茜株及其培养条件１３１．２培养基与试剂１３２实验方法１４２１４．１转座子导入２．２质粒ＤＮＡ小量提取１４２１５．３ＰＣ民法验证突变子基因组中片断２．４转座子侧翼序列的克隆１６３结果分析１７３．１突变子初筛Ｗ

6、及初步ＰＣＲ验证１７３．２突变子中插入片段的再次验证１８’３．３转座子侧翼序列的克隆及序列分析１８４本章小结１９第Ｈ章ＯＲＦ＿３５６６对ＰＮＰ代谢基因簇调控分析２１一－第节：／：７Ｍ化沁ＤＬＬＥ４全基因组测序２３／１機２３１．１测序菌株２３１．２培养条件及抗生素２３１２３．３试剂及工具酶ｉ假单胞菌化心６４中ｐｗ基因簇ＬｙｓＲ家族调控因子分析２实验方法２３２－．１Ｐ．山ｉｄａＤＬＬＥ４降解性能验证２３Ｐ２．２基因组ＤＮＡ的提取２４２．３菌株基

7、因组测序２４２．４基因组数据处理和组装２５２ｔ－．５Ｐ．ｕｉｄａＤＬＬＥ４中ｐｎｐＡ的ＬＴＴＲ的分析２７ｐ３结果与分析２７－３１Ｐ．加ｄａＤＩＸＥ４对ＰＮＰ、ＨＱ．Ｐ降解性能检测２７ｕ－３．２Ｐ．ｔｉｄａＤＩＸＥ４测序样品质量检测２８ｐ３３Ｐ加ｄａＤＵＬ－．Ｅ４测序质量分析２９ＰＸ－３．４Ｐ．ｕｔｉｄａＤＩＥ４基因组可视化３０ｐ山－Ａ３．５Ｐ．ｉｄａＤＬＬＥ４ｎＬＴＴＲ的分３１Ｐ中ｐｐ的析４３２識第二节巧７＾４基因调控表达的研

8、究３３１．１菌株与质粒３３１．２培养基与试剂３３２实验与方法３４２．１ＯＲＦ３５６６的扩増和同源重组单交换插入失活３４＿２执沁ＤＩＸ－．２、ＯＲＦ