基于连锁不平衡的籼稻核心种质资源源、库相关性状的关联分析

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1、分类号!S51L22密级:公开UDC633.18?乂;餐读《令4轉女緣化從A基于连锁不平衡的釉稻核心种质资源源、库相关性状的关联分析赵宏亮指导教师姓名黎志康研究员串请学份级别博±专业名称作物学1论文提交日期2015.4.18论文答辩日m2015.6.3学位授予单位和日期沈阳农业大学2015年6月30日答辩委员会主席徐建龙研究员评阅人原名研究员匿名教授匿名教授暖名教授20巧年6月13日DissertationforDoctorates-AssociationAnalyis

2、onSourceSinkrelatedTraitsinIndicaRiceCoreGermplasmResourcesBasedonLinkaeDiseuil化riumgqCandidate:HonlianZhaoggSuervisor:Prof.ZhikanLipgSecialt:CroSciencepyp民esearchField:民iceGeneticBreedingCollee:AronomggyShe打anA^ricultumlUniversity呂gyJune2015,独创性声明本人

3、声明本论文是我个人在导师指导下完成的研究工作及取得的成果,。尽我所知除了文中特别标注和致谢提到之处外,本论文不包含其他人的研究成果和已经发表的文字表述,也不包含本人或他人为获得沈阳农业大学或其它教育化构的学位、证书等而使用过的材料一。本论文对与我同工作的同志为本研究所做的贡献均已做了说明并表达了诚挈的谢意。研究生签名:时间;y#/月导师签名:时间沁年《月方'护養关于论文知识产权和使用授权的说明本人完全了解沈阳农业大学有关俱留、使用本校毕业生学位论文的规定,即本论文知识产权单位为沈阳农业大学;沈阳农业大学有权保留本论文的纸质文本和电磁介质文本,有权

4、允许他人查阅和借阅本论文各种文本,有权采用影印、缩印或扫描等方式复制、保存、汇编本论文,有权W不同方式在媒体上发表、传播本学位论文的内容。(保密的学位论文在解密后遵守此协议)《研究生签名f;时间;W挺月伯导师签名:时间:W掉名月'巧絮目录摘要1Abstract5一第章文献综述91.1水箱源、库的研究进展9U.1水稻源、库的概念及衡量指标9丄2水宿源、库的衡量指标91丄3水稽源、库111类型划分U.4水稻源、库对产量形成的影响121丄5水稻源、库理论的应用141丄6水稻源、库理论研究展望1612.关联

5、分析171.2.1关联分析的原理171.2.2关联分析的方法201.2.3关联分析的特点21I.2.4关联分析在水稻中的应用221.3本研究的目的意义23241.4技术路线第二章拙稻种质资源源库相关性状的聚类分析252.1材料与方法252丄1供试材料252.1.2试验方法252丄3田间性状调查25I%I.4数据统计分析2.2结果与分析如2.2.1不同地点间水稻源库相关性状的差异分析262.226.2不同地点间水稻源库相关性状的相关分析2.2.3水稻源库相关性状的主成分分析302.2.4基

6、于主成分的水稻源库相关性状的综合评价332.2.5基于主成分的水稻源库特性聚类分析352.2.6不同源库类型干物质积累与分配特征402.3讨论4224.本章结论44第H章釉稻种质资源源库相关性状的全基因组关联分析473.1材料与方法473丄1供试材料473..12试验方法473丄3DNA提取与基因型分析473丄4表型鉴定473.2数据分析473.2.1表型数据统计分祈473.47.22遗传多样性分析13.2.3辭体结构分析473.2.4亲缘关系(Kinship)分析483.2.

7、5关联分析4843.3结果与分析83.3.1SNP遗传多样性分析483.3.2群体结构分析4931.3.3连锁不平衡分析53.3.4亲缘关系分析523.4M论773.4.1关联分析模型选择773.4.2关联分析显著水平的选择783.4.3水稻群体结构对关联分析的影响7843..4水稻群体连锁不平衡水平对关联分析的影响793.4.5环境变化对数量性状的影响79

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