以籼稻桂朝2号为遗传背景的粳稻越光全基因组染色体片段置换系的构建

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1、THEDEVELoPMENToFKoshihikari(JAPoNICA)WHoLEGENoMECHRoMoSMOESEGMENTSUBSTITUTIONLINESWITHGENETICBACKGROUNDOFGuichao2(INDICA)ByWeiCongAThesisSubmittedto．NanjingAgriculturalUniversityInPartialFulfillmentoftheRequirementsForTheMasterDegreeSupervisedByXuDayongNanjingAg

2、riculturalUniversityNanjing210095，P．R．ChinaApril，2013删岬明＼删本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均己在文中以明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文俐需黼硌乖萄一、7矽I＼年夕学位论文版权使用授权书，1b具t>B本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意

3、学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅。本人授权南京农业大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编学位论文。保密口，在!年解密后适用本授权书。本学位论文属于不保密口。(请在以上方框内打“寸’)糊姗c僦嵫：争穗易州月多日导师(需亲笔)签名：气么、久移冽年名月／；日／目录摘要ABSTRACT⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯III第一章文献综述⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

4、⋯⋯⋯⋯⋯．11．染色体片段置换系的概述⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯21．1染色体片段置换系的提出⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯2’1．2染色体片段置换系的概念⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯31．3染色体片段置换系的种类⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯41．3．1以染色体为单位的置换系⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯41．3．2以QTL为单位的置换系⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．41．3．3以全基因组为单位的置换系⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

5、⋯41．4染色体片段置换系的构建方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯52．染色体片段置换系的利用价值⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯62．1利用染色体片段置换系对QTL的检测和初步定位⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．62．2利用染色体片段置换系对QTL的精细定位⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．62．3利用染色体片段置换系研究QTL之间的互作⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一72．4利用染色体片段置换系研究QTL的生理调节作用⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．72．5染色体片段置换系在育种中的应用⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯83

6、．本研究的目的和意义⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯9第二章以籼稻桂朝2号为遗传背景的粳稻越光全基因组染色体片段置换系的构建⋯111．材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．儿1．1实验材料⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．111．1_1SSR标记在基因组的分布频率⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一111．1．2SSR分子标记连锁图⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．12I．1．3BC2F1世代背景的混池验证结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

7、⋯⋯l21．2实验方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．141．2．1DNA样品的制备⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯141．2．2SSR分析程序⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．141．2．3PCR扩增及PAGE胶电泳(见附录)⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．141。2。4遗传背景回复速率的计算⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．141．2．5供体基因导入频率的计算⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．141．3SSR分子标记辅助选择和用于回交的单株确定方法

8、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．152．结果与分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．152．1SSR分子标记的确定⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．152．2越光／桂朝2号染色体片段置换系BC6F】的构建过程⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．16以籼稻桂朝2号为遗传背景的粳稻越光全基因组染色体片段置换系的构建2．2．