ncbi网站blast使用方法介绍

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1、BLASTBasicLocalAlignmentSearchToolLushanWang2010.11.24生物信息的获取方式1、以生物学信息为主检索数据——Entrez2、以序列为主检索相关信息——BLAST生物信息学时代BLAST相当于分子生物学进代的“PCR”技术DNAPolymeraseReplication传统分子技术必然会让位于BLAST为主的生物信息技术Sanger’sddNTPSequencingWhatdoesthissequencemean?限制酶目标基因重组基因细胞转化宿主菌蛋白质分离

2、纯化及性质测定传统分子生物学方法现代生物信息学方法BLASTGenefamilyOrProteinFamilyFunctionannotation几周的时间几分钟的时间BLASTwww.ncbi.nlm.nih.govWebAccessBLASTVASTEntrezTextSequenceStructureWangLS,GaoPJ,cellulase,etal.Bioinfomaticsdatabaseblast.ncbi.nlm.nih.govENTERSequencesHereHumangenomest

3、atisticsTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCCTAACCCTAACCCTA

4、AACCCTAAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCCAACCCCAACCCCAACCCCAACCCCAACCCCAACCCTAACCCCTAACCCTAACCCTAACCCTACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCCTAACCCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTCGCGGTACCCTCAGCCGGCCCGCCCGCCCGGGTCTG

5、ACCTGAGGAGAACTGTGCTCCGCCTTCAGAGTACCACCGAAATCTGTGCAGAGGACAACGCAGCTCCGCCCTCGCGGTGCTCTCCGGGTCTGTGCTGAGGAGAACGCAACTCCGCCGGCGCAGGCGCAGAGAGGCGCGCCGCGCCGGCGCAGGCGCAGACACATGCTAGCGCGTCGGGGTGGAGGCGTGGCGCAGGCGCAGAGAGGCGCGCCGCGCCGGCGCAGGCGCAGAGACACATGCTACCGCGTCCAGGGGT

6、GGAGGCGTGGCGCAGGCGCAGAGAGGCGCACCGCGCCGGCGCAGGCGCAGAGACACATGCTAGCGCGTCCAGGGGTGGAGGCGTGGCGCAGGCGCAGAGACGCAAGCCTACGGGCGGGGGTTGGGGGGGCGTGTGTTGCAGGAGCAAAGTCGCACGGCGCCGGGCTGGGGCGGGGGGAGGGTGGCGCCGTGCACGCGCAGAAACTCACGTCACGGTGGCGCGGCGCAGAGACGGGTAGAACCTCAGTAATCCGAAA

7、AGCCGGGATCGACCGCCCCTTGCTTGCAGCCGGGCACTACAGGACCCGCTTGCTCACGGTGCTGTGCCAGGGCGCCCCCTGCTGGCGACTAGGGCAACTGCAGGGCTCTCTTGCTTAGAGTGGTGGCCAGCGCCCCCTGCTGGCGCCGGGGCACTGCAGGGCCCTCTTGCTTACTGTATAGTGGTGGCACGCCGCCTGCTGGCAGCTAGGGACATTGCAGGGTCCTCTTGCTCAAGGTGTAGTGGCAGCACGCCCA

8、CCTGCTGGCAGCTGGGGACACTGCCGGGCCCTCTTGCTCCAACAGTACTGGCGGATTATAGGGAAACACCCGGAGCATATGCTGTTTGGTCTCAGTAGACTCCTAAATATGGGATTCCTGGGTTTAAAAGTAAAAAATAAATATGTTTAATTTGTGAACTGATTACCATCAGAATTGTACTGTTCTGTATCCCACCAGCAATGTCTAG