酸性氨基酸与铀酰离子作用体系计算研究

《酸性氨基酸与铀酰离子作用体系计算研究》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、答辩委员会主席：盈1主亚麴重答辩委员会成员：遗塑塑丝叠垫耋重塑童咀选瞳趁重温州I医学院硕士学位论文lUltlllllllUUllllttllltlllllUtY2397359目录中文摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一3Abstract．⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯．．．．．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．5第一章引言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯5第二章理论方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一112．1密度泛函理论简介⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．112．2量子化学基组简介⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

2、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯192．3溶剂化模型⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯202．4本文计算方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯20第三章天冬氨酸构象蜕变计算研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一213．1前言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯213．2计算方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯213．3结果与讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯223．4结论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯39第四章谷氨酸构象蜕变计算研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一414．1前言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

3、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯414．2计算方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯4l4．3结果与讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．424．4结j仓⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯57第五章天冬氨酸与铀酰离子作用体系计算研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．585．1前言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯585．2计算方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯59温州医学院硕士学位论文5．3结果与讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．605．4结论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

4、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯66第六章谷氨酸与铀酰离子作用体系计算研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．686．1前言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯686．2计算方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯696．3结果与讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯696．4结j仑⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯78j}{}论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．79参考文献⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．81附录⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

5、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯86硕士期间发表论文⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．96致谢⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．97鸯紊虫邑⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．982温州医学院硕士学位论文酸性氨基酸与铀酰离子作用体系计算研究中文摘要本文采用密度泛函理论(DFT)研究了天冬氨酸和谷氨酸中性分子、两性离子及阴离子在气相和水中稳定存在的构象，进一步系统地探索了酸性氨基酸(天冬氨酸、谷氨酸)与铀酰离子作用体系的几何结构、电子结构、热力学稳定·

6、乍及谱学特征，在理论上研究了酸性氨基酸与

7、铀酰离子相互作用，为’实验研究或解释提供理论基础。1、用B3LYP／6—31l++G(2d,动方法研究天冬氨酸14种中一阡分f构象n，计川，的几何结构、电子结构和能量学特征等性质。14种构象中有3种类型的分rf内氯键，N-H⋯O=C、N-H⋯OH、O—H⋯NH，其Do．H⋯NH氧键最强。而水相中的14种天冬氨酸中性分子构象存在情况较复杂。对气相中的28}中Asp’构象进行计算，结果得到17种稳定构象，而水相中获得了15种稳定构象。对气相中Asp2。进行结构优化后，得到3种稳定构象。天冬氨酸两性离子在气相和水相中的构象经结构全优化后，气相中无两性离子形态存在

8、，而在水中蜕变成13种两性离子态。2、用B3LYP／6—31l++G(2矗p)方法研究谷氨酸15种中性分子构象在气相中的几何结构、振动光谱和能量学特征等性质。谷氨酸的氨基和羧基间形成了强弱不同的3种氢键，N．H⋯O=C、N．H⋯OH、O．H⋯NH。30种Glu’构象经结构优化后，最终获得221中Glu‘构象。谷氨酸二价阴离子中氨基的两个质子同时分别与a．和日一羧酸根中的氧形成了不同强度的N．H⋯O=C氢键。计算结果表明，30种Glu两-t't-离子构象在气相中无两性离子态存在。Glu('ti溶液·}】的‘陀质，f，7e念⋯们比，尤论是几何构型、电子结构还是

9、其稳定性和光鸸性质都发牛r小川利度的变化。3、用B3LYP法对天冬