二烯丙基二硫抑制人胃低分化腺癌增殖的转录组学研究

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1、分类号密级UDC编号硕士学位论文二烯丙基二硫抑制人胃低分化腺癌增殖的转录组学研究研究生姓名：唐仪指导教师姓名、职称：苏琦教授学科、专业名称：病理学与病理生理学研究方向：胃癌发生与防治的分子机制2013年4月南华大学学位论文原创性声明本人声明，所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了论文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得南华大学或其他单位的学位或证书而使用过的材料。与我共同工作的同志对本研究所作的贡献均已在论文中作了明确的说明。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承

2、担。作者签名：年月日南华大学学位论文版权使用授权书本学位论文是本人在南华大学攻读硕（博/硕）士学位期间在导师指导下完成的学位论文。本论文的研究成果归南华大学所有，本论文的研究内容不得以其它单位的名义发表。本人同意南华大学有关保留、使用学位论文的规定，即：学校有权保留学位论文，允许学位论文被查阅和借阅；学校可以公布学位论文的全部或部分内容，可以采用复印、缩印或其它手段保留学位论文；学校可根据国家或湖南省有关部门规定送交学位论文。同意学校将论文加入《中国优秀博硕士学位论文全文数据库》，并按《中国优秀博硕士学位论文全文数据库出版章程》规定享受相关权益。同意授权中国

3、科学信息技术研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》，并通过网络向社会公众提供信息服务。对于涉密的学位论文，解密后适用该授权。作者签名：导师签名：年月日年月日本研究基金资助项目1.湖南省自然科学基金重点项目No07JJ30332.湖南省科技厅科技计划No2008SK30103.湖南省高校创新平台开放基金No09K0744.湖南省教育厅科学研究重点项目No09A0775.湖南省重点学科建设项目基金资助No2006-180目录中文摘要………………………………………………………………..1英文摘要………………………………………………………………...5前

4、言……………………………………………………………………...9材料与方法…………………………………………….………………..11结果…………………………………………………………….………23讨论………………………………………………………….…………88结论………………………………………………………….…………103参考文献…………………………………………………….…………104附录………………………………………………………….…………114综述………………………………………………………….…………120硕士期间撰写的论文………………………………………….……

5、…128主要英文缩略语索引………………………………………….………129致谢………………………………………………………….………130二烯丙基二硫抑制人胃低分化腺癌增殖的转录组学研究硕士研究生：唐仪导师：苏琦教授中文摘要目的：二烯丙基二硫(diallyldisulfide,DADS)可以抑制多种肿瘤细胞增殖，但具体作用机制尚未完全阐明。本研究旨在构建DADS处理胃癌MGC803细胞差异表达基因表达谱、差异转录因子活性谱、差异microRNA，研究DADS抑制人胃癌MGC803细胞增殖的分子机制。方法：通过人全基因组寡核苷酸微阵列芯片、转录因子活性谱芯片、mi

6、croRNA芯片检测DADS作用于MGC803细胞后差异基因的表达谱；Real-timePCR验证MMP9、TIMP3，Real-timePCR验证miR-222、miR-665。结果：1．系统构建了DADS处理胃癌MGC803细胞差异基因表达谱，表达相差1.5倍以上为差异具有显著性。与对照组相比，处理组上调基因1293个（>2.0基因384个），下调基因1228个（>2.0基因202个）。利用dchip软件以ttest，P<0.001水平筛选数据。结果显示，处理组MGC803细胞和未处理组明确表达2521个基因，其中，292个在处理组中明确表达，而未处理组

7、表达下调，116个在未处理组明确表达，而处理组表达下调。HierarchicalClustering分析显示，处理组和未处理组在全基因表达谱上存在明显差异。差异表达基因能够区分处理组和未处理组。通过Real-timePCR证实了MMP9和TIMP3基因在处理前后的表达情况，提示这两个基因可能是DADS抑制胃癌侵袭转移的分子标记。2．差异表达基因的功能分类，通过多种生物信息学软件对基因芯片数据基因综合分析，系统评价了差异表达基因的功能分类。Panther软件分析发现上调基因共参与152条pathway，61条pathway的实际参1与基因数量超过预期基因值，而

8、“Angiogenesis”、“Integrinsi