溃疡性结肠炎患者中药治疗前后肠道菌群与粪便提取液生物活性的变化

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1、上海交通大学硕士学位论文上海交通大学2015届硕士学位论文溃疡性结肠炎患者中药治疗前后肠道菌群与粪便提取液生物活性的变化姓名：李学明学号：1120809006系所：生命科学技术学院专业：生物学研究方向：微生物分子生态学学习年限：2012.9～2015.3学位级别：理学硕士指导老师：庞小燕副教授二零一五年二月1/108万方数据上海交通大学硕士学位论文2/108万方数据上海交通大学硕士学位论文ThesisforMasterDegree,ShanghaiJiaoTongUniversity,2015COMPARISONOFGUTMICROB

2、IOTAANDFECALWATERBIOLOGICALACTIVITIESOFUCPATIENTSBEFOREANDAFTERTRADITIONALCHINESEHERBSTREATMENTPostgraduate:XuemingLiSupervisor:XiaoyanPangMajor:BiologyResearchDirection:MolecularmicrobialecologyAcademicDegreeAppliedfor:MasterofScienceCollege:LifeSciencesandBiotechnolog

3、yThesisperiod:2012.9～2015.3Feb.20153/108万方数据上海交通大学硕士学位论文4/108万方数据上海交通大学硕士学位论文上海交通大学学位论文原创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名：日期：年月日5/108万方数据上海交通大学硕士学位论文6/10

4、8万方数据上海交通大学硕士学位论文上海交通大学学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅。本人授权上海交通大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□，在年解密后适用本授权书。本学位论文属于不保密□。（请在以上方框内打“√”）学位论文作者签名：指导教师签名：日期：年月日日期：年月日7/108万方数据上海交通大学硕士学位论文8/108万方数据上海

5、交通大学硕士学位论文溃疡性结肠炎患者中药治疗前后肠道菌群及粪便提取液生物活性的变化摘要炎症性肠病（InflammatoryBowelDisease）包括溃疡性结肠炎（UlcerativeColitis，UC）与克罗恩病（Crohn’sDisease，CD）。其中，UC的发病率高于CD的发病率，占IBD的主要部分。在中国，UC的发病率正处在于上升阶段，若不加以防治，UC可能会成为一种流行性疾病。UC的发生与发展受到遗传与环境等多方面的影响。多项研究表明UC患者的肠道菌群结构与健康人的菌群结构显著不同，并且发现多种与人体共生的微生物可能与

6、UC的发病有关。本研究重点解析UC患者治疗前后肠道菌群的变化，以及UC患者肠道菌群与健康人肠道菌群的差异。我们与南京市中医院合作，共招募46例UC患者作为研究的志愿者，采用中药气药灌肠法进行为期2-4周治疗，采集治疗前和治疗后（出院前）两个时间点的粪便样品以及血液样品。通过临床统计分析，患者经过治疗，其C反应蛋白、血沉以及便次均由病态恢复到正常水平。采用国际上常用的评价UC疾病状态的指数Rachmilewitz临床指数与SeoScore，表明患者经过治疗后病情得到了显著缓解。我们采用16SrRNA基因V1-V3区454焦磷酸测序的方法

7、，对UC患者的肠道菌群进行研究，利用QIIME等分析测序结果。我们从实验室样品库中选取了52位与UC患者年龄和性别大致匹配的健康人粪便样本，作为UC肠道菌群分析的对照。Alpha与Beta多样性分析显示，UC患者经过2-4周的治疗肠道菌群多样性以及结构没有发生显著变化，但与健康人存在显著差异。通过LEfSe，RDA等方法分析发现，健康人粪便中存在较多的短链脂肪酸产生菌（如Alistipes，Bacteroides,ClostridiumVIa等），而UC患者中则存在较多的机会性致病菌（如内毒素产生菌Escherichia/Shigel

8、la,Salmonella,Streptococcus等）。由于短链脂肪9/108万方数据上海交通大学硕士学位论文酸（以丁酸为主）是肠道上皮细胞的主要的营养物质，因此短链脂肪酸产生菌的减少可能与UC、大肠癌等的发生发展有