青海棘球绦虫mtdna coi和ndi基因多态性分析

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1、分类号:密级:UDC:编号:2013100906010822010级攻读硕士学位研究生毕业论文青海棘球绦虫mtDNACOI和NDI基因多态性分析PolymorphicanalysisofCOIGeneandNDIGeneofmitochondrialDNAofEchinococcusspp.inQinghaiprovince指导教师:李伟研究员申请人姓名:冯凯学科专业名称:基础兽医学研究方向:高原畜禽生理学学院(系、部):农牧学院二零一三年六月QinghaiUniversityMasterDissertationPolymorphi

2、canalysisofCO1GeneandND1GeneofmitochondrialDNAofEchinococcusspp.inQinghaiprovinceSupervisor:LiWeiResearcherCandidate:FengKaiAcademicMajor:BasicVeterinaryScienceSpecificMajor:PlateauanimalphysiologyCollege(Department):CollegeofagricultureandanimalhusbandryJune,2013青海大学硕

3、士学位论文摘要I青海大学硕士学位论文摘要独创性声明本人声明所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知,除文中已经标明引用的内容外,本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果。对本文的研究做出贡献的个人和集体,均已在文中以明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名:日期:年月日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,即:学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版,允许论文被查阅和借阅。本人授权青海大学可以

4、将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。本论文属于:保密□不保密□(请在相应方框内打“√”),在_____年解密后适用本授权书。II青海大学硕士学位论文摘要学位论文作者签名:指导教师签名:日期:年月日日期:年月III青海大学硕士学位论文摘要摘要为进一步掌握青海省流行的棘球绦虫线粒体DNACO1基因和ND1基因的遗传差异性,明确棘球绦虫在青海省主要终末宿主的感染流行状况。本文以采集的棘球绦虫(Echinococcus)成虫为研究对象,分别PCR扩增棘球绦虫线粒体DNA

5、CO1基因片段和ND1基因片段,直接测序进行基因多态性分析,旨在获取相应的遗传学差异信息。本研究在青海省共搜集得感染野生狐狸和藏犬的棘球绦虫分离株22株,经PCR扩增和DNA测序,从22个棘球绦虫分离株中均扩增获得363bp的mtDNACOI基因片段。该基因片段的聚类分析表明,在22个棘球绦虫分离株中,10株分离株为细粒棘球绦虫G1型(EchinococcusgranulosusI,E.granulosusG1),8株为多房棘球绦虫(Echinococcusmultilocularis,E.m),4株为石渠棘球绦虫(Echinoco

6、ccusshiquicus,E.s)。10株多房棘球绦虫株间同源性为99.2%~100%;8株多房棘球绦虫株间同源性为98.7%~100%;4株石渠棘球绦虫株间同源性为99.2%~99.8%。E.granulosusG1型与E.m型株间同源性为86.8%~89.2%,E.granulosusG1型与E.s型株间同源性为88.3%~89.5%,E.s型与E.m型株间同源性为88.1%~90.1%。E.granulosusG1型有6个不同的核苷酸序列,发现5个位点核苷酸发生碱基置换,约占分析位点总数的1.38%,基因序列间差异值在0%~

7、0.8%之间;E.m型,有4个不同的基因序列,发现5个位点核苷酸发生碱基置换,约占分析位点总数的1.38%,基因序列间列差异值在0%~1.3%之间;E.s型,有4个不同的基因序列,存在的6个核苷酸序列碱基置换位点,约占分析位点总数的1.65%,基因序列间列差异值在0.2%~0.8%之间。种内变异率小于1.3%,种间变异率大于9.9%。经PCR扩增和DNA测序,从22个棘球绦虫分离株中扩增获得507bp的mtDNAND1基因片段。该基因片段序列的聚类分析,与CO1基因片段的聚类IV青海大学硕士学位论文摘要分析获得了一致的结果。E.gr

8、anulosusG1型,有5个不同的核苷酸序列,发现10个碱基置换位点,约占分析位点总数的1.97%,基因序列间差异值在0%~1.0%之间;E.multilocularis型,存在4个不同的基因序列,共8个碱基置换位点,约占分析位点总

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