发展分子指纹及在水稻育种中的应用

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1、扬州大学硕士学位论文基于反转座子发展分子指纹及在水稻育种中的应用姓名：冯彦侠申请学位级别：硕士专业：遗传学指导教师：陈建民20100501冯彦侠：基于反转座子分子指纹及在杂交水稻中的应用基于反转座子发展分子指纹及在水稻育种中的应用研究生：冯彦侠导师：陈建民教授(扬州大学，江苏扬州，225009)摘要水稻杂种优势的利用是提高水稻产量的有效途径，但是目前由于选用的杂交亲本的遗传关系较近，育成的新品种的产量没有较大的突破。分子标记辅助育种可以更有效地利用资源的遗传多样性，在分子水平上更精确地进行选择，从而培育出更高产的杂交水稻品种。本研究利用基于反转座子的分子标记技术对三组水

2、稻品种进行品种鉴定与杂种优势的预测。研究结果如下：1、籼稻和粳稻亚种间的DNA序列的差异性利用6对引物对12份供试水稻材料进行PCR扩增，共扩增出173个条带，97个是多态性带，多态性水平56。1％；其中籼稻的多态性为32．1％，高于粳稻的多态性(24．3％)。根据遗传距离进行聚类，可以清楚地把籼粳分为两大类，并且籼稻差异性高于粳稻。这说明利用基于反转座子发展的分子标记能够准确地鉴定籼粳稻亚种间及品种间的的遗传差异。2、水稻杂种优势的预测利用5对引物对8个水稻亲本(4个母本和4个父本)以及由它们组配的12个杂交种进行分子指纹图谱数据分析，结果说明基于反转座子发展的分子标

3、记能很好地把这20份水稻材料区分开来。利用类平均聚类法(UmMa)进行聚类分析，并对聚类后的遗传距离与产量相关的各农艺性状的关系进行分析，结果表明随着遗传距离的增大杂种优势越明显。各农艺性状的杂种表现和配合力方差分析表明，绝大多数性状的一般配合力方差大于特殊配合力方差，表明各性状在杂交组合的遗传效应中以加性基因效应为主；另外，超亲优势较高的组合中至少有一个亲本的一般配合力较高，说明亲本的遗传因素对子代表型有很大影响。遗传距离与各性状的回归相关关系表明，遗传距离与各性状之间大都呈正相关，但其决定系数并不高。3、偏籼偏粳稻的鉴定利用5对引物对53份偏籼偏粳水稻材料进行多态性

4、分析，平均多态性56．5％，说明偏籼偏粳间存在较大的遗传多样性。聚类分析可将偏籼和偏粳分为明显的两大类，并且由相同亲本组配的杂交后代的亲缘关系更近，说明利用基于反转座子的分子指纹不仅可以区分出偏籼偏粳材料间的差异，而且可以显示出材料的遗传特征。扬州大学硕士学位论文关键词：反转座子；分子指纹；水稻；杂种优势；冯彦侠：基于反转座子分子指纹及在杂交水稻中的应用DevelopmentofMolecularFingerprintsBasedonRetrotransposonandApplicationsinRiceBreedingPostgraduate：YanxiaFengAd

5、visor：Prof．JianminChen(VangzhouUnviersity，Jiangsu,225009)ABSTRACTTheutilityofheterosisisaneffieientwaytoimproveyieldinrice．Atpresent,thecurrentresultoftheselectionofhybridparentsaletheclosekinshipSOtheproductionofnewvarietiesbredhavenomajorbreakthroughinyield．Themolecularmarkerassistedbr

6、eedingisallefficientwayformakingfullUSeofgeneticdiversity,freeseletionatmolecularlevel，whichleadsdevelopricehybridsforriceproductionandpeaple’Sdemands．Inthisstudy,speciesidentificationandpredictionofheterosisaboutthreegroupsofricebyretrotransposon-basedmolecularmarl@=rtechniques．Theresul

7、tswereasfollows：1．SubspeciesdifferencesinDNAsequencesbetweenIndicaandjaponicaAtotalof173bandswereamplifiedby6primersinthePCRanalysiswith12indicaandjaponica,ofwhich97arepolymorphic，polymo印hismlevelis56．1％；Polymorphismofindicarice32．1％，higherthanthepolymo巾hismofjaponicarice