偏分离分子标记的作图方法

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1、维普资讯http://www.cqvip.com遗传HEREDITAS(Beijing)26(3)：356～358，2004技术与方法偏分离分子标记的作图方法谭军，薛庆中(浙江大学农业与生物技术学院农学系，杭州310029)摘要：对取自MAPMAKER软件小鼠F群体(含333个体)的5个RFLP连锁标记数据作了共显性分子标记偏分离的分析。先确定选择类型的方程组(配子或合子)，随后采用Newton—Raphson迭代法估算标记间的重组值。在构建分子标记遗传图谱时，如果两个相邻标记均存在偏分离，最好采用纳入偏分离因子

2、的估算方法。在估计F?群体标记间偏分离重组距离上，用连续!检测方法比传统检测更为准确。关键词：分子标记；遗传作图；偏分离中图分类号：Q343．17文献标识码：A文章编号：0253—9772(2004)03—0356—05MappingbyMolecularMarkersShowingSegregationDistortionTANJun，XUEQing—Zhong(DepartmentoJAgronomy，CollegeofAgrhultureandl~iotechnology，Zh~iangUniversity

3、，Hangzhou310029·China)Abstract：ThecomparativeanalysisofsegregationdistortionsofthecodominantmarkersdatapresentedinsoftwareMAPMAKERaremade。wherefiveRFIPsmarkersinvolveinamouseF2populationwith333individuals．Thesue—cessivetestbeginswiththedeterminationsofgametic

4、orzygoticselectiontypes。followedbytheestimationofre—combinationfractionsbetweentwomarkerswiththeNewton—Raphsoniterationmethod．ItisbettertOusethemo—lecularmarkershowingsegregationdistortionforconstructingageneticmap，inthecaseofseriouslyskewsegrega—tionbetweenb

5、oththeadjoiningmarkers．ThesuccessivetestprovidesbetteraccuracythanthatofclassicaltestfortheestimationoftherecombinationvaluesinF2populationwithsegregationdistortion．Keywords：molecularmarker；geneticmapping；segregationdistortion24．5]构建遗传图谱时，通常采用经典的最大似然法。导致偏分离的部

6、分原因与配子或合子形估算标记问的遗传距离。该算法的前提是符合孟德成过程中所受到的选择有关，从而会对连锁分析产尔遗传规律，标记不存在偏分离。然而，杂种后代群生严重影响口、。因此，探讨偏分离分子标记的作体中分子标记偏分离现象已有报道。例如：在栽培图方法已受到重视引。大豆与半野生大豆杂交F代重组自交系中，对238本文以5个有连锁关系的RFLP标记．探讨小个分子标记分析，29．4的位点出现偏向母本的趋鼠F群体不同标记基因型频率和基因频率及其在势一。玉米杂交组合(综3×87—1)F2群体中，有49受各种类型选择下偏离预期频

7、率的特点。比较不同个分子标记表现偏分离，占总标记数的28．2。在x。检测算法判别配子选择与合子选择的强度，试图偏分离标记中偏向父本占22．5；偏向母本占提出一个偏分离分子标记的作图方法。收稿日期：20030321；修回日期：2003—11—16基金项目：国家863计划(10101—01—01—3)，浙江省重点科研项目(2003C22007)[TheresearchwassponsoredbyNational“863”Project(1010101—0卜3)．andKeyProjectinZh~iangProvin

8、ce(2003C22o07)]作者简介：谭军(1972)，男．重庆市人，博士研究生，研究方向：遗传图谱构建通讯作者：薛庆中．教授．博士生导师。专业：植物生物技术，基因组学。E—mail：qzhxue@hotmail．corn维普资讯http://www.cqvip.com3期谭军等：偏分离分子标记的作图方法(5)1选择类型的确定通过随机交配产生的基因型比例：P!：2pq：