基于cdna-aflp技术分析半膜覆盖下玉米大喇叭口期基因差异表达

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1、基于cDNA-AFLP技术分析半膜覆盖下玉米大喇叭口期基因差异表达高海荣李倩王玉芬郭九峰马梦宇李玉东白岚内蒙古大学生命科学学院内蒙古大学物理科学与技术学院离子束生物工程重点实验室摘要：为了探讨半膜覆盖调控玉米生长的差异表达基因及分子机制，以'浚单29'为材料，露地栽培作为对照，与半膜覆盖间隔种植，利用cDNA-AFLP技术，采用90对单引物筛选半膜覆盖下差异表达基因，并进行生物信息学分析。结果表明,利用90对单引物组合共扩增出2298条差界片段，其中上调表达的有1429条,占总条带数的45%;下调

2、表达的有869条，占总条带数的23.7%;无差异表达的有877条，占总条带数的27.6%。选择重复扩增稳定的20条差异片段进行回收测序,经过Blast数据库对比和基因注释分析，再将所得的15条差异片段按功能分为细胞骨架相关基因(13.3%)、能量代谢相关基因(13.3%)、细胞挽救和防御相关基因(6.7%)、转录过程相关基因(40%)、胞内转运相关基因(6.7%)和未知功能基因(20%)6大类。分析其中一些重要的基因，如RPM1在逆境抗性中起作用，MYM锌指蛋白、BCAS2蛋白和ETF3B翻译起始

3、因子都与调控转录翻译相关。通过cDNA-AFLP技术筛选了多个半膜覆盖下差异表达的基因，为揭示半膜覆盖影响玉米生长发育的分子机制提供了基础资料。关键词：玉米;栽培方式;半膜覆盖;cDM-AFLP;差异表达;作者简介：高海荣(1991一)，男，硕士研究生;研究方向：作物栽培生理。作者简介：王玉芬，E-mail:fcnwy300@163.com。收稿日期：2017-05-25基金：内蒙古科技计划项目(No.20140169)DifferentiallyExpressedGenesinPartialPl

4、asticFilm-mulchedCultivationofMaizeatBellStageBasedoncDNA-AFLPTechnologyGAOHairongLIQianWANGYufenGUOJiufengMAMengyuLIYudongBAILanfangCollegeofLifeScience,InnerMongoliaUniversity;KeyLaborstoryofIonBioengineeringofInnerMongoliaAutonomuosRegion,SchoolofP

5、hysicalScienceandTechnology,InnerMongoliaUniversity;Abstract：Tnordertoinvestigatethemolecularmechanismoftheregulationofmeiizegrowthunderpartialplasticfilm-mulchedcultivation,thedifferentiallyexpressedgeneswerescreenedby90pairsofsingleprimersusingcDNA-

6、AFLPtechnique,andbioinformaticsanalysiswascarriedoutwithJundan29asthematerialunderopenfield-cultivationforthecontrolandpartialplasticfilm-mulched.Theresultsshowedthatatotalof2298differentialfreigmentswereamplifiedbythe90primerpairs,ofwhich1429wereup-r

7、egulated(45%ofthetotalnumberofbands),869weredown-regulated(23.7%ofthetotalnumberofbands).877geneswereexpressedwithoutdifferenee(27.6%ofthetotalnumberofbands).Twentydifferentdifferentialfragmentswereselectedandsequeneed.UsedBlastdatabasecomparisonandge

8、nearmotationanalysis,fitteenfragmentscouldbedividedinto6groupsaccordingtothefunctions，namelycytoskelctongenes(13.3%),energymetabolismgens(13.3%),cellrescueanddefensegenes(6.7%),transcriptiongenes(40%),intracellulartransportrelatedgenes(6.7%)an