人胃癌细胞株bgc-823细胞质膜蛋白质表达谱的研究

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1、福建医科大学硕士学位论文人胃癌细胞株BGC-823细胞质膜蛋白质表达谱的研究姓名：陈剑波申请学位级别：硕士专业：肿瘤学指导教师：蔡建春2011-03福建医科大学研究生毕业论文人胃癌细胞株BGC-823细胞质膜蛋白质表达谱的研究摘要细胞质膜(plasmamembrane，PM)是细胞的结构基础。细胞质膜蛋白在细胞与细胞以及细胞与外界环境之间起着重要作用，如信号转导、离子转运，囊泡运输等。已发现的药物靶标中，约有2/3是细胞质膜蛋白质。因此，细胞质膜蛋白质组学研究具有重要的意义和应用前景。然而，细胞质膜蛋白丰度低和疏水性强的特点始终阻碍着细胞质膜蛋白质组

2、学研究的进展。为了探索胃癌发生发展的机制并筛选其早期诊断的标记物与治疗的分子靶点，本实验采用荧光素/生物素双标记——亲和素纯化富集技术对胃癌细胞质膜蛋白进行富集纯化，利用SDS-PAGE对样品进行分离，QuantityOne4.6.2软件对Typhoon多功能激光扫描结果进行差异分析，切取有意义条带进行LC-MS/MS鉴定，通过IPI数据库的搜索，共得到了118个非冗余蛋白（non-redundantprotein），其中89个在geneontology（GO）数据库中有明确注释信息，36（40.45%）个确定为细胞质膜蛋白。这些质膜蛋白中包括25%

3、的黏附和结构蛋白（bindingandstructuralprotein），19.4%的细胞增殖、分化和凋亡相关蛋白，16.7%的信号和受体蛋白（signalingproteinandrecep-tor），13.9%的通道和转运蛋白（ionchannelandtransportprotein），8.3%的细胞周期相关蛋白，8.3%的代谢相关蛋白以及8.3%其它功能的蛋白质。结果表明，本研究建立了一套肿瘤细胞质膜蛋白质组学的研究方法；完善了胃癌细胞质膜蛋白数据库；筛选出R-Cadherins、S100A9、HSP90、CASK、AIF等具有潜在临床价值

4、的胃癌细胞质膜蛋白。关键词：胃肿瘤质膜蛋白蛋白质组学双标记质谱电泳2福建医科大学研究生毕业论文ABSTRACTPlasmamembrane(PM)isthestructuralbaseofallcells.ProteinsatthePMallowcellstocommunicatewitheachotherandwiththeextracellularenvironmentandarecriticalforthepropagationofsignalingcascades,vesicletrafficking,iontransport,andsoon

5、.Therearetwo-thirdsdrugtargetbelongstomembraneproteins.Hence,itisimportanttostudyplasmamembraneproteomicsbecauseofitstheoreticalsignifica-nceandapplicationprospect.However,theanalysisofmembraneproteinshasalwaysbeenhamperedbytheirhydrophobicpropertiesandrelativelylowabundance.In

6、ordertoexploretheoccurrenceanddevelopmentmechanismofgastriccancer,identifyoncologymarkersanddevelopnewtherapeutictargetsforgastriccancer,fluorescein/biotindouble-labeling—avidinenrichmenttechnologyisadoptedtopurifytheplasmamembraneproteinsofgastriccancer.Thenext,thoseplasmamemb

7、raneproteinsisseparatedthroughSDS-PAGE,followingbyLC-MS/MSandbioinfor-maticsanalysis.89proteinshaveageneontology(GO)annotationinformationin118non-redundantproteinsidentifybythisway.Thereare36(40.45%)proteinsbelongtomembraneprotein,including25%bindingandstructuralproteins,19.4%C

8、ellproliferation,differentiationandapoptosisrelatedpro