信阳南湾水库翘嘴红鲌和青梢红鲌遗传多样性研究

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1、THESTUDYOFGENETICDIVERSITYOFERYTHROCULTERILISHAEFORMISANDERYTHROCUl月ERDABRYIFROMNANWANRESERVoIRREVEALEDINXINYANGADissertationSubmittedtotheGraduateSchoolofHenanNormalUniversityinPartialFulfillmentoftheRequirementsfortheDegreeofMasterofScienceByMaYunxiaSupervis

2、or:Prof.YangTaiyouMay,2013摘要翘嘴红鱼自(Erythroculterilishaeformis)和青梢红鲐(Erythroculterdabryi)均属鲐亚科红鲐属鱼类,在我国广泛分布。因其肉质鲜美、营养丰富,被视为我国上等经济鱼类。充分认识翘嘴红鲐、青梢红鲐的遗传多样性水平,对其种质资源的评价、保护与持续利用具有重要意义。本实验采用ISSR分子标记技术对信阳南湾水库翘嘴红鲐、青梢红鲐两群体的遗传多样性进行研究,结果如下:(1)利用正交试验设计方法,对翘嘴红鲐、青梢红鲔的ISSR.PCR反

3、应体系中的DNA模板、M孑+、引物、dNTPs及TaqDNA聚合酶浓度进行正交优化。建立的25ul最优反应体系为:DNA量90ng、M92+1.60mmol/L、引物0.51amol/L、dNTPs0.4mmol/L、TaqDNA聚合酶1.25U。利用此体系,对反应中的循环次数和退火温度分别进行优化试验,确定反应程序为:94。C预变性5rain;94。C变性40S,47~58℃复性40S,72。C延伸1.5rain,循环次数38;72℃延伸10min。(2)从77个ISSR引物中筛选出15个,对南湾水库翘嘴红鱼自、

4、青梢红鱼自两群体(共60尾)的基因组DNA进行PCR扩增,其中对翘嘴红鲐共检测出108个位点,多态位点45个,对青梢红鲐共检测出112个位点,多态位点44个。利用POPGENE软件分析翘嘴红鲴、青梢红鲐2个群体的多态位点比例(PPB)分别为41.67%和39.29%,观测等位基因数(№)分别为1.4167和1.3929,有效等位基因数(肫)分别为1.2846和1.2716,Nei’S基因多样度(五)分别为0.1641和O.1545,Shannon’S信息指数(』)分别为0.2414和0.2263,遗传相似度(S)为

5、分别0.8302和O.8401,遗传距离(D)分别为0.1872和0.1762。各项指标综合显示,南湾水库翘嘴红鲴、青梢红鲐群体的遗传多样性处于中等水平,翘嘴红鲔遗传多样性略高于青梢红鲔。关键词:南湾水库,翘嘴红鲐,青梢红鲐,ISSR,遗传多样性IIABSTRACTErythroculterilishaeformisandErythroculterdabryi,belongedtoCultrinaeE珂throculter,WidelydistributedinChina.Theyareconsideredsupe

6、rioreconomiicspeciesfishbecauseoftheirsweet—meatedandnutritious.Understandingthelevelsofgeneticdiversityhasimportantmeaningfortheevaluation,protectionandsustainableutilizationofitsresources.Inthisstudy,theISSR(theSimpleSequenceRepeat)molecularmarkerwasappliedt

7、oinvestigatethegeneticdiversityofErythroculterilishaeformisandErythroculterdabryifromNanwanReservoir.Theresultsareasfollows:(1)ThoughtheorthogonalexperimentaldesignwasusedtooptimizeISSR-PCRsystemofErythroculterilishaeformisandErythroculterdabryiinfivefactors(M

8、92+,primer,dNTPs,DNAtemplateandTaqDNApolymerase)respectively.Theresultsindicatedthat90ngDNAtemplate、M92+1.60mmol/L、0.51xmol/Lprimer、dNTPs0.4mmol/L、1.25UTaqpolymerasewereasthebestIS

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