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时间:2019-02-28
《猪心肌和骨骼肌microrna表达谱分析与比较》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、万方数据SichuanAgriculturalUniversityMasterDegreeDissertationIdentificationandDifferencesofMicroRNATranscriptomesbetweenCardiacMuscleandSkeletalMusclesinPorcineAuthor:乃n物Supervisor:Prof.ZhuLiMajor:AnimalGeneticsandBreedingSpecialty:一ConservationandUseofAnimalGeneticResourcesJune,2
2、014万方数据论文指导小组成员IIIIILIlllliIllllMILIllllllllIllllUlJ0120855本论文得到教育部长江学者和创新团队发展计划资助本论文在“畜禽遗传资源发掘与创新利用"四川省重点实验室完成万方数据论文独创性声明本人郑重声明:所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行研究工作所取得的成果。尽我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,学位论文中不包含其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得四川农业大学或其它教育机构的学位或证书所使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的
3、说明并表示了谢意。研究生虢谭缸20【U年{)月(o日关于论文使用授权的声明本人完全了解四川农业大学有关保留、使用学位论文的规定,即:学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版,允许论文被查阅和借阅,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意四川农业大学可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。Ⅵ/本论文不保密。(请在以上口内划“4”)研究生签名:谭钇导师签名:辛砀口本论文保密,在一年解密后适用本授权。硷【吣年c'月lD日&a彤年歹月p日万方数据pqJII农业人学坝lj学位论文摘要MicroRNA(
4、miRNA)是非编码小RNA家族的重要成员,长为22nt左右,它能负调控靶基因的表达。许多证据都证明了miRNA在肌肉的增殖,分化和发育的过程中都起着十分重要的作用。心肌和骨骼肌(如:背最长肌和腰大肌)同属横纹肌,但是它们在生物个体内所行使的功能差异却很大。猪在畜牧生产和医学研究领域都有非常重要的价值,且心肌与骨骼肌在miRNA表达谱上的研究报道都比较少。本研究利用Illumina高通量测序技术平台构建了3只210日龄雌性长白猪的心肌,背最长肌和腰大肌三个组织的小RNA文库,得到的结果如下:1)心肌,背最长肌和腰大肌三个文库共检测得到56M的原始数
5、据,其中高质量读段(high.qualityreads)在心肌,背最长肌和腰大肌分别为20.31M,15.87M和17.93M,这些测序读段分别占了原始数据的94.12%,95.48%和97.14%;2)三个文库共检测得到907个非冗余的miRNA(uniquemiRNAs),其中有441个为三个库共同表达,利用IDEG6进行差异显著性检验,发现123个miRNA为三个文库差异表达的miRNA(P<10乇);3)利用聚类分析和相关性分析三个文库差异表达miRNA的表达模式,结果发现:背最长肌和腰大肌的表达模式更为接近,而心肌的表达模式与两种骨骼肌的
6、表达模式明显不同;4)心肌miRNA文库表达量前十的miRNA在背最长肌和腰大肌文库里也同时高表达。这10个高表达的miRNA中有8个miRNA为差异表达的miRNA(miR.143,.378,.1,.133a,.27b,.30e,.101和let.7a),而其中的6个miRNA(miR.143,.378,.27b,.30e,.101和let.7a)的表达量都表现为心肌同时高于背最长肌和腰大肌(约1.5倍);5)对心肌上调的6个miRNA进行靶基因预测和生物学功能预测(G0和KEGG)发现这些高表达的miRNA靶基因主要富集于胰岛素信号通路(,2=
7、21,P8、RNAs)arenon—codingRNAs,approximately22nucleotides(nt)inlength
8、RNAs)arenon—codingRNAs,approximately22nucleotides(nt)inlength
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