琼玉膏延缓衰老差异蛋白的生物信息学分析

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3、雨签日期：勘—眸‘+声Jg-．誉文≥，∥哆一锄厶文÷矿。lit"，摘要目的：使用琼玉膏干预因D一半乳糖作用而导致的亚急性衰老大鼠模型，分析其抗氧化作用，并利用生物信息学技术，快捷有效的分析琼玉膏延缓衰老的靶蛋白的相互作用网络及途径，聚类分析基于本体论相关注释。从而更进一步确定琼玉膏作用于下丘脑的靶蛋白所在，从分子水平解释琼玉膏的作用机制

4、，为后期研究奠定理论和实验基础。方法：将42只3月龄的SD大鼠随机分为3组，每组14只，雌雄各半，分笼饲养，标为空白组雄、空白组雌、模型组雄、模型组雌、琼玉膏组雄、琼玉膏组雌。从实验第一天开始，模型组和琼玉膏组每天给予D一半乳糖(1．25mg·kg～·d1)腹腔注射，空白组注射等剂量的生理盐水。同时，琼玉膏组给予琼玉膏(149·kg～·d1)灌胃，空白组和模型组给予等剂量的蒸馏水灌胃。连续用药8周。停药后取血清和肝脏，用紫外光法测总抗氧化能力、谷胱甘肽过氧化物酶和过氧化氢酶的活力。并在前期蛋白质组学寻找到15个差异蛋白的基础

5、上，对其进行生物信息学的分析。使用聚类分析注释差异蛋白的GeneOntology，利用IngenuityPathwayAnalysis软件分析差异蛋白的作用网络，利用KEGG数据库分析差异蛋白的主要代谢途径。结果：1．成功建立了亚急性衰老SD大鼠模型；2．琼玉膏可以提高雄性实验性衰老大鼠肝脏中CAT的活力，对雌性大鼠肝脏则无明显差异：雄性及雌性大鼠肝脏中GSH—PX的活力均有上升，但无显著统计学意义：雄性及雌性大鼠血清中T-AOC的活性都比模型组有明显上升，具有统计学意义。3．差异蛋白的GO注释中，与生物过程相关的有68条，

6、与细胞组成相关的有33条，与分子功能相关的29条。4．在差异蛋白相互作用网络图中，有2个或以上节点的可能是琼玉膏作用的差异蛋白相互作用中的重要蛋白，它们是泛素C、磷酸酶肌动蛋白调节器、泛醌细胞色素C还原酶核心蛋白1、蛋白磷酸酶1调节亚基13(抑制剂)L、Q蛋白神经元中间丝蛋白、NADH脱氢酶(辅酶)铁硫蛋白1、B乙基马来酰胺敏感的融合蛋白附着蛋白、Arp3肌动蛋白相关蛋白3、琥珀酸脱氢酶复合物亚基黄素蛋白(Fp)、EFhanddomaincontainin92、核糖体蛋白SA、白蛋白。5．通过KEGGpathway分析，发现

7、了差异蛋白主要参与的代谢途径有：RNA降解途径、嘌呤代谢途径、核糖体途径、糖酵解途径、低氧诱导因子l信号通路途径。结论：1．通过对鉴定出的差异蛋白的G0注释，发现了这些差异蛋白主要是从生物过程如神经系统发育、转录等方面来实现其功能的。2．通过构建差异蛋白质相互作用网络图，发现了一些重要的蛋白质，分别是：泛素C、磷酸酶肌动蛋白调节器、泛醌细胞色素C还原酶核心蛋白l、蛋白磷酸酶l调节亚基13(抑制剂)L、Q蛋白神经元中间丝蛋白、NADH脱氢酶(辅酶)铁硫蛋白1、B乙基马来酰胺敏感的融合蛋白附着蛋白、Arp3肌动蛋白相关蛋白3、琥

8、珀酸脱氢酶复合物亚基黄素蛋白(Fp)、EFhanddomaincontainin92、核糖体蛋白SA、白蛋白。3．通过KEGGpathway分析发现经鉴定的差异蛋白参与的主要代谢通路为RNh降解途径、嘌呤代谢途径、核糖体途径、糖酵解途径、低氧诱导因子l信号通路途径。4．基因本体论(GeneOntology，GO)、IPA和KEGGpathway等生物信息学工具有助于琼玉膏延缓衰老差异蛋白蛋白质功能、相互作用、代谢通路等全面、快速、准确的分析。关键词：琼玉膏；延缓衰老；生物信息学；基因本体论；蛋白作用网络；蛋白通路IITheb

9、i0；nformatiGSanalysiSofthedifferentiaIyexpressedproteinsof0iongyugaoondeIayingagingSpeciaIty：OhineseMediCineAuthor：HuXiaTutor：LiUHuanlanAbstractO