盾纤亚纲纤毛虫的系统学及以钩刺斜管虫为模式的基因组进化研究

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1、万方数据盾纤亚纲纤毛虫的系统学及以钩刺斜管虫为模式的基因组进化研究学位论文答辩日期：指导教师签字：答辩委员会成员签字：万方数据谨以此论文献给我最敬爱的导师宋微波教授，以及我最亲爱的父母!⋯⋯一一高凤万方数据8IIIIIIIIIIIIIUlIIIIIIIIY2657402独创声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含未获得其他教育机构的学位或证书使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均

2、已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名：禹比签字日期：_1弓年12月牛日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，并同意以下事项：l、学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。2、学校可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同时授权清华大学“中国学术期刊(光盘版)电子杂志社”用于出版和编入CNⅪ《中国知识资源总库》，授权中国科学技术信息研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数

3、据库》。(保密的学位论文在解密后适用本授权书)学位论文作者签名：高见导师签字：签字日期：yfj年I】，月午日签字目期成，；年／辽月f日万方数据盾纤亚纲纤毛虫的系统学及以钩刺斜管虫为模式的基因组进化研究——目录中国海洋大学博士学位论文盾纤亚纲纤毛虫的系统学及以钩刺斜管虫为模式的基因组进化研究目录摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯1引言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯99引舌⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯盾纤亚纲纤毛虫及其系统学研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

4、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．9纤毛虫基因组进化研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．16材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．23缸士甲：口7卜第一篇盾纤亚纲纤毛虫的系统学⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯33第l章基于多基因分子标记对帆口目和斜头目的系统学研究⋯⋯⋯⋯⋯．35第2章基于多基因分子标记对触毛目和膜袋类的系统学研究⋯⋯⋯⋯⋯．53第3章基于多基因分子标记对嗜污目的系统学研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯71第4章利用核糖体小亚基基因对盾纤类六个属的系统进化分析⋯⋯⋯⋯．．93第5章利用核糖体小亚基基因对类嗜污

5、虫属和后口虫属的系统学研究⋯．．107第6章基于基因组学信息的纤毛门系统的构建⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．117万方数据盾纤亚纲纤毛虫的系统学及以钩刺斜管虫为模式的基因组进化研究——目录第二篇以钩刺斜管虫为模式的基因组进化探讨⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一123第7章基因组结构对纤毛虫基因家族进化的影响⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．125第8章选择性拼接基因对基因组及基因家族进化的启示⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．137参考文献⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯149致谢⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯163附录个人简介、发表文

6、章目录⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．165万方数据盾纤亚纲纤毛虫的系统学及以钩刺斜管虫为模式的基因组进化研究——目录Multigene—-basedPhylogenyofScuticociliatiaandGenome‘。—‘inChilodonell,Rearrangementsinilodonellaunci‘‘nataCONTANTSAbstract．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．1

7、Introduction．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9MaterialsandMethods⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．23ResultsSectionIMultigene-basedPhylogenyofScuticociliatia⋯⋯⋯⋯⋯．．33Chapter1Multigene-basedanalysesonevolutionaryphylogenyoftwocontrover

8、sialciliateorders：PleuronematidaandLoxocephalida⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．35Chapter2Chapter3Chapter4Chapter5Chapter6Multigene—basedph