临床检验诊断学双语领域本体构建方法研究承

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1、20lO年6月情报探索第6期(总152期)临床检验诊断学双语领域本体构建方法研究承杜志银1刘芳。胡虹赵文龙(1重庆医科大学信息管理系重庆400016)(2重庆市江北区第一人民医院检验科重庆400020)摘要:在对现有领域本体构建方法进行综合分析的基础上,提出了临床检验诊断学领域本体6雏模型,并采用斯坦福大学医学院开发的本体编辑软件ProtSg64.0,开发了临床检验诊断领域双语本体。关键词:领域本体双语本体临床检验诊断学本体构建中图分类号:TP391.5文献标识码:A文章编号:1005—8095(2010)06-oOl8-031引言构建领域本体的目的主要在于实现某种程度的本体

2、的概念起源于哲学.是对客观世界本质的知识共享和复用。国内外在本体构建方法上,研究最描述,其最终目标是精确地表示那些隐含信息。2o多的主要是以下两种方式:一种是本体工程,即探讨世纪以来,本体概念被引入到计算机领域,用以解决本体的构建方法:另一种是基于词表的本体构建。知识表示和知识组织方面的问题。2.1本体工程本体构建的方法主要有手工构建、复用现有本本体工程的主要特点就是强调构建本体时要按体、利用程序自动构建以及半自动构建4种[1]。手工照一定的规范和标准。相对于一般的系统,本体更强构建本体费时费力。工程巨大。复用现有本体主要是调共享、重用,可以为不同系统提供一种统一的语利用已有

3、的主题词表、顶级本体、在线本体等资源库言.因此本体构建的工程性更为明显。常见本体工程获取领域知识以及概念之间的等级关系。自动构建构建方法有骨架法、TOVE法(评估法)、Bemaras法、本体是借助知识获取方法,如机器学习、数据挖掘等SENSUS法、KACTUS工程法、IDEF5法、ME哪ON—技术,通过自然语言规则以及统计分析来确定概念TOLOGY法、七步法等嘲。以及概念之间的关系并自动构建。半自动构建就是但是目前本体工程中尚没有标准的权威的方法首先借助自然语言处理和数据挖掘等技术,从语料论。构建方法不成熟,本体的复用性得不到充分保库中自动抽取领域的相关概念和概念之间的关系,

4、障。因为这些现有的方法都是基于所开发的项目并最后通过人工校验来修正结果。自动或半自动构建结合自身的经验总结提取出来的,都具有特殊的针本体的方法目前还处于研究阶段。对性和适用性。目前国内已有的生物医学领域本体生物医学是一个发展非常迅猛的学科,同时也绝大多数都是按照或者借鉴七步法的思想而建立是概念间关系相对比较容易确定的学科。美国国立的。医学图书馆早在1963年就出版了(MESH),(MESH)2.2基于词表的本体构建通过参见系统和树状结构表明确了概念之间的上下由于现有主题词表、分类法具有清晰的语义结位关系,同时提供了参见关系,正因为如此,生物医构,便于从中抽取概念关系,特别是医

5、学领域,词表学领域一直是本体研究的热点.国外已经取得了相丰富,因此。有很多研究者都尝试将现有的词表转换当的成果。在疾病本体方面,澳大利亚人Hadzie等为本体。利用词表构建本体的方法可以分为两类:一提出了一个人体4维通用疾病本体模型;随后中国类是对现有词表完整地采用XML/RDFS语法进行形学者方安等提出了改进型的人体6维通用疾病本体式化描述;另一类是对现有词表进行调整,调整词问模型[2]。这些都是以疾病为轴心的本体模型。本文在关系,对词进行增减,然后生成新的本体。分析这些通用疾病本体模型的基础上,提出构建以实际上.叙词表和本体都是对现有概念的等级临床检验诊断应用为轴心和目的

6、,以手工构建和复关系、语义关系进行描述,因此,二者按照一定的规用现有领域资源为基础的临床检验诊断学领域双语则进行转换具有可行性。但是一些学科发展非常快。本体的方法。词语和概念的更新频率较快,而词表本身的变换需2构建领域本体的方法要一定的周期,因此,在进行词表转换为本体的时收稿日期:2OLO-O3-24々本文系重庆医科大学校级课题“临床检验诊断学领域本体构建及其应用研究”(项目编号:XBYB2007119)成果之一。作者简介:杜志银(1975一),男,馆员,硕士。182010年6月杜志银等:临床检验诊断学双语领域本体构建方法研究第6期(总152期)候,需要考虑学科特点,根据不同

7、学科的特点采用不同的构建方法。3临床检验诊断学领域本体构建方法本课题的目的是为了实现语义组织、语义检索.为临床检验医师和临床医师的临床诊断决策服务。临床检验诊断学属于医学的分支。其词间的语义关系可以参照美国《医学主题词表(MESH))、ICD一11、SNOMED等,但是临床检验诊断学领域发展非常快,有很多新技术、新方法不断应用于临床实践中。为了增强本项目所开发的临床检验诊断学领域本体的实用性,课题组确定采用在参照{MESH)的情况下,使用本体工程法的思想来构建。3.1本体构建工具的选择本体构建的工具有P

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