基因调控网络模型学士学位论文

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1、拟建中的阜阳市中国XXXX国际服装城依托中国XX国际服装城,拟建成为皖西北地区规格最高、规模最大、商务及功能最优的现代化、国际化服装专业市场,建设规模占地约128亩,建筑面积约25万平方米,项目总投资约5亿元人民币。经过1--2年的开发建设,能达到正常运营期的中国XX.XX国际服装城将吸纳全国和世界各地的经销商、代理商企业物流总部等500—1000家,预计年交易额实现68亿元人民币,每年实现税收8000—10000万元人民币,每年实现利润1.68亿元人民币,实现就业和创业人员约2万以上。安徽工业大

2、学毕业设计(论文)报告纸绪论1.1课题背景随着基因组学的发展,在短时间内可获得生物体基因表达的海量数据,这为研究和揭示基因及其产物之间的相互关系,特别是基因表达的时空调控机制奠定了基础。基因表达的调控不是单一的,孤立的,而是彼此联系,相互制约的,构成了复杂的基因表达调控网络。几乎所有的细胞活动和功能都受基因网络调控。孤立的研究单个基因及其表达几乎完全不能确切地反映生命现象本身和内在规律。因此,科学家必须从系统的观点研究多基因的调节网络,才能阐明生命的本质和疾病发生的机理。因此,基因调控网络是后基因

3、组时代研究的重要课题。基因网络研究的目的是通过建立基因转录调控网络模型对某一个物种或组织中的全部基因的表达关系进行整体的模拟分析和研究,在系统的框架下认识生命现象,特别是信息流动的规律。调控可在分子水平上分为三个层次:DNA水平、RNA水平和蛋白质水平。DNA水平主要是研究基因在空间上的关系影响基因的表达;RNA水平上,也就是转录水平上的调控,主要研究代谢或者是信号传导过程决定转录因子浓度的调控过程;蛋白质水平主要研究蛋白质翻译后修饰加工,从而影响基因表达的活性和功能。1.2基因调控网络模型研究现

4、状基因调控网络研究,离不开生物信息学和系统生物学。运用生物信息学的方法和技术通过数据采集、分析、建模、模拟和推断等手段研究复杂的网络关系,揭示有关的作用机理,是当前生命科学的热点之一。从一个初始提供的基因表达数据和调控机制先验知识建立起的模型开始,系统行为可以在各种各样的实验条件下进行模拟。将模拟表达数据和观察得到的真实表达数据做以比较,就可以给出模型适应性评价。如果模拟数据和真实数据不匹配,并且真实数据可靠,则有必要继续对模型进行修正。不断地重复重构和修正网络模型,模拟生物系统行为,测试的预测结

5、果的工作,直到获得一个理想的模型,其可以很好的与真实基因表达数据相吻合。一般来说基因调控网络有如下特点:(1)复杂的高维结构网络中节点和边的数目庞大。染色质构象,结构基因上游各种各样的调节序列,反式作用因子,RNA聚合酶活性等因素都决定了基因调控网络是一个非常高维的复杂结构。(2)网络结构动态性两个基因间的那条边是否存在、作用的方向在不同时期是可能不一样的。(3)网络中节点间作用类型复杂多变经济增长:在优化结构、提高效益和降低消耗的基础上,“十一五”期市GDP年均增长12%以上(现14%以上),2

6、010年达到650亿元以上,人均GDP力争1000美元;财政收入达到80亿元;规模以上工业销售达到550亿以上;全社会固定资产投资年均长20%,五年累计1000亿元;社会消费品销售额260亿元,年均增长20%,外贸进口总额2.5亿美元,年均增长15%;五年累计招商引资突破500亿元,力争达到600亿元拟建中的阜阳市中国XXXX国际服装城依托中国XX国际服装城,拟建成为皖西北地区规格最高、规模最大、商务及功能最优的现代化、国际化服装专业市场,建设规模占地约128亩,建筑面积约25万平方米,项目总投资

7、约5亿元人民币。经过1--2年的开发建设,能达到正常运营期的中国XX.XX国际服装城将吸纳全国和世界各地的经销商、代理商企业物流总部等500—1000家,预计年交易额实现68亿元人民币,每年实现税收8000—10000万元人民币,每年实现利润1.68亿元人民币,实现就业和创业人员约2万以上。安徽工业大学毕业设计(论文)报告纸目前的研究表明,基因间的相互作用可能是一种非线形的作用关系。在多因子调控模式中还要考虑不同的调控因子对同一个目标调控基因产生作用时的某种逻辑关系,这种逻辑关系是由调控模式中各调

8、控因子的相互关系决定。(1)节点类型多种多样基因调控网络中节点的元素是多种多样。可以是DNA、mRNA、蛋白、分子、大分子、外界环境等等。(2)各节点状态是不断变化的当细胞受到不同的外界刺激或处于不同的发育阶段时,参与表达的基因是不同的,基因的表达量的变化会影响到相互作用的变化,会引起网络结构的变化。(3)一般存在反馈循环回路在生物体中各种生理上的周期现象,容易理解生物体中的相互作用存在周期性,至少在网络的局部上是循环的,存在反馈循环回路。要利用数学模型建立基因调控网络时,我们必须

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