“计算中药学”在中药药性及复方研究中的应用

“计算中药学”在中药药性及复方研究中的应用

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1、.-P¨JrI博士学位论文学校代码:学号:l∞23B2008350“计算中药学"在中药药性及复方研究中的应用TheApplicationofComputationalChineseMateriaMedicatotheStudiesofChineseMateriaMedicaPropertiesandTraditionalChineseMedicinePrescriptions所院:药用植物研究所姓名:导师:学科专业:龙伟邹忠梅研究员刘培勋研究员生药学研究方向:天然产物化学完成日期:二零一一年五月

2、I产l1e;{li独创性声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。论文中除了特别加以标注和致谢的地方外,不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得其他教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名:准4南签字日期:伽If年6月f6日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解jE塞逊塑医堂瞳有关保存、使用学位论文的管理办法。有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复

3、印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅。本人授权j丝塞迹塑医堂瞳可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。(保密的学位论文在解密后适用本授权书)学位论文作者签名:龙/1专导师签名:签字日期:Ⅵ¨年6月比日签字日期:学位论文作者毕业后去向:工作单位:通讯地址:缎卅日.妒11年b只c}日电话:邮编:‘1、I’'中国医学科学院北京协和医学院博士学位论文目录摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯2Abstract··

4、··········⋯···········································································4前。言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯6日盯青⋯⋯”⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一⋯”“⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯“⋯一第一章计算中药学的概念原理及其方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯8第一节计算中药学的概念原理⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯8第二节计算中药学的研究方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

5、⋯⋯⋯⋯14第二章中药化学数据库的构建⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯”9第一节中药化学二维数据库的建立⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯19第二节中药化学三维数据库的建立⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯22第三章计算中药学用于中药四气的研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯24第一节中药四气的研究概况⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯j⋯⋯⋯⋯⋯⋯”24第二节中药寒热预测系统⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯28第四章计算中药学用于中药五味的研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯43第一节中药五味的研究概况⋯

6、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯43第二节辛味中药与嗅觉受体相互作用的研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯46第五章计算中药学用于方剂配伍禁忌的研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯58第一节中药配伍禁忌的研究概况⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯58第二节方剂网络与化学空间对配伍禁忌的研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯60第六章计算中药学用于中药复方的研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯68第一节脓毒症发病机制与病理网络⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯68第二节血必净药效物质的虚拟筛选⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯7

7、4结{吾⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一·⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯100参考文献⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯101致谢⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯1077^川,中国医学科学院北京协和医学院博士学位论文摘要中药物种的多样性和多元性,中药成分的丰富性和复杂性,中药配伍的灵活性和多变性,中药信息资源的急剧增长和海量资料的挖掘和整理,中药研究现有实验技术的局限和不足等等,决定了中药研究不可想象的复杂性和艰巨性。我们认识到要正确理解构成中药复杂系统

8、的要素(组成成分)、要素间的相互作用及其个体和整体的效应,需要改变常规的思维方式,在现有的医药学实验科学方法的基础上,应用计算科学及其方法,处理中药研究中关键的科学问题。因此,本论文提出了“计算中药学"这一新的学科概念。“计算中药学’’致力于计算、信息技术在中药研究领域的应用,对常规实验无法触及的领域和由来已久的技术难题给出合理而独具特色的研究思路与方案,对中医药领域的抽象概念和高度概括的理论讲述给出科学而定量的实验证据。本论文详细介绍了“计算中药学"的概念内涵、基本原理、研究方法和研究意义。在

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