分析基因表达数据解决疾病分类问题

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1、同济大学硕士学位论文分析基因表达数据解决疾病分类问题姓名：俞振超申请学位级别：硕士专业：分析化学指导教师：李通化20030201瑚济火掌审搿壤土掌链论文分攒耩矧表达数据躲次蔽瘸分类随题摘要天类蒸因缀诗菇(HGP)怒天类是了试谖鑫基藤遵行鲶一磺最僚大耱最其影响的研究计划，目前已基本究成了人类熬因的全序列测定。但问飚怒面对大爨的基因或基因片断序列知何研究其功能，只有知道其葫能才能真正体现HGP计鲻豹徐餮．蔽译人类基瓣这鄢天书。蒸纂闲缀计菇、臻是疆诗麓等概念藏是为实现这一目标而提出的。不同个体基因变舜、不同组织、不同时间、不同生命状态等基因袭达麓异豹分析憝连接基因鳃计划和蛋囱组计划最关键的一个环节

2、，它不龊熊裂蹋鏊嚣逛诗鲻瀚研究残巢在痰瘸诊鼗、蓊甥簿选等矮域发揍重蘩麓作用，而鼠还可为蛋白组计划的实施提供丈量非常熏疆的线索。这一环节既是藻因组计划的补充又怒蛋囱组计勉豹觏榕。基因芯片技术就是为襄现这一邵节两建立黎。癌症治疗的手段发展黧今，面临的～犬挑战怒如何将具体的治疗方法针对予在病原上备囊独特韵瓣瘸类型，以达到娥太疗效f弼时使毒性最低。在癌症分爽方覆懿竣避溪琵成秀发麓疼症治疗方法熬孛心舔节，一壹敬慕，癌症分类主整基于肿瘸的形态表观，但这种分类方式宥很大的局限性，因为具肖相似组织瘸理学表观的肿瘤可能袭联出很不楣间的啦床发艇过程，或者对间种治疗璧现斌不两反应。瓣藩，熬饕纂露芯片接零鼹发震，涮

3、瘸麓颡表达数据焦来绘痰瘸样零分类融缀成为主要手段。基因芯片的蓬勃发展锼褥同时测定戏千上万个蒸围酌表达成为可能，邀种灏定麓力藻德筏粥在镶短鹃蹲润蠹帮驭褥戮变量鼗《蕊戳鼗≥P远远大予样本数_Ⅳ的数据矩阵。标准的分类统计方法谯N

4、～般情况下，分炎结果的jE确率均可达到95％以．I二。爆时本文还对分耩过程的第三步即使用酶缓方法来减少变鬣数遴行J川济人学申请顺I．学位论文分析基因表达数摧解决痰桶分类问题了讨论，分别使用了主成分分析，偏最小二乘和分段反向回归这三种方法以及它们的联用。最终得出偏最小二乘略优于其他两种方法，而SIR在改变选择的基因数载燎援下袭褒季鞋l≥裳稳定。除了对分类续暴我讨论终，本文还使曩分段反向回归分析方法找到了与疾病分类最相关的基因。4川济人学申l爵坝l。学心论立分析基倒表达数粥解决疚痫分类问题AbstractHumanGenomeProgram(HGP)isagreatresearchplanwit

5、henormousimpactformankindtoknowaboutourselves．Almostallofthehumangeneshavenowbeensuccessfullysequenced，however，wecarlnotbreakdownthesecretoflifeandtrulyembodythevalueofHGPuntilwelearnthefunctionsofthosegeneswithinnumerousgenesequenceinformation．Andthisultimategoalhasactuallybroughtaboutsuchconcepts

6、likepost-genomeprogramandproteinomeasresearchersfurtherobjectives。Analyzinggeneexpressiondifferencesintermsofdiverseindividualvariations．varioustissues，differenttimeanddifferentlifeconditionsisthemostcriticallinkconnectinggenomeprogramandproteinome．Suchkindofexploitcannotonlyplayasignificantroleind

7、iagnosingdiseaseandscreeningdrugsbyutilizinggenomeprogramresearchfindings，butalsoprovidelotsofimportantcluesforimplementingproteinomeprogram．Thissectoractsasboththesupplementtogenomeprogramandthenavigationa