毛红椿群体遗传结构的ssr分析

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1、林业科学研究2009,22(1):37~41ForestResearch文章编号:100121498(2009)0120037205毛红椿群体遗传结构的SSR分析11112刘军,陈益泰,姜景民,何贵平,余国民(1.中国林业科学研究院亚热带林业研究所,浙江富阳311400;2.浙江省龙泉市林业科学研究所,浙江龙泉323700)摘要:利用SSR分子标记对分布在我国的7个毛红椿群体进行了遗传结构研究。结果表明:毛红椿群体具有较低水平的遗传变异;毛红椿群体的等位基因的平均数为6.1,有效等位基因数平均为2.7,平均期望杂合度为0.6006;毛红椿群体遗传分化系数(F

2、ST)平均值为0.1854,在FST值的基础上估算毛红椿群体间的基因流(Nm)为1.0983。采用平均距离方法(UPGMA)对7个群体进行了聚类,对各群体遗传距离与地理距离的相关分析表明:群体间遗传距离与地理距离显著相关。分析了毛红椿濒危的原因,并提出了保护策略。关键词:毛红椿;SSR;分子标记;遗传结构中图分类号:Q943文献标识码:AStudyonPopulationGeneticStructureinToonaciliatavar.pubescenswithSSR11112LIUJun,CHENYi2tai,JIANGJing2min,HEGui2pi

3、ng,YUGuo2min(1.ResearchInstituteofSubtropicalForestry,CAF,Fuyang311400,Zhejiang,China;2.ResearchInstituteofLongquanCity,ZhejiangProvince,Longquan323700,Zhejiang,China)Abstract:PopulationgeneticstructureofsevennaturalpopulationsofToonaciliatavar.pubescenswasstudiedwithsimplesequence

4、repeat(SSR)markers.TheresultsshowedthatalowlevelgeneticdiversitywasdetectedinthepopulationsofT.ciliatavar.pubescens.Averagenumberofallelesandeffectivenumberofalleles(Ne)were6.1and2.7respectively.Themeanexpectedheterozygositywas0.6006.Themajorofgeneticgeneticvariationoccurredwithinp

5、opulations,whichcouldbeconcludedfromthecoefficientofgeneticdifferentiation(FST=0.1854).Thelevelofgeneflow(Nm)was1.0983.DendrogrambasedNeips(1978)geneticdistancewasanalyzedwithUPGMA.Significantcorrelationwasfoundbetweengeographicaldistanceandgeneticdistance.Thereasonsthatresultinend

6、angeredstatuswereanalyzed,andsomeconservationstrategieswereputforward.Keywords:Toonaciliatavar.pubescens;simplesequencerepeat(SSR);markers;geneticstructure了解濒危物种的遗传结构和遗传多样性水平,性等优点,是构建遗传连锁图谱、研究群体遗传学、可以提高对群体动力学、适应和进化机制的认识,对进行分子标记辅助育种和系谱分析的理想[7-9]探讨物种濒危机制、指导迁地保护和引种栽培以及工具。[1-2]群体的保护价值评

7、估等有着重要意义。目前遗毛红椿(Toonaciliatavar.pubescens(Franch.)[3-6]Hand.2Mazz.)是楝科(Meliaceae)香椿属(Toona传结构研究已成为保护遗传学研究的热点。SSR分子标记是一种基于DNA长度多态性的检测Roem.)植物,为落叶大乔木,雌雄同株,花较小,花技术,具有共显性、高度可重复性、高度丰富的多态粉主要靠风力传播。果实为蒴果,成熟后自然开裂。收稿日期:2008203212基金项目:中国林业科学研究院院所基金(RISF6808)和浙江省重大科技专项(2008C0200422)作者简介:刘军(197

8、7—),男,山东泰安人,助理研究员,主要从事珍贵阔叶

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