羊传染性脓疱病毒gif基因的克隆及序列分析

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1、分类号S852.62学校代码10129UDC11.220学号2010201074羊传染性脓疱病毒GIF基因的克隆及序列分析CloningandBequenceAnalysisoftheGIFGeneofContagiousEcthymaVirus申请人:鲁燕学位名称:兽医硕士领域:兽医指导教师:申之义教授论文提交日期:二〇一二年五月摘要根据已发表的羊传染性脓疱病毒NZ2株的基因序列,应用计算机程序设计合成一对针对羊传染性脓疱病毒GIF基因的特异性引物,对羊传染性脓疱病毒内蒙分离株OV-nm-05进行PCR扩增,扩增产物与pEASY—T1载体连接,转化至感受态大

2、肠杆菌DH5a中,成功得到GIF基因的阳性克隆,送测序公司进行测序得到该病毒GIF的基因序列。该病毒GIF基因序列长约1280bp左右,其中包括GIF基因的编码区和左右两边的非编码区。应用计算机软件将测定的基因序列及其推导的氨基酸序列与7株参考毒株进行比较。结果表明,内蒙古分离株OV-nm-05碱基序列与OV-NZ2、OV-D1701、OV-IA82、OV-SA00、OV-F07.808R、OV-MUK59/05、OV-F94.848R的同源性分别为95.7%、98.2%、96.7%、95.5%、95.9%、95.5%、95.1%;氨基酸序列同源性分别为95.

3、1%、90.2%、95.1%、94.7%、94.7%、95.1%、93.6%。说明羊传染性脓疱内蒙古分离毒株OV-nm-05的GIF基因与7株参考毒株之间差异不大。关键词:羊传染性脓疱病毒;GIF基因;PCR;克隆;序列分析CloningandsequenceanalysisoftheGIFgeneofContagiousEcthymavirusAbstractApairspecificprimerweredesignedandsynthesizedaccordingtothepublishedGIF(GM-CSFinhibitoryfactor)genese

4、quenceofNZ2strainofContagiousEcthymavirusinGenbank.TheGIFgeneoftheInnerMongoliaisolatestarin(OV-nm-05)ofContagiousEcthymaviruswasamplificatedwiththeprimerbyPCR.ItisclonedintopEASY-T1plasmidsandsequenced.TheGIFgenesequenceofOV-nm-05strainwascomparedwith7referenceCEVstrains.Theresulti

5、ndicatedthattheGIFgenesequenceshomologyofOV-nm-05whithOV-NZ2、V-D1701、OV-IA82、OV-SA00、OV-F07.808R、OV-MUK59/05andOV-F94.848Rwas95.7%、98.2%、96.7%、95.5%、95.9%、95.5%、95.1%respectively,andtheGIFanimoacidsequenceshomologywas95.1%、90.2%、95.1%、94.7%、94.7%、95.1%、93.6%respectively.Theresultssh

6、owedthatOV-nm-05strainhadhighhomologywiththe7conferenceCEVstrains.Keywords:Contagiosumecthyma;PCR;chcloning;SequenceAnalysisDirectedby:prof.SHENZhiyiApplicantforMasterdegree:LUYan(MasterofVeterinarymedicine)(CollegeofAnimalScienceandAnimalMedicineInnerMongoliaAgriculturalUniversityH

7、uhhot100018,China)目录1引言................................................................11.1羊传染性脓疱的概述...............................................11.2羊传染性脓疱的病原学.............................................11.2.1形态结构......................................................11.2.2培养特性...

8、...................

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