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时间:2019-02-21
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1、1.进入ncbi网站http://www.ncbi.nlm.nih.gov/2.进入BLAST比对下拉页面进入上面的对话框里输入标准序列下面的对话框输入测序序列:Oligo软件:Edit——Entersequence,如此即可复制序列点击即可出现结果:如果发现有碱基突变:3.打开PrimerPremier5.exeFile——new——DNAsequence将标准序列以及测序序列输入编辑框标准序列就用Asis(正向序列)点击Standard——OK即可生成氨基酸序列。测序样品在输入时,由于测序结果是反向序列,要选择reversecomplement
2、ed将以上两段序列粘贴至一个txt文本中,自命名,放置在clustalx1.83文件夹下面4.打开clustalx1.83软件——File——loadsequence选择刚刚保存的txt氨基酸序列文件经过比对,没有氨基酸的突变,即可进行下一步实验注意:在blast比对时,返回上一级页面需要点击blastnsuite-2sequences在比对时如果出现碱基缺失如下由于碱基缺失会导致移码,则次测序结果不可使用。
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