中国人群肺鳞癌癌基因驱动突变分析研究

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1、复旦大学硕士学位论文学校代码：10246学号：09211230028硕士学位论文(专业学位）中国人群肺鳞癌癌基因驱动突变分析研宄院系：肿瘤医院专业：肿瘤学姓名：潘云建指导小组：陈海泉教授相加庆教授、、十石副教授孙艺华博士完成曰期：2012年5月8日1复旦大学硕士学位论文目录摘要31.前71.1肺癌的概况和当前治疗现状71.2肺鳞癌癌基因驱动突变研宄现状81.3当前肺鳞癌癌基因驱动突变研宄领域的争议91.4本研究的思路和拟解决的问题101.5参考文献102.材料和方法162.1组织样本收集

2、162.2苏木精-伊红染色及肿瘤比例检测162.3免疫组织化学染色172.4RNA/DNA共提取及cDNA的制备192.5PCR和基因测序202.6石蜡切片DNA提取及基因测序212.7荧光原位杂交(FISH)242.8统计学分析253.实验结果263.1研宄样本的质量控制263.2癌基因驱动突变cDNA测序筛选313.3石蜡切片DNA提取及基因测序验证354.itit384.1鳞癌的病理诊断384.2鳞癌的癌基因驱动突变394.3肺鳞癌癌基因驱动突变的筛选策略404

3、.4参考文献435.鮮466.雜477.发表论文608.删612复旦大学硕士学位论文中国人群肺解痦癌基因驱动突变分析研宄中文摘要肺癌作为目前最常见的恶性肿瘤之一，在肿瘤相关死亡率中仍然占首位，其中，晚期非小细胞肺癌5年生存率只有15%。非小细胞肺癌主要包括肺腺癌，肺鳞癌和大细胞癌，其中肺鳞癌占所有非小细胞肺癌的40%左右。与肺腺癌相比，肺鳞癌不仅突变发生率较低，而且由于既往研宄对于肺鳞癌病理诊断描述不清，肺鳞癌中是否存在EGFR及KRAS突变尚存争议，给临床靶向治疗前的基因突变筛查带来了

4、很大的困难。针对当前肺鳞癌癌基因驱动突变研究领域存在的问题和争议，开展了本项研宄。本项研究收集复旦大学附属肿瘤医院2008-2011年临床病理诊断为肺鳞癌的手术切除新鲜冰冻标本及对应石蜡组织标本310例，所有标本均由2位病理学家再次行光镜下病理复诊，筛选出镜下伴有明显腺癌成分的鳞癌44例，266例镜下无明显腺癌成分或难以分辨腺癌成分的鳞癌行TTF-1染色发现26例呈TTF-1灶阳性或散在阳性，240例TTF-1阴性的鳞癌经CK7染色发现25例呈CK7灶阳性或散在阳性，215例呈CK7阴性。所有样本均呈P63

5、阳性或CK5/6阳性。310例鳞癌共包括95例伴有腺癌成分的鳞癌和215例纯鳞癌。通过对各亚组进行癌基因突变筛选，包括EGFR、KRAS、BRAF、HER2、PIK3CA、AKT1、DDR2、ALK及RET，各亚组突变率分别为伴有腺癌成分的鳞癌组（26/95，27.4%)，包括镜下明显腺癌成分组（11/44，25%)、TTF-1阳性组（13/26，50%)、CK7阳性组（2/25，8%)，纯鳞癌组（10/215,4.7%)。95例伴有腺癌成分的鳞癌共发现EGFR突变11例、KRAS突变8例、BRAF突变1例

6、、HER2突变1例，PIK3CA突变5例，EML4-ALK融合2例。215例纯鳞癌共发现PIK3CA突变7例、AKT1突变1例、DDR2突变1例、EGFR突变1例。两组均没有发现RET融合基因。EGFR、KRAS突变主要出现于伴有腺癌成分的鳞癌组，与腺癌成分密切相关。通过对4例镜下伴有明显腺癌成分的鳞癌行显微切割石蜡切片DNA测序验证发现2例样本存在EGFR突变异质性。本课题研究发现临床病理诊断的肺鳞癌约有30%含有一定比例的腺癌成分，结合免疫组化进行准确的病理诊断及分类是肺鳞癌进行临床突变筛查的前提。伴有

7、腺癌成分的肺鳞癌突变谱倾向于腺鳞癌，主要突变为EGFR，KRAS,BRAF,HER2,ALK及PIK3CA。纯鳞癌的突变发生率较低，主要突变为AKT1、DDR2及PIK3CA，临床可不做EGFR，KRAS,BRAF,HER2，ALK等突变筛查。由于目前对具有两种成分的肺鳞癌或腺鳞癌是否存在突变异质性尚存争议，临床标本取材时应尽量包括两种成分。由于鳞癌中腺癌成分比例较少，实际取材过程中容易造成漏取，因此应对于原发灶无突变的患者应进行长期随访，如出现转移灶，应对转移灶进行再3复旦大学硕士学位论文次活检，重新进行

8、转移灶病理诊断及基因突变测序检测。本课题的研宄结果可以对临床肺鳞癌癌基因驱动突变筛选提供参考，具有临床实用性。纖词肺鳞癌免疫组化EGFR突变KRAS突变突变筛查中图分类号：R734.24复旦大学硕士学位论文AnalysisofOncogenicDriverMutationsinLungSquamous-CellCarcinomaFromChinesePopulationAbstractLungcancerisst