牙鲆生长性状qtl定位及其遗传效应分析

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1、学校代码：10264研究生学号：M090101076上海海洋大学硕士学位论文题目:牙鲆生长性状QTL定位及其遗传效应分析MappingandGeneticEffectAnalysisof英文题目:QTLsRelatedtoGrowthTraitsofOliveflounder（Paralichthysolivaceus）专业:水产养殖研究方向:水产动物遗传育种姓名:牛余泽指导教师:陈松林研究员二O一二年五月牙鲆生长性状QTL定位及其遗传效应分析MappingandgeneticeffectanalysisofQTLsrelatedtogrowthtraitsofolivef

2、lounder（Paralichthysolivaceus）学位论文完成日期：指导教师签字：答辩委员会成员签字：上海海洋大学学位论文原创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外，本论文不含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律后果由本人承担。学位论文作者签名：年月日上海海洋大学学位论文版权使用授权书学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和

3、电子版，允许论文被查阅或借阅。本人授权上海海洋大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。保密□，在年解密后适用本版权书。本学位论文属于不保密□学位论文作者签名：指导教师签名：日期：年月日日期：年月日牙鲆生长性状QTL定位及其遗传效应的分析摘要本研究从用牙鲆(Paralichthysolivaceus)日本群体和韩国群体杂交建立的33个牙鲆家系中选取双亲及子代生长性状有明显差异的16个家系，并用8对在其它家系中呈现多态的微卫星对这16对亲本检测，选取分离情况最优的1号家系的92个F1个体作为本次试验的分

4、离群体。测量了分离群体的全长、体重、体高三个生长性状，全长性状的值介于19.3-28.0cm，平均值+标准差为23.67+2.12cm；体重性状的值介于30.2-207.0g，平均值+标准差为118.29+37.89g；体高性状的值介于6.4-10.0cm，平均值+标准差为8.36+0.87cm。并对数据进行正态检验、相关性分析和主成分分析处理，结果显示全长偏离正态分布，体重和体高性状符合正态分布；三个性状之间两两存在极显著相关，Pearson相关系数从0.810-0.880；最终得到一组可解释三个性状的89.592%特征的数据，命名为牙鲆生长性状GT。400个微卫星经过多

5、态性筛选、PCR扩增样本后，取带型清晰的微卫星标记共221个用于连锁图谱构建。利用Joinmap4.0软件对所有分离的微卫星标记进行连锁分析和构建连锁图谱，雌性图谱中，共178个微卫星标记定位到22个连锁群上，其中包含一个三联体。雌性图谱观察总长度为（Goa）599.0cM，平均距离为（s）3.84cM。连锁群上的标记数为3-16个，单条连锁群的图距为6.1-59.5cM。图谱的预期长度为（Ge）785.4cM,总的图谱覆盖率（Coa）达76.27%。雄性图谱中，共194个微卫星标记定位到23个连锁群上，其中包含一个三联体。雄性图谱观测总长度（Goa）为693.4cM，平均

6、距离为（s）4.05cM。连锁群上的标记数为3~16个，单条连锁群的图距为9.6~57.2cM。图谱的预期长度（Ge）为879.7cM，总的图谱覆盖率达（Coa）78.82%。用WinQTLCart2.5软件的复合区间作图在已构建的遗传连锁图谱上对牙鲆生长性状GT进行QTL定位，取LOD经验值2.5为QTL存在的阈值；对微卫星标记进行性状-标记之间的回归分析。本研究共定位3个与牙鲆生长性状GT相关的QTLs，qGT-f4qGT-m20qGT-f20，可解释表型变异率分别为27.60%，13.74%，10.27%。在性状-标记之间的回归分析中，得到22个与生长性状GT相关(p

7、<0.05)的微卫星标I记，单个标记可解释表型变异率介于3.70%-10.42%之间，其中6个微卫星标记scaffold558_51720、scaffold558_26183、scaffold903_69232、scaffold485_47120、scaffold1262_77386、scaffold809_65154与生长性状GT之间呈极显著相关(p<0.01)，可解释表型变异率分别为10.42%、7.31%、10.07%、10.07%、8.39%、11.26%。本研究是首次牙鲆生长性状QTL定位的研究，研究得到