视网膜色素变性患者视网膜色素变性1基因突变的检测分析

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1、分类号：R77单位代码：10752密级：公开学号：2009171宁夏医科大学硕士研究生学位论文视网膜色素变性患者视网膜色素变性1基因突变的检测分析MutationsAnalysisofRetinitisPigmentosa1geneinChinesePatientswithRetinitisPigmentosa学位申请人：闫光辉指导教师：盛迅伦教授申请学位门类级别：医学专业名称：眼科学研究方向：遗传性视网膜疾病所在学院：临床医学院论文完成日期：二〇一二年四月宁夏医科大学研究生院NingxiaMedi

2、calUniversityThesisforApplicationofMaster’sDegreeMutationsAnalysisofRetinitisPigmentosa1geneinChinesePatientswithRetinitisPigmentosaStudent’sName:YanGuanghuiSupervisor：Prof.ShengXunlunSubjectCategory:MedicalScienceMajor:OphthalmologySpecialty:Hereditar

3、yRetinalDiseaseCollege:ClinicalInstituteCompletionDate:Apr.2012宁夏医科大学学位论文独创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文，是个人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果，无抄袭及编造行为。除文中已经特别加以注明引用的内容外，本论文不含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明确方式标明并致谢。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。论文作者签名＿＿＿＿＿论文导师签名＿＿＿＿

4、＿年月日年月日宁夏医科大学关于学位论文使用授权的声明宁夏医科大学有权保留使用本人学位论文，同意学校按规定向国家有关部门机构送交论文的复印件和电子版，允许被查阅和借阅。本人授权宁夏医科大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或其他复印手段保存和汇编本学位论文。可以公布（包括刊登）论文的全部或部分内容。（保密论文在解密后应遵守此规定）论文作者签名＿＿＿＿＿论文导师签名＿＿＿＿＿年月日年月日宁夏医科大学硕士研究生学位论文中文摘要视网膜色素变性患者视网膜色素变性1基因突

5、变的检测分析摘要目的视网膜色素变性（retinitispigmentosa,RP）是一组常见的单基因遗传性、致盲性眼病，目前尚无有效的治疗方法。目前，通过连锁分析和候选基因筛查，已发现63个基因与RP有关。RP1基因突变占ADRP致病突变的2%～7%，仅次于RHO和RDS。本研究的目的是研究RP1基因在宁夏地区RP患者中的突变频率及特征，进一步探讨其在RP发病机制中的潜在作用。方法按国际通用的RP诊断标准收集宁夏回族自治区110例RP患者，其中包含35例常染色体显性遗传性RP（ADRP）患者和75例

6、散发患者（SRP）为RP患者组，同时收集100例正常对照者为正常对照组，抽取外周静脉血3～5ml，EDTA抗凝，采用DNA提取试剂盒（北京天根生化科技有限公司）提取全基因组DNA。按基因库的RP1基因序列资料（GeneBank登录号：NG_009840），参照Payne等报道的方法对RP1基因进行PCR引物设计，在设计引物时使其扩增区域覆盖RP1基因的4个外显子及其附近拼接位点中的内含子，共设计、合成21对引物。应用聚合酶链反应（polymerasechainreaction,PCR）和直接测序法进

7、行RP1基因全编码区和邻近剪切位点的内含子区域序列突变的检测。运用多因素分析和基于网络的评分软件PolyPhen、SortingIntolerantFromTolerant（SIFT）对研究结果进行分析。结果RP患者组和正常对照组RP1基因共检测出11个变异位点，其中错义突变6个：p.Gly706Arg、p.Arg872His、p.Asn985Tyr、p.Ala1670Thr、p.Ser1691Pro、p.Cys2033Tyr，同义突变3个：p.Gln1008Gln、p.Lys1152Lys、p.G

8、ln1725Gln，非编码区域突变2个：c.788-92T>C、c.*247A>C。p.Lys1152Lys和c.*247A>C为新发现的突变位点。RP患者2组第3内含子c.788-92T>C的突变频率与正常对照组相比差异有统计学意义（χ=9.12,I宁夏医科大学硕士研究生学位论文中文摘要P<0.01）；3’-侧翼序列区c.*247A>C的突变频率高于正常对照组，差异有统计学意义2（χ=12.77,P<0.01），且与RP发生呈显著正相关（r=1.11,P<0.05）