xshell画骨架图

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时间:2019-02-10

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1、ShelXTL画图ShelXTL画图非常灵活,可以画出很多类型的图。XP功能强大,灵活应用XP可以快速画出很多有用的简洁好看的图。1.在XSHELL里面画图,转换为ChemDraw图,XP画图。可以转化为ChemDraw格式,2.可以画出热椭球JPG图,XP输出PDF图。3.可以画配位环境骨架图,分子图,堆积图等等。以下我们介绍用ShelXTL画骨架图。我们首先用XSHELL画骨架图,这种画图方法是比较简单的。XSHELL画配位环境图如下图所示,为XSHELL画出来的分子中的金属原子Rh六配位配位环境图。1.右击和金属原子直接键连的原子“

2、Cl4”,在出现的菜单里面选择“BondWith...”,鼠标指针会变成十字叉,同时拖出一根连接线。然后将十字叉移动到原子“Se2”上单击,连接Cl4和Se2。重复以上方法依次连接赤道上的各个原子,然后连接顶点和赤道上的原子,得到如图所示的四角双锥配位结构图。2.热椭球图。XSHELL输出图片必须是球形图或者热椭球图。右击XSHELL在菜单选择第三项的“ThemalEllipsoid”。XSHELL会变为如图所示的热椭球图的效果。3.输出JPG格式的图片。点击XSHELL的Rendor菜单。选择彩色“Colour”或者黑白“Whitean

3、dBlack”,再选择“ToHigh-QualityJPEG...”。在出现的输出控制面板上把输出文件目录“C:UserschendengfeiDesktop例子.jpg”是没有文件名的,我们要加上个文件名。BondWith...菜单。如图连接出来的赤道平面的四边形。如图是连接好的四角双锥Rh的配位环境。热椭球图选项。热椭球图显示的结构分子图。Rendor菜单。选择“Colour”或“WhiteandBlack”,再选择“ToHigh-QualityJPEG...”。“C:UserschendengfeiDesktop例

4、子.jpg”是没有文件名的,我们要加上个文件名。XP画骨架图我们先约定:XP输入的命令我们用黑体标出。“\”后面的内容是注释。FMOLLESS$Q$H\读入非Q峰非H的数据;PROJ\XP看图KILLC25CL1TOCL3\删除溶剂分子氯仿;MPLN/N\显示重叠最小的分子图;PROJ\产看效果,同时用右侧的按钮微调分子图;LINKCL4SE2\连接原子CL4和原子SE2,得到配位骨架图。下同;LINKSE2C19\LINKC19SE3\LINKSE3CL4\LINKSE1CL4\LINKSE1SE2\LINKS

5、E1C19\LINKSE1SE3\LINKP1CL4\LINKP1SE2\LINKP1C19\LINKP1SE3\LABL1450\元素符号的字号大小;TELP0-300.05\输出Plotfile,为draw命令做准备;DRAWS\画Plotfile为输出文件;A\DRAW要求的输出文件的类型,A为Adobe的PS文件格式;S\输出的PS文件的文件名,骨架Skeleton,所以是S;C或ENTER\输出文件的颜色类型,回车时黑白,C是彩色。删除三苯基膦的三个苯环后的配位骨架图KILLC1TOC18\删除三个苯环

6、;LABL1500\TELP0-300.05\DRAWS1\A\DRAW要求的输出文件的类型,A为Adobe的PS文件格式;S1\输出的PS文件的文件名,骨架Skeleton,S1为了区别S;C或ENTER\输出文件的颜色类型,回车时黑白,C是彩色。删除非配位原子后的骨架图KILL$CLESSC19\删除非配位的C原子;KILLN1N2\删除非配位的N原子;LABL1550\TELP0-300.05\DRAWS2\A\DRAW要求的输出文件的类型,A为Adobe的PS文件格式;S2\输出的PS文件的文件名,骨架S

7、keleton,S2为了区别;C或ENTER\输出文件的颜色类型,回车时黑白,C是彩色。个性化的XP图我们可以用LINK命令的参数改变键的类型来实现个性化的配位环境图。我们选择赤道平面上的原子用OPEN,FULLLINE类型的线连接,即参数2,和极轴原子相连的用默认参数如上图所示。HELPLINK\说明:输出如下内容1:solid(TELPandPERS),fullline(DIAGandPROJ)实心粗线,XP默认的原子间的键;2:open(TELPandPERS),fullline(DIAGandPROJ)空心粗线,没有填充颜色的

8、键;3:dashedsolid(TELPandPERS),dashes(DIAG,PROJ)间断实心粗线;4:dashedopen(TELPandPERS),dashes(DIAG,PROJ)

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