pte患者吞噬细胞与nk细胞相关基因mrna差异性表达的意义

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1、摘要背景静脉血栓栓塞症(venousthromboembolism,VTE)是一种环境和/或遗传因素参与的常见病、多发病。近年,有学者提出炎症免疫反应在VTE的发病机制中可能发挥重要作用。吞噬细胞及NK细胞作为重要的非特异性免疫细胞及炎症因子的效应细胞,其在炎症及免疫调节中的作用逐渐引起研究者的兴趣。目的应用人类全基因组表达谱芯片技术检测吞噬细胞及NK细胞相关基因mRNA在PTE中的表达水平,探讨两者在PTE中可能的作用。方法随机收集20例P1飞患者及20例性别、年龄与之匹配的对照者,抽取外周血单个核细胞总RNA,合成Cy

2、3标记的P1rE组和对照组的cRNA探针,与Agilent人类全基因组oligo芯片杂交。杂交后进行图像扫描,并使用GeneSpringGX数据分析软件对基因芯片原始信号值进行荧光、背景、标准化参数设定及稳健多芯片平均标准化分析处理。将PTE组与对照组标准化基因信号强度采用两类样本比较随机方差参数T检验,筛选吞噬细胞及NK细胞相关基因mRNA表达信息,显著差异基因筛选标准为p<0.05。采用FQ.PCR对部分基因的芯片检测结果进行检测以验证基因芯片的可靠性。结果检测出吞噬细胞相关基因mRNA表达条带8条(CDlla、CDl

3、4、CDl6b、CD32a、CD32b、CD35、MRC2、SCRABl),且PTE组mRNA表达均高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。检测出NK细胞相关基因mRNA片段18条:与对照组相比,盯E组杀伤细胞凝集素样受体(KLR)、杀伤细胞免疫球蛋白样受体(ⅪR)及自然细胞毒受体(NCR)mRNA表达呈下调趋势,KIRmRNA表达差异无统计学意义(P>O.05);KLR中KLRC2、KLRC4mRNA表达呈下调趋势,但差异无统计学意义(P>0.05);KLRBl、KLRCl、KLRC3、KLRDl、KLRFl、KL

4、RGl、KLRKlmRNA表达下调,差异有统计学意义(P0.05)。结论P1E组吞噬细胞表面受体mRNA显著高于对照组,提示其功能异常活化;NK细胞表面受体mRNA下调,提示NK细胞的自然杀伤功能受抑制:炎症与PTE相关。关键词静脉血栓栓塞症,肺血栓栓塞症,基因表达,炎症,吞噬细胞,NK细胞HumanGenomeOligoMicroarraywasperformed.Thelevelofex

5、pressionofaparticulargeneisdirectlyassociatedwiththeintensityofhybridizationoflabeledmRNA.FluorescenceintensitieswerequantifiedusingtheGeneSpringGXarraytools.Allthedatasareeliminatedthesystematicerrorbetweenchips,operatorsandoperationbyrobustmultichipaverage(RMA).

6、CalculatearithmeticmeanandT-testofstochasticvolatilitytogetPvalue.ThedifferentialexpressedgenewasdefinedwhenitsPvaluewaslessthan0.05.FourgenesWasrandomlyselectedtobeprovedbyfluorescencequantitativePCR(FQ-PCR).ThenweselectedthegeneassociatedwithphagocytesandNKcells

7、fromthemicroarray.Results8piecesofmRNAfragmentsassociatedwithphagocyteswerescreenedandallthegeneswereremarkablyupregulatedin盯Egroupcomparedwithcontrolgroup(p<0.05).18piecesofmRNAfragmentsassociatedwithNKcellswerescreened.Incomparisonwithcontrols,themRNAexpressiono

8、fkillercelllectin—likereceptors(KLR)、killercellimmunoglobulin-likereceptors(KIR)andnaturalⅡABSTRACTcytotoxicityreceptors(NCR)inP1陋groupwerelowerthanthat

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