含寡聚腺嘌呤序列dna探针在金纳米粒子上的固定及杂交性能

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1、含寡聚腺嘌呤序列DNA探针在金纳米粒子上的固定及杂交性能  摘要利用寡聚腺嘌呤序列(OAS)与金的强相互作用,在金纳米粒子(AuNPs)上固定不同密度DNA探针(DNAprobe),详细探究不同条件(OAS长度、AuNPs粒径、NaCl浓度等)下单链DNAprobe的固定效果,以及制备的纳米探针(Au.probe)与互补DNA目标分子(DNAtarget)的杂交性能。利用透射电子显微镜(TEM)、紫外可见分光光度计(UV.Vis)、激光粒度仪等对制备的AuNPs的形貌、粒径、表面DNAprobe固定及杂交性能等进行了

2、研究。结果表明,随OAS碱基数量由10增加到30和50,Au.probe上固定的DNAprobe数量降低。对粒径为10.2和24.3nm的AuNPs,杂交效果最佳的NaCl浓度分别为300和25mmol/L。随着AuNPs粒径增大,AuNPs单位面积上的DNAprobe固定量及DNAtarget杂交量均呈下降趋势。  关键词寡聚腺嘌呤序列;金纳米粒子;DNA固定;DNA检测;杂交性能  1引言  生物纳米分析技术是涵盖化学、物理学、生物学和医学等多学科技术的新兴技术。DNA和金纳米粒子(AuNPs)具有诸多独特、优良

3、的分析特性,二者复合而成的新型纳米材料被广泛应用于微纳结构构建[1~3]、基因治疗[4~6]、生物传感[7~9]等领域。10  DNA在AuNPs上的固定主要基于共价作用,包括AuS键[9~11]、AuN键[12]及AuC键[13]等。最常见的方法是利用AuS相互作用将含巯基的单链DNA固定到AuNPs表面,可通过DNA与小分子硫醇混合自组装,或后期利用小分子硫醇的取代反应,控制AuNPs表面DNA密度。但对AuNPs上固定的DNA密度的精确调控依然是研究的难点[14]。  最近研究表明,寡聚腺嘌呤序列(Oligoa

4、deninesequence,OAS)可与Au表面优先吸附,亲和力与AuS键相当。Opdahl等[15~17]发现,可通过控制OAS长度精确控制单链DNA在Au基底上的接枝密度与构型,并系统研究了OAS与Au基底相互作用,以及DNA表面相互作用对其杂交稳定性的影响。Pei等[18]及Nourisaeid等[19]在比色法检测DNA研究中,实现了不经修饰、双嵌段DNA制备的AuNPs探针间的快速杂交。Jiang等[20]利用该方法,设计了一种基于RNA适配体的AuNPs传感器检测血液中的茶碱。Zhu等[21,22]利用

5、OAS构建了以核.卫星结构的金/银硅基纳米杂化增强的SERS生物传感器,并用于Hg2+及Pb2+的高灵敏、特异性检测。与利用AuS相互作用相比,这种方法操作更简单,可控性更好,可以更方便控制DNA密度。这些研究均采用13nm左右AuNPs,对不同尺寸AuNPs上含OAS单链DNA的固定及杂交行为的研究目前未见报道。  本研究考察了含OAS的单链DNA探针(DNA10probe)在不同尺寸AuNPs上的固定及杂交行为。通过种子生长法制备了一系列不同粒径、分散性良好的AuNPs,利用OAS.Au间的相互作用制备了纳米探针

6、(Au.probe)。利用透射电子显微镜(TEM)、紫外.可见分光光度计(UV.Vis)、激光粒度仪等对Au.probe进行了表征,并系统研究了不同离子强度、OAS长度及不同AuNPs粒径下,DNAprobe的固定及杂交行为,为其在生物传感、基因诊断等领域的应用提供了实验基础。  2实验部分  2.1仪器与试剂  UV.2550型紫外可见分光光度计(日本岛津有限公司);HT7700透射电镜(日立仪器有限公司);ZS90激光粒度分析仪(英国马尔文仪器有限公司);XYF2.20.H超纯水机(北京湘顺源科技有限公司);TH

7、Z.100B恒温培养摇床(上海一恒科学仪器有限公司)。  氯金酸(HAuCl4?4H2O,天津市金铂兰精细化工有限公司);含OAS单链DNA(上海生工生物工程有限公司,序列见表1);柠檬酸钠(C6H5Na3O7?2H2O)、NaH2PO4、Na2HPO4、NaCl(阿拉丁试剂);所用实验试剂均为分析纯;实验用水为超纯水(电阻率18.25MΩ?cm)。  2.2实验过程  2.2.1AuNPs制备参照文献[23\]的方法,在三口烧瓶中加入150mL2.2mmol/L柠檬酸钠溶液,快速搅拌,加热至沸腾。加入1mL25mm

8、ol/L氯金酸溶液,煮沸10min后,取30.2mL,记为G0。将温度降至90℃并恒温,加入1.6mL25mmol/L氯金酸和1.6mL60mmol/L柠檬酸钠溶液,每隔30min重复加入适量试剂并取出适量AuNPs样品(即不同代数的AuNPs,记为G1、G2……G8),在冰水混合物中降温后,利用UV.Vis、TEM和激光粒度仪进行表征。  2

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