资源描述：
《高通量测序研究松茸菌柄土壤.docx》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、高通量测序研究松茸菌柄土壤细菌群落结构*叶雷1,4付雨1,2李强1,2王强峰3张波1,4邹捷1,4亢宗静1,4张笑萍1,4李小林1收稿日期Received:接受日期Accepted:*四川省食用菌创新团队资助SupportedbytheSichuanMushroomInnovationTeam.**通讯作者Correspondingauthor(E-mail:kerrylee_tw@sina.com)1四川省农业科学院土壤肥料研究所成都6100662四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室成都6100653四川省农业科学院生物技术核技术研究所
2、成都6100614四川农业大学资源学院成都611130摘要研究松茸菌柄附着土壤细菌群落结构对了解松茸-菌柄根际微生物互作关系具有重要意义。本文采用IlluminaHiseq2500平台高通量测序的方法，研究松茸菌柄附着土壤的细菌群落结构，分析微生物因素对松茸的形成和生长的影响，通过高通量测序共获得了6730条质控序列，这些序列按照97%的相似度被分为928个操作分类单元（Operationaltaxonomicunits，OTUs），这些OTUs又被分为22个细菌门，2个古细菌门，62个细菌纲，4个古细菌纲，90个细菌目，6个古细菌目，162个细菌科，7个
3、古细菌科，275个细菌属，8个古细菌属。在门的水平，变形菌门（proteobacteria）在所有样本中均占主导，且在松茸菌柄土壤样本中高于对照样本，从纲的水平来看，β-变形菌门（Beta-proteobacteria）占主导，且在松茸菌柄土壤样本中高于对照样本，从属的水平看，伯克氏菌属(Burkholderia)，隶属于变形菌门在松茸土壤样本中的丰度显著高于对照，这表明变形菌门对松茸的生长可能具有积极贡献，尤其是伯克氏菌属。此外，一些菌可能对松茸的生长具有消极贡献，如unknown-Ellin60等。结果表明细菌可能参与了松茸的生长和子实体的形成，但与细
4、菌的丰富度不成正相关，这对松茸的人工种植具有重要理论指导意义。关键词松茸；菌柄；土壤细菌群落；高通量测序CLCS567.3+9StudyonbacterialcommunitystructureofTricholomamatsutakestipesoilbyhigh-throughputsequencingYELei1,4,FUYu1,2,LIQiang1,2,WANGQiang-feng3,ZHANGBo1,4,ZOUJie1,4,KANGZhong-jing1,4,ZHANGXiao-ping1,4,LIXiaolin1**1SoilandFertil
5、izerInstitute,SichuanAcademyofAgriculturalSciences,Chengdu610066,China2KeylaboratoryofBio-ResourcesandEco-EnvironmentofMinistryofEducation,CollegeofLifeScience,SichuanUniversity,Chengdu,610065,China3BiotechnologyandNuclearTechnologyResearchInstitute,SichuanAcademyofAgriculturalSci
6、ences,Chengdu610061,China4CollegeofResource,SichuanAgriculturalUniversity,Chengdu611130,ChinaAbstractObjectives:ThestudyofthebacterialcommunitystructureofTricholomamatsutakestipesoilholdsagreatsignificanceforunderstandingtheinteractionbetweenT.matsutakeandtherhizospheremicroorgani
7、smsofstipesoil.Methods:Weusedhigh-throughputsequencingtechnologybasedonIlluminaHiSeq2500(SanDiego,CA,USA)toexplorethebacterialcommunitystructureinsoilsattachedtostipeofT.matsutakeandanalyzetheeffectsofmicroorganismsontheformationandgrowthofT.matsutake.Results:Weobtainedatotalof673
8、0sequencesfromthesamplesandcluste
