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1、分子连接性指数的种类ABC1.陈艳,冯长君.部分有机污染物气相色谱保留指数的QSRR研究[J].计算机与应用化学,200724(10):1404~1408.理论与方法:距离调和指数Tc的定义和计算:用隐氢图来表示化学结构,隐氢图中的顶点和边分别对应分子结构中的基团(或非氢原子)和化学键。用距离矩阵D描述分子中基团的连接性,设隐氢图中有n个顶点,则距离矩阵D=[dij]n×n,dij为分子结构中基团i和基团j之间最短路径上的化学键数(也称拓扑距离)。距离矩阵中每一行的矩阵元dij之和以Si表示,由
2、此构成S矩阵。为了区分杂原子和多重键,对拓扑距离进行修正,用相对键长取代拓扑距离。相对键长定义如下:规定C-C键的键长为1.0,以便和相邻碳原子间的拓扑距离为1一致,其它各类相邻顶点间的拓扑距离则定义为相应的键长与C-C键键长的相对值,例如:C-O键的相对键长为1.43/l.54=0.9286;C=O键的相对键长为1.22/1.54=0.7922,依次类推。以乙酸甲醋为例,其隐氢图及D矩阵和S矩阵为:定义S矩阵中矩阵元(Si)的调和平均数的平方根为距离调和指数,用Tc表示。即:式中“Σ”是对分子
3、中每个原子求和,例如乙酸甲醋的Tc值为:D1.堵锡华,陈艳,冯长君.连接性指数与多氯化萘理化性质的相关研究[J].科中技人学学报(自然科学版),2006,36(11):124~128.理论与方法:考察文献所列75种多氯化萘(PCNs)分了的结构与其正辛醇/空气分配系数1gkOA和过冷液体蒸汽压lg(pL/Pa)的变化规律,发现PCNs的这些性质与氯原了数日及在环上的位置密切相关,为此,本文在文献方法基础上,提出一种新的原子点价值:式中:Φi为第i个非氢原了点价,Xi为该原了的电负性(Paulin
4、g标度);XC为碳原了的电负性值;hi为与该原了直接连接的氢原了数。式中的是对杂原了与碳原了的电负性值首先进行校正,在减去2.25的基础上(通过反复试验基础上得出的最佳值),得到杂原了相对于碳原了的电负性值,这一相对值能反映出连接在碳原了上的杂原了的电了构象,也能蕴涵分了中原了的化学环境,对于萘环上连接的氯原了点价值,考虑到不同位置的氯原了对分了的贡献有所不同,因此对式进行修正:式中Ni表小蔡环上连接的各个氯原子的位置数。根据式可以计算得到连接在1~8位的氯原子的ΦCl值分别为:ΦCl1=12.
5、740,ΦCl2=13.347,ΦCl3=13.953,ΦCl4=14.560,ΦCl5=15.167,ΦCl6=15.773,ΦCl7=16.380,ΦCl8=16.987。EFGHIJKLOP5.彭国文,肖方竹,聂长明.烷氧基氯硅烷类化合物气相色谱保留指数与结构关系研究[J].南华大学学报(自然科学版),2007,21(3):6~9.理论与方法:对于由n个顶点构成的分子图,其距离矩阵是一个n×n对称矩阵,本文提出的一组拓扑指数来源于距离矩阵,定义为:其中n为分子隐氢图中的原子数。由于化合物的
6、性质因成键原子的支化度不同而不同。因此本文考虑到在距离矩阵D中第一列增加各原子支化度参数Bi,Bi按下式定义:Bi=Zi-hi+1式中Zi表示与分子中原子i的核外价电子数,hi表示与原子i相连的氢原子数。考虑到烷氧基氯硅烷化合物类的中心原子Si的特殊性,其支化度定义为Bsi=Zsi-hi+3同时我们考虑用分子中原子i的平衡电负性对分子图的顶点着色,在距离矩阵D的第二列再增加各原子的平衡电负性的开方的倒数得:其中ei=,xi表示原子i的平衡电负性。然后对Qm作如下处理:M=Qm×其中为Qm的转置矩
7、阵,则新的拓扑指数NPm定义为:NPm=ln(λi,m)其中λi,m为矩阵M的特征值之和。由于随着原子边间距的增加,原子的相互作用越来越小,一般取m=1,2,3的一组拓扑指数NP1、NP2、NP3即能较好的表征分子的结构信息,因此式中m取1,2,3。例如甲烷氧基三氯硅烷的隐氢图及增广矩阵为:可得到甲烷氧基三氯硅烷的NP1、NP2和NP3值分别为5.7241,5.8641,5.8584。我们用上述方法对烷氧基氯硅烷类化合物进行了计算。QRS1.舒元梯.氯代苯生物活性的分子拓扑研究[J].达县师范高
8、等专科学校学报,2006,16(5):46~49.(3)式(3)中,δi为第i原子的点价,xP为i原子的pauling电负性值,hi为i原子直接键连的成σ键的氢原子数目,σi为i原子成σ键的电子数,np为i原子在形成离域π键时所提供的Pz电子数,3.98为氟元素的Pauling电负性。例:对氯甲苯(4-氯甲苯)(P-ClC6H4CH3)-CH3碳原子,=C<,-CH=碳原子,-Cl原子的原点价分别为:δ(-CH3)=2.55[4-30.125-lgl]/3.98=1.8278δ(=C<)=2.5
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