关于dna序列的数学建模论文

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1、承诺书我们仔细阅读了中国人学生数学建模竞赛的竞赛规则.我们完全明白,在竞赛开始后参赛队员不能以任何方式(包括电话、电子邮件、网上咨询等)与队外的任何人(包括指导教师)研宄、讨论与赛题有关的问题。我们知道,抄袭别人的成果是违反竞赛规则的,如果引用别人的成果或其他公开的资料(乜括网上查到的资料),必须按照规定的参考文献的表述方式在正文引用处和参考文献中明确列出。我们郑重承诺,严格遵守竞赛规则,以保证竞赛的公正、公平性。如冇违反竞赛规则的行为,我们将受到严肃处理。我们参赛选择的题号是(从A/B/C/D中选择一项填写):A题我们的参赛报名号为(如果赛区设罝报名号的话):0531所属学校(请

2、填写完整的全名):德州学院参赛队员(打印并签名):1.刻岩2.李现全3.孙在龙指导教师或指导教师组负责人(打印并签名):张志广王金禅日期:2011年_8月8曰赛区评阅编号(由赛区组委会评阅前进行编号):编号专用页赛区评阅编号(巾赛区组委会评阅前进行编号):赛区评阅记录(可供赛区评阅时使用):评阅人评分备注全国统一编号(巾赛区组委会送交全国前编号):全国评阅编号(由全国组委会评阅前进行编号):DNA序列分类[摘要]:本文通过对DNA分子的研宄分析,对其进行简单及更深入的分类。由提示,将20个DNA单分子链中“TAGC”数量及百分含量数学统计,并运用欧式和马氏距离判别分析分析,检验两种

3、的准确性,选出较高优化的方式科学地把要求的DNA序列分为八类,B类,依据此方法完成后20个及182个自然DNA分子单链的分类。得出了所求20个人工制造序列及182个自然序列的分类结果如下:(1)、20个人工序列:A类:21、24、26、28、30、31、32、33、38、40。B类:22、23、25、27、29、34、35、36、37、39。(2)经检验欧式优化度高,欧式进行对182个自然DNA分子分类:A类:4、5、6、8、9、11、13、14、15、16、17、18、19、20、21、27、29、31、32、33、35、36、38、39、41、42、44、45、46、47、49

4、、52、53、55、58、59、60、61、62、64、66、67、68、69、70、71、73、77、79、81、82、87、89、90、91、93、95、96、100、101、104、105、106、108、109、110、112、115、117、118、120、124、132、134、135、136、139、141、145、148、150、154、155、158、172、173、177.B类:1、2、3、7、10、12、,22、23、24、25、26、,28、30、34、37、40、43.、48、50、51、54、56、57、63、65、72、74、75、76、78、80、8

5、3、84、85、86、92、94、97、98、99、102、103、107、111、113、114、116、119、121、122、123、125、126、127、128、129、130、131、137、138、140、142、143、144、146、147、149、151、152、153、156、157、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、174、175、176、178、179、180、181、182。问题重述人类基因组计划中DNA全序列草图由4个字符A,T,C,G按一定顺序排成的长约30亿的序列,其中没有“断句

6、”也没有标点符号,除了这4个字符表示4种碱基以外,人们对它包含的“内容”知之甚少,难以读懂。破译这部世界上最巨量信息的“天书”是二十一世纪最重要的任务之一。在这个目标中,研宄发现DNA序列具有一些规律性和结构。例如,在全序列中有一些是用于编码蛋白质的序列片段,即由这4个字符组成的64种不同的3字符串,其中大多数用于编码构成蛋白质的20种氨基酸。乂例如,在不用于编码蛋白质的序列片段中,A和T的含量特别多些,于是以某些碱基特别丰富作为特征去研宄DNA序列的结构也取得了一些结果。此外,利用统计的方法还发现序列的某些片段之间具有相关性,等等。这些发现让人们相信,DNA序列中存在着局部的和全

7、局性的结构,充分发掘序列的结构对理解DNA全序列是十分有意义的。作为研宄DNA序列的结构的尝试,提出以下对序列集合进行分类的问题:1)请从20个已知类别的人工制造的序列(其中序列标号1一10为A类,11-20为B类)中提取特征,构造分类方法,并用这些已知类别的序列,衡量你的方法是否足够好。然后用你认为满意的方法,对另外20个未标明类别的人工序列(标号21—40)进行分类,把结果用序号(按从小到大的顺序)标明它们的类别(无法分类的不写入)。2)同样方法对182个自然DN

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