《个人总结及展望》ppt课件

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1、个人总结及展望主讲人:胡玲玲12345下一步工作主要工作介绍毕业提纲设想所学所感目录其他工作1所学所感习惯与养成QQ?新浪?微博?……1.养成习惯,每天至少收一次邮件,最好用foxmail或outlook随时收邮件2.学会用中国知网、学术Google搜索论文3.每周实验室都会有组会,文体活动,希望积极参加去4.论坛59.77.16.75注册并仔细读实验室工作板块的置顶帖子……1所学所感研究生的开始一个简单的网站,根据用户输入的身份证前17位,计算第18位。2主要工作介绍-简介数据挖掘流程(1).确定业务对象(2).数据准备1)、数据的选择2)、数据的预处理3)、数

2、据的转换(3).数据挖掘(4).结果分析(5).知识的同化2主要工作介绍-miRNA简介介绍microRNAMicroRNA(miRNA),是一种长度约为18-29个核苷酸(nucleotides)的非编码小分子RNA。作为小分子RNA家族中的一员—MicroRNA已经受到广泛的关注,在2006年度诺贝尔生理学或医学奖就颁发给了小分子RNA的研究者。2主要工作介绍-miRNA简介介绍microRNA生物合成图2主要工作一介绍-miRNA预测综述从头计算的miRNA计算识别方法逐渐流行,很多研究者提出自己的识别算法并发展相应的软件,但是各个软件和算法的识别效率,应用

3、方法,功能范围等参差不齐,我们设计了一个新的测试数据集来衡量不同软件,方法的性能,为microRNA预测的研究提供参考。二级结构对RNA正常功能非常重要,有时甚至于较序列重要,这可以帮助用于分析非编码RNA,生物信息学的应用会使用一些二级结构的概念来分析RNA,所以我们分析了不同的二级结构预测软件。2主要工作一介绍-miRNA预测综述2主要工作二介绍-miRNA前体预测microRNA序列预处理特征提取预测分类器投票结果2主要工作二介绍-miRNA前体预测预测结果2主要工作三介绍-miRNA家族分类研究显示miRNA有利于疾病和药物设计的发展,我们发现同样的家族总

4、是拥有同样的发病机制和类似的工作机制,家族的研究一定程度上利于疾病和药物研究,我们提出了一种分层思想的家族预测方法,有效地预测miRNA的家族进而从PubMed中挖掘这个家族与一些疾病的关系。主要工作三介绍-miRNA家族分类特征提取方法:n-gram2miRNA一共有四种碱基(A,C,G,U),对于N-Gram我们使用N=1,2,3…为了提取n-grams,用一个大小为n的滑动窗口在miRNA序列的5’到3’之间扫描,在序列上的每一个位置,被长度为n的滑动窗口覆盖的子序列都对应与一个n-gram,随着窗口移动,每一个遇到的n-gram的出现频率被记录下来。主要工

5、作三介绍-miRNA家族分类用n-gram特征提取2主要工作三介绍-miRNA家族分类分层预测22主要工作三介绍-miRNA家族分类2主要工作四介绍-miRNA物种差异miRNA的降解或翻译抑制,对多种生物学过程起调控作用,在植物和动物中,miRNA执行这种调控作用的机理却不尽相同。同时miRNA在动植物体内的形成过程也存在很多的不同之处。动植物1)植物miRNA前体的茎环结构更大、更复杂,大约是动物中的3倍长。2)加工方式不同3)植物miRNA具有较高的进化保守性,因此,对植物miRNA目标基因的预测要相对简单。4)基因组上的存在位置不同。5)植物miRNA长度

6、多为21nt,而动物miRNA长度多为22~23nt。6)作用机制不同2主要工作四介绍-miRNA物种差异2主要工作四介绍-miRNA物种差异在生物进化过程中,动、植物从最后的共同祖先分化后,各自miRNA基因的进化是彼此独立的。但miRNA依然普遍存在于动、植物中,从一定侧面证明了miRNA对于生物个体形成和发展具有重要的意义。3其他工作多示例学习图像检索学习3其他工作多示例学习-多示例学习是与监督学习、非监督学习和强化学习并列的第四类学习框架,多示例学习被认为是基于事例的学习的最新进展,也是目前机器学习领域中最活跃的研究方向之一。3其他工作图像检索学习毕业论文

7、实习4下一步工作5毕业提纲设计毕业论文摘要microRNA(miRNA)的研究是目前生物信息学领域最重要的课题之一,MicroRNA已经受到广泛的关注,在2006年度诺贝尔生理学或医学奖就颁发给了小分子RNA的研究者。研究表明人类全部基因的三分之一都受到miRNA调控,miRNA重要的调控表达作用使越来越多的生物信息学研究人员致力于miRNA的预测,分类以及功能研究。本文从分析miRNA前体预测软件,家族分类以及不同种族miRNA功能差异分析出发,发掘最优miRNA前体预测分析软件,用最有软件预测前体miRNA,然后使用数据挖掘方法高效判定前体miRNA所属家族,

8、最后对mi

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