分子实验基本操作培训

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1、分子实验基本操作培训余涛,郑勤思2008-4-13Outline分子实验基本流程介绍分子实验基本操作的原理、步骤及注意事项总结分子实验基本流程介绍感受态的制备PCR克隆目的片断酶切及酶切片断回收(电泳)连接小提质粒并酶切鉴定(电泳)大肠杆菌的培养转化分子实验基本流程介绍感受态的制备PCR克隆目的片断酶切及酶切片断回收(电泳)转化连接小提质粒并酶切鉴定(电泳)大肠杆菌的培养分子实验基本操作——大肠杆菌的培养原理大肠杆菌在37℃下在较好较快的进行增殖,4℃下则可较好停止代谢,便于保存。(长期保存应在-80℃用

2、15-20%甘油冻存)由于转入的质粒带有抗性标记,用带有抗生素的培养基即可进行选择性培养。分为固体培养基培养和液体培养基培养分子实验基本操作——大肠杆菌的培养Step0:LB培养基的配制(1L培养基含)10gTryptone5gYeastExtract10gNaCl15gAgar(仅在固体培养基中加入,注意琼脂为Agar琼脂糖/Agarose区分)1L去离子水一般一瓶配100-300mLStep0’:灭菌(此后一切保持无菌操作)分子实验基本操作——大肠杆菌的培养固体培养基培养(用于筛选或短期保存菌种)St

3、ep1:倒板微波炉加热培养基->室温冷却至60℃左右->移入超净台,加入抗生素(1000*的,即需稀释1000倍),摇匀->趁热快速倒入平板,12mL/板->超净台内室温冷却凝固Step2:接种划线法:烧红接种环->冷却->蘸上菌液->在平板上划线->灼烧接种环。多用于菌种保存平铺法:用玻璃刮刀将菌液铺干与平板上,多用于转化分子实验基本操作——大肠杆菌的培养固体培养基培养Step3:37℃培养箱中培养。注意需要先正置10min(防菌液倒流)再倒置培养(防止染杂菌)。注意培养时间不可过长,一般不超过16小时

4、,防止突变株产生。Step4:培养结束后,需放入4℃冰箱的,为防止染杂菌,最好用parafilm封口。分子实验基本操作——大肠杆菌的培养液体培养基培养(用于扩增)Step1:取出适量培养液于锥形瓶或试管。Step2:加入适量抗生素。Step3:将目标菌落挑入培养液。(可用接种环或枪头)Step4:将培养液放入37℃摇床中培养,转速一般为220rpm。(为什么要摇?)分子实验基本操作——大肠杆菌的培养注意事项:无菌操作!!!抗生素加入的时机及量培养时间(不可过长)返回分子实验基本操作——感受态的制备原理:感

5、受态-可接受外来DNA的状态CaCl2法制备–Ca2+可以使膜骨架发生改变,产生膜上的小孔洞,并可使DNA分子结合并进入细胞内。步骤:比较麻烦,属较考验分子操作的实验之一。往往大批量制备,因此不需经常进行。注意事项:感受态制备后应立即冻存于-80℃。使用时不可反复冻融。返回分子实验基本操作——酶切及酶切片断回收原理:限制性内切酶:1)发现于细菌中,用于降解噬菌体的DNA;宿主自身的DNA则被甲基化。2)分为I、II、III类。常用II类(识别位点与酶切位点一致)3)区别与外切酶活性(内切酶彻底切断DNA双

6、链,外切酶只切其中一链,往往用于DNA复制的实时检验。)分类:单切和双切分子实验基本操作——酶切及酶切片断回收单切:Step1:酶切体系的选定确定选用的酶->查找对应高效率的buffer(常用的buffer有H,M,L,K,T五种),确定要不要加BSAH,M,L,K,Tbuffer都有什么?H-High,M-Medium,L-Low,K-KCl,T-Tri-AcetateB-L,G-M,O-H,R-K,Tango-T分子实验基本操作——酶切及酶切片断回收Step2:配制酶切体系:以10uL体系为例0.5u

7、L内切酶(含50%甘油防冻)1uLBuffer(10*)5uL质粒3.5uL去离子水原则:1)甘油含量不可超过总体系5%,防止星火性2)质粒可根据具体情况调整3)内切酶切记不可置于常温!!分子实验基本操作——酶切及酶切片断回收Step3:置于37℃培养箱中,温育2-4h。(用水浴也可以,但可能会使溶液因蒸发而产生浓度不均匀)。注意有些特殊的酶所需的条件有所不同,主要是温度条件。Step4:纯化,方法同PCR片段纯化。Step5:电泳检测分子实验基本操作——酶切及酶切片断回收双切:Step1:酶切体系的选定

8、确定选用的两种酶->查找对应双切的Buffer,同时看与分别单切的高效buffer是否吻合->确定要不要加BSAStep2:配制酶切体系。与单切类似,但需要注意酶的用量。(甘油含量不可超5%.)Step3:37℃温育2-4hStep4:凝胶回收分子实验基本操作——酶切及酶切片断回收凝胶回收:即双切后将所需要的小片段重新富集纯化。Step1:电泳,电泳过程中称重一小离心管。Step2:电泳结束后,将凝胶置于成像仪内。Step3:

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