ｍｓ软件常见问题及解决方法

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1、目录Q1：为什么使用Discover进行Dynamics计算时，如果设定了Pressure=1GPa，在计算结果中会出现Pressure等于0，而Stress的XX、YY、ZZ方向为1GPa的情况？4Q2：如何在Discover计算中分别对相同环境原子分配不同力场类型？4Q3：如何在CASTEP计算中限制某个原子的移动方向？4Q4：在安装新的MS时，事先没有停掉LicenseServer，在卸载、安装MS后，发现MS的LicenseServer无法正常启动。5Q5：如何修改Windows或者Li

2、nux下的端口号：5Q6：如何使用DMol3进行动力学计算？6Q7：如何让Discover程序输出.arc文件？7Q8：如何使用rattle关键词来限制水分子的几何结构？7Q9，如何使用Standalone方式运行DMol程序？7Q10：如何在DMol中加入外界电场？7Q12，如何以Standalone方式运行Discover作业？8Q13：为什么我在QSAR模块中无法找到新加入的Jurs和DMol3描述符？8Q14：如何在DMol模块中，对某一分子只允许其沿着Z方向进行优化，而XY方向则不变？

3、8Q15：如果CASTEP计算过程中断电，怎么能够重新开始计算呢？在Keywords中有两个关键词Reuse和Continuation，它们有什么差异呢？8Q16：如果我在Cleave一个平面的时候，选择的是(111)面，或者该晶体原来就是一个三斜晶胞，我怎么才能切出一个长方形的表面来呢？9Q17：在使用DMol进行结构优化的时候失败，通过对轨迹的回放发现，整个分子在平面上下进行翻转，并由此导致能量振荡，这种情况应当如何处理？9Q18：如何使用XRD数据快速建立相关的晶体结构。9Q19：如何在D

4、Mol中考虑溶剂化效应？10Q20：如何使用MS软件计算高分子的玻璃化温度？11Q21：在使用MS进行计算的时候，中间的xcd文件无法及时更新，而其他文件则能正常显示，为什么？12Q22：怎么样在MesoDyn中加入各种不同的限制？12Q23：MS给出的DOS和能带图不是很清楚，我能不能自己来做图？12Q24：怎么样能让CASTEP在并行计算时更有效？12Q25：在使用DMol计算过渡态结构时，经常会发现出现不止一个虚频，怎么回事？13Q26：怎么在Altix350上安装MS的Castep和DM

5、ol的补丁加速运算速度？13Q27：为什么我在Linux下安装license的时候，总是报错呢？13Q28：在使用SGIAltix350，打补丁后运行RunCASTEP.sh–npnseedname的时候，出现错误：MPI：asgetnetinfo_array('(null)')failed:arrayservicesnotavailable，怎么解决？14Q29：MS的GFA是怎么对参数进行杂交的？参数多少与内存有无关系？14Q30：DFT方法对计算量和内存的要求是什么样的？15Q31：为什么

6、当DMol3在我机器上运行过的时候，总是出现以下错误：floating-pointassistfault？16Q32：在使用DMol3算频率的时候，突然断电了，怎么才能继续算频率呢？16Q33：在Castep模块中，Electronic中的Pseudopotentialrepresentation，有RealSpace和Reciprocalspace，如何取舍？17Q34：如何从Discover的输出文件中查看每桢中原子的坐标以及速率等信息？17Q35：我使用的是Standalone方式进行Ca

7、step和DMol3计算，完成后怎么才能看到最终结构和轨迹呢？17Q36：DMol中有TSConformation也有TSOptimization，应该选取哪一个来搜索过渡态？17Q37：在使用CASTEP进行过渡态（TS）搜索时，当用reactionpreview产生一个轨迹文件之后，对该轨迹文件进行TSsearch运算时，在本机直接计算可以进行，但是进行savefiles时，却无法完成提示UnabletosetUserID.Trajectoryfilewillbeinvalid.18Q38：

8、在Castep中，怎样输出电荷密度？相关数据的单位是什么？18Q39：如何在Discover中使用BTCL语言进行多步MD计算？18Q40：如何用Dmol3计算OverlayMatrix，并进一步分析？21Q41：如何使用Castep程序计算IR振动，为什么计算老是说不收敛？22Q42：为什么我在手工使用Castep计算能带结构、态密度或者声子谱的时候，程序始终提示没有Check文件？22Q43：Discover的Non-bond中Summation的三种方法有什么区别？22Q44：Castep