提rna+逆转录+qrt-pcr步骤模板

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1、

2、【一、提RNA】一、实验准备:1、试剂:75%乙醇、Trizol、1.5mL进口EP管、氯仿、异丙醇、进口枪头(RNA专用)、2、配75%乙醇(DEPC水+无水乙醇),放-20℃冰箱预冷;3、预冷离心机(1.5mLEP管用的);4、清洁桌面,酒精喷过之后擦干,新手套、两层口罩;二、操作步骤:01、弃上清(不回收,直接倒去);02、1mL/孔PBS洗两遍(不回收,直接倒去,随后用200μL枪吸尽PBS);03、每孔加500μLTrizol,轻晃,随后室温放置2min左右;04、枪头吹打,吸出放入1.5mL进口EP管;05、加入100μL氯仿(

3、即1/5体积的trizol);06、4℃离心机,12000g,15min;07、吸200μL(可减少)上清放入新的1.5mL进口EP管中(注意:只能吸到上清);08、加入等体积异丙醇,充分混匀,常温放置10-30min(15min);09、4℃离心机,12000g,10min;10、倒掉液体,加入1mL预冷的75%乙醇剧烈混匀;11、4℃离心机,7500g,5min;12、倒掉上清,加入1mL预冷的75%乙醇,混匀;13、4℃离心机,7500g,5min;14、倒掉上清,倒扣在餐巾纸上,5-10min,用针头或者200微升枪头去掉管壁上的水珠

4、;15、每管中加入40μL(40μ-60μL)的DEPC水,吹打溶解;16、测浓度(先知楼21楼测RNA浓度,带DEPC水、灭菌的dd水、10微升枪和枪头);三、注意事项01、如果当时不测RNA浓度,可暂时把RNA放在-20℃冰箱。但长时间(>24h)保存,需要放在-80℃冰箱;02、异丙醇作用是沉淀RNA,作用比乙醇好;03、04、05、06、07、08、09、

5、【二、测RNA浓度】一、实验准备:01、先知楼21楼-2109教室,一个冰盒+DEPC水+10微升枪、灭菌ddH2O、10μL枪头(RNA专用)、本子+笔;二、操作步骤:01、登记

6、;02、打开电脑==>打开“N”软件==>点击“Nucleicacid”==>选择“OK”==>选择“RNA”;03、灭菌ddH2O清洗2-3遍,擦干;04、DEPC水校零:即加DEPC水一滴,点击“Blank”,擦干;05、测RNA:加样品一滴,点击“measure”,擦干,随后加下一个样品;06、记录数据,包括RNA浓度(<1000ng/μL)、260/280;07、灭菌ddH2O清洗2-3遍,擦干;08、-80℃冰箱保存;三、注意事项230nm代表有机物水平(碳水化合物),260nm代表RNA水平,280nm代表蛋白水平,260/230

7、表示有机物量,260/280代表RNA提取量;1.A260nm是核酸最高吸收峰的吸收波长,最佳测量值的范围为0.1-1.0。如果不在此范围,稀释或浓缩样品,使之在此范围内;如果吸光度小于0.05,检查是否存在操作因素(如移液不准确,样品内有悬浮物等)影响。DNA样品的A260吸光度值是否>0.1。(请注意,这个值跟仪器无关,核酸的吸光度必需大于0.1,其值才有效和可靠,因为样品中的杂质和颗粒这些不纯物的干扰通常会对光有一定吸收,其值<0.1);2.A280nm、A270nm是蛋白最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度评估:纯DNA的A2

8、60/A280比值为1.8,纯RNA为2.0。如果比值低,表示受到蛋白(芳香族)或酚类物质的污染,需要纯化样品。比值=1.5相当于50%蛋白质/DNA溶液.酚的最大吸收峰在270nm。3.A230nm是碳水化合物最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度评估:纯DNA和RNA的A260/A230比值为2.5。若比值小于2.0标明样品被碳水化合物(糖类)、盐类或有机溶剂污染,需要纯化样品。A230产生负值主要是由于在很低DNA浓度的溶液中的一些其他成分的干扰所导致的。在下一个测定中,需要降低样品的稀释度,A230的负值会被校正。 4.A320

9、nm或A340nm为检测溶液样品的浊度和其他干扰因子。该值应该接近0.0。如果不是,标明溶液中有悬浮物,需要纯化样品。纯样品的A320一般是0。 5.A260/A280和A260/A230是核酸纯度的指示值。纯度好的DNA或RNA,在pH7-8.5下A260/A280的比值应该在2.0或2.5。纯净的样品比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。如果比值低于1.8或者2.0,表示存在蛋白质或者酚类物质的影响。A230表示样品中存在一些污染物,如碳水化合物、盐(胍盐)等,较纯净的核酸A260/A230的比值大于2.0。当0.5%BSA蛋白质

10、污染时,蛋白污染会导致260和280的数值都下降,其净结果是260/280比值下降,但260/280的比值变化并不显著,正如分子克隆3所说。但蛋白残留会导致230的

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