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时间:2018-11-01
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1、为认真贯彻落实市、区有关农村工作会议精神,学习借鉴外地先进经验,加快我乡经济建设步伐,推进农业产业化、标准化进程兴趣小组活动总结 一引子 基因组学课程期末考试的最后一道论述题,是“请根据自己的理解,总结基因组非编码区可能的功能”,。当时回忆起Watson主编的《MolecularBiologyoftheGene》中说,3200Mb人类基因组里,除了48Mb是基因外,还有intron、UTR、pseudogene、microsatellite、transposon以及编码miRNA的序列,便如是作答。这道题,引起了我对基因组非编码区功能的极大兴趣:为什么物种越往高等进化
2、,基因组非编码序列的比例就越高?为什么仅仅两万八千左右个基因,就能决定人类作为万物之灵长的地位,可这个数目并不比果蝇多多少啊?什么决定了人类的智力,关键在于基因序列还是所谓的“junkDNA”?玉米的基因组比水稻大很多,但也未见得玉米就比水稻高等,那么是什么决定了基因组的大小呢?这些问题时常浮现在我脑中,正好借晓东所长提出的“兴趣小组”活动,通过跟组员的讨论、与PI的交流,希望产生一些思维碰撞的灵感。 这一系列文章,是我对“兴趣小组”活动的全面总结,一部分是流水账般的记叙小组讨论,一部分是跟PI讨论的收获,还有一些是我们自己mentalexercise的过程,包括提出的
3、假设、可能的实验手段和存在的瓶颈,最后是组员的一些感想。近年来,该市紧紧围绕“全省进前列,百强上位次”的发展目标,不断调整优化农业结构,全面推进农业产业化、标准化、国际化进程,促进了全市农业农村经济的快速发展。为认真贯彻落实市、区有关农村工作会议精神,学习借鉴外地先进经验,加快我乡经济建设步伐,推进农业产业化、标准化进程 值得一提的是,虽然我们小组人数不多,但指导老师是最多的,这给我们提供了更多与PI交流的机会。 最后说明一下,我们所说的“non-codingDNA”,是指不编码蛋白的基因组DNA序列。 二组员和最初的几次讨论 我们小组的题目是“基因组非编码序列的
4、功能”,先描述一下各位组员吧。 梅坤荣,华科生物信息专业。我觉得她最强的地方是,不论组员之间意见多么分歧,抑或是思路不太清晰,她都能帮我们理清头绪,首先做什么,接着做什么,并提出大家都容易接受的方案。 高冠男,山东大学,一个说话声音不大的女生,对non-codingDNA在个体发育中的调控作用十分感兴趣。记得每次讨论的时候,都很认真的记笔记,提出的问题往往能反映出她活跃的思考。 殷毅,北师大,在以前的实验室做了一年关于microRNA的实验训练,相当能提问,从她的提问中,能感觉出她读过各个方面的论文,有很广泛的知识背景,此外对非编码区编码的microRNA很感兴趣。
5、近年来,该市紧紧围绕“全省进前列,百强上位次”的发展目标,不断调整优化农业结构,全面推进农业产业化、标准化、国际化进程,促进了全市农业农村经济的快速发展。为认真贯彻落实市、区有关农村工作会议精神,学习借鉴外地先进经验,加快我乡经济建设步伐,推进农业产业化、标准化进程 叶瑞强,武汉大学。人称“小强”,一个相当粗犷的山东汉子,对自己的人生道路有很明确的把握,他永远不会拒绝需要帮助的人。他的实验经历很丰富,是能花100%精力做好一件事的人。此外,篮球、乒乓球、排球……他样样精通,要打球,找他准没错。 林珑,安徽大学。说话语速挺快,做事很有热情的女生。 最初的几次,主要讨论
6、了从什么角度研究non-codingDNA,有人希望把精力主要放在non-codingDNA的进化问题上,还有人提议把焦点集中在non-codingRNA上,也有人提议将non-codingDNA分为卫星/微卫星序列、转座子、假基因、内含子等不同特点的类别进行讨论。总之,没有统一的意见,我们决定找指导老师讨论后,再做决定。 三与PI的讨论 杜立林老师的研究方向主要是,以裂殖酵母为实验材料研究DNA双链断裂。他向我们介绍了“TheENCODEProject”,难以置信的是,研究表明整个基因组,包括DNA的两条链,都会被转录。他还提到,河豚的全基因组测序并不是因为作为模式
7、生物来研究,而是因为它比其他脊椎动物基因组小很多,所谓的“垃圾DNA”很少,可能成为研究如何在含较少non-coding近年来,该市紧紧围绕“全省进前列,百强上位次”的发展目标,不断调整优化农业结构,全面推进农业产业化、标准化、国际化进程,促进了全市农业农村经济的快速发展。为认真贯彻落实市、区有关农村工作会议精神,学习借鉴外地先进经验,加快我乡经济建设步伐,推进农业产业化、标准化进程DNA情况下,基因组是如何复制的模型。他让我们意识到,基因组不同层次的包装,似乎也存在着某种密码,例如某些位置相对固定的核小体所需的核小体定位信号
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