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时间:2018-10-25
《auv多源观测数据融合方法及应用技术研究》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在工程资料-天天文库。
1、哈尔滨工程人学硕士学位论文AUV多源观测数据融合方法及应用技术研究姓名:李举锋申请学位级别:硕士专业:控制理论与控制工程指导教师:边信黔20110314战T.监督流形箅法的⑽冇不规则蛋门质结构预测研究法将U基酸序列毡化,利川径向基核函数的支持向记机方法构建成员预测器模型。利川体系框架、成员预测器的设计方法以及1111算法的基本原理和实现少骤。通过实验结果吋以肴出,利用多预测器融合算法后的预测精度明显优于单个成w预测器的预测精关键词:固有不规则蛋白质:支持向量机;局部线性嵌入;1111算法;序列属性基丁.监督流形学习算法的D萦胁还DDD蛋昀质结构预测研究DDDOODODDDDDDO
2、DDDD,DDODDDD肫ODODD.DDbddDDDD0DD000DDDDDDDDDD®0DDffiDODDO0ODDDDDDDD.00醐嫉DDddDDDDDDDDDDD培DDDDODDOODO,DDDDDDDDDODDD000DDD0DD0DDDDDD摇DDDDDDDD3SDDDDDD0000DDD0DDDDD的培DDDODDDDDDDDDDDDD0DD0OOOOD^DOODDD琚DDDD诱t),£)DDDDDJ獅曜)DDD,DDODODDDDD醐DOODODDO醐熔DDDDDDDDDD00DDOOOfiiDOOODDODDuQuQQQQQ00QQQ0000牧000qqqQQ
3、QQQQQ^QQQQQQQQQQ;QQQQQQQQQ^QQQOQQQQ00论文的背景和意义生物体的基W决定了构成该生物体的氨基酸序列,氨基酸序列决定了蛋A质的结构。当氨基酸序列折叠成特定的空间构象之后将具有相应的牛物活性和牛物功能。也就是说,蛋白质的生物学功能在很大程度上取决于其空间结构,蛋白质结构构象多样性导致了不同的牛物学功能。因此了解缶白质的结构对于生物学研究是非常重要的。的生物基因组被测序,00蛄惮0恳步0嬤U缭觯0纱米颐峭E蹏U序列分析技术和某因识別方法可以推导出大量的氨基酸序列,这就会导致已知序列的蛋白质数量和己测定结构的蛋a质数景的差距会越来越人。o世纪o年代后期,
4、GGGG首先发现/折叠蛋白质在允许重新折叠的实验条件下可以重新折叠到原來的结构,这种大然结构对于缶Q质行使其生物功能具奋重要作川,他认为人多数蛋a质只有在折叠成其天然结构的时候才能具存完全的生物活性。由此,0GG0提出蛋白质折叠信息隐含在蛋白质的一级结构中,根据这一原理,人们对蛋G质结构预测进行Y人景的算法和实验研究。现在,分子生物学家已经可以运用适当的算法,从氨基酸序列出发,预测蛋內质结构。白质称固有不规则蛋白质⑽加a.otmoo捉ooo也称为天然无结构蛋12质OOOOOOOQOOGGOOOOO捉000。iOQ芯令呙侨衔w怯捎赝a缺乏特定的刚性结构,具行乂活巧吋帮的结构,所核磁
5、共振学0000QQQQQQ,如方法是目前比较有效G个冋有不规则蛋白质0U则包含了ti丰富固旮不规则蛋白质数据iK)年toj展o嫉脈tjiiij00固有不规则蛋白质结构预测器的研究现状其中一个重要的发展足00年第五次蛋白质结构预测评比竞赛00uuuuuUUOOOOOtltl简称叫0会议中包含了对不规则结构预测会议如。这次会议的勾会者以氨基酸序列来预测预测不规则蛋n质的结000綱0QQ://OQQQ.QQQQQQQQQQQQI0表00公布的部分预测器名称、吋W以及基本方法000系列是巾几个预测器组成,他们基子不规则区域的不冋长o度及氨基酸在预测中位S来预测结构,000屮所有预测器表现
6、出相当好的预测效米0000主要思想是基于氨基酸残QQ基对规则和不规则状态的相对倾向°性预测结构。UU://OO昀Cl.Ch0/0000/UUOO/UUUUUP:uuuuu://uuurjuoo.u/uuUUUU://OtlflO杓00000甶000000的基本思想足,蛋门质结构的平衡取决与各个氨基酸残基的相互作用以及他们的构象熵。000的基本思想是,氨基酸残《之间的和互作用决定了一个蛋白质是否产生规则结构还是不规则结构。000利用了一维递归神经网络和贝叶斯方法构建预测模型。00是根据氨站酸序列的功能。uu://㈨畐㈨叫逄G甶0砌]UU://UUUUSIU.0/UUUZ醐【明UUU
7、UUUU亲水性的比率预测结构。0叫由两个预测器组成,他们都是的不规则区域。利川递归圾人化对比树OOGUUUUUUUU预测同#不规则区域。方案并浓缩了特殊位筲的打分矩UUUUU局部鉍基酸序列信息,另一个基于络的预报器,它预测的是长不规则环形区域。土迷土t舰飢成。遥由土出淀土tffl土fe+卜H■晚也-H*组成。w威廉姆斯±hi±hi第-•次尝试根裾氨基酸序列来预测这种缺乏结构性的蛋白质。他桁出带电氨基酸数贵与疏水性氨基酸数虽的比在缺乏结构的蛋白质与无折脊冇序结构蛋白质屮是不同的。他
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