基础医学网络信息资源整合及应用

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1、基础医学网络信息资源整合及应用基础医学在医药卫生领域起着举足轻重的作用。多年以来，我国基础医学研宄在疑难病症的病因、病理、病程发展等方面取得了卓有成效的成果⑴。基础医学研宄离不开信息资源的支持。目前X络中积累的基础医学资源主要包括人体生理心理相关数据、基因序列、蛋白质图谱、可视人体图像等。欧美一些发达国家医学信息X络化建设起步较早，资源的X络化服务也比较成熟。像欧洲的EMBL、美国的NCBI、日本的DDBJ都建立了多个大型的基因数据库和蛋白质结构数据库，实现数据的同步交换和更新，成为基础医学研宄必需的资源获取平台。我国基础医学资源较为分散，主要存储在不同的科研

2、单位，多以小型专业数据库的形式为用户提供服务，有各自的访问路径和查询接口，服务方式和资源类型都较为单一。如何在这些广泛、类型不同的资源之间建立联系，满足用户全面的资源获取需求，提高资源的利用率和共享率，是我国基础医学研宄必须面对的一大问题[2]。目前，解决这一问题的方法是实现基础医学资源整合。1资源整合的意义1.1为科研工作提供便利科研水平的进步和科研内容的丰富使基础医学研宄过程中对科学数据资源的需求不断提高[4]。基础医学的研宄是多个学科的交叉和融合。通过整合基础医学资源，科研人员可以通过一次检索获取多个学科的相关信息，提高了他们的信息资源①中国医学科学院基

3、础医学研究所，北京协和医学院流行病与卫生统计学系②中国医学科学院基础医学研究所，北京协和医学院X絡中心③中国医学科学院基础医学研究所，北京协和医学院基础学院病原生物学系分子寄生虫实验室北京100005*基金项目：科技部国家科技基础条件平台科学数据共享工程重大项目。获取能力。基础医学资源整合提高了现有数据资源的利用率，避免了科研的重复投资1.2为政府决策提供支持基础医学资源整合可以让有关部门对我国基础医学科研现状整体把握，能够更为科学地判断基础医学研宄热点，实现科研资金的合理分配，提高科研效率。通过对整合资源的系统分析，能够提高数据分析的质量[5]，为我国政府卫

4、生管理政策的制定和卫生决策的实施提供更为有力的支持。1.3加强基础医学资源管理目前基础医学数据资源呈现电子化、X络化、分布性、无序性等特点这给资源有效管理和合理调配带来很大困难。通过资源整合可以有效地实现数据资源的统一管理，实现科研成就的传承和利用。2基础医学资源整合建设近年来，我国政府极为重视科学数据共享，己经将其作为一项战略选择纳入国家科技基础条件平台建设。基础医学科学数据共享X(http//.bmicc.,以下简称“共享X”)作为国家科技基础条件平台建设下医药卫生共享项目的子项目，其主要目的就是实现我国X络环境下的基础医学资源整合。通过过去几年的不断建设

5、，共享X取得长足的进步和广泛的影响，使我国基础医学领域的资源整合取得了较为技术：共享X采用门户技术(Portal)来实现资源整合。门户是一个应用框架，它能将各种应用系统、数据资源集成到一个信息管理平台上，并以统一的用户界面提供服务。利用门户中的内容管理系统(contentmanagementsystem，CMS)将各个数据库整合到共享平台中，为用户提供一站式的资源浏览和检索系统，避免了信息冗余和查询重复，提高信息获取效率。共享X对整合的数据资源采用Oracle数据库进行管理，并用Windoetadata)是关于数据的数据，是描述、定位、检索、利用、管理信息资源

6、的结构化信息。利用元数据对基础医学信息资源进行开发和描述，统一定义各种数据资源的基本信息和功能，为用户使用提供方便。3资源整合中的问题及对策3.1资源整合中存在的问题3.1.1数据标准不统一：由于基础医学资源类型多样，数据编码和组织方式都差别较大，数据管理没有统一的标准，为资源整合带来了很大的麻烦。3.1.2资源管理不规范：有些基础医学资源涉及到保密性或安全性等问题，没有完善的管理办法对其进行合理规划，并且资源整合还面临资源所有权、知识产权及个人隐私等问题，给资源整合带来不便。3.1.3多数单位配合积极性不高：目前我国科学数据共享相关政策和法律法规尚不完善，缺

7、乏相应的补偿机制和激励机制，致使共享积极性不高，共享观念淡薄。一些数据资源被视为个人或单位所有，使得长期积累的数据资源无法实现更高的科学价值。3.1.4数据分类和编码紊乱：基础医学研宄己经积累了大量的科学数据，但是这些科学数据资源缺乏系统化的归纳、层次化的标识和规范化的表达，缺乏统一的、可操作的资源调查、规划、设计与描述，导致科学数据资源使用效率低。数据格式的不同导致描述和管理的差异，给资源整合带来困难。3.1.5复合型人才匮乏：基础医学资源整合需要具备掌握基础医学知识、软件开发技术和资源管理方法的复合型人才。而目前从事资源整合工作的人员大多只具备单一领域的知

8、识背景，难以实现明确的需求分析和充分的