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1、“探索100”集群机用户培训(1)——集群机概述及linux基本使用清华信息科学与技术国家实验室（筹）高性能计算平台培训内容系统环境介绍Linux常用命令Vi编辑器的使用环境变量设置Shell脚本的简介集群机的三大优势计算节点每个节点为一个独立的工作站/服务器节点配置：两颗IntelXeonX5670六核处理器（2.93GHz，12MBCache）370个节点32GB内存，370个节点48GB内存高速网络：InfiniBandQDR通信网络构成，理论带宽40Gb超大容量存储系统：存储容量：1000PB的存储
2、容量文件系统读写效率:实测写带宽4GB/s系统部署示意图“探索100”百万亿次集群机共有740个计算节点，8880个处理器核系统的理论峰值浮点计算性能达到104TFlops存储总容量达1000TB“探索100”系统部署用户登录：校内用户访问ln0:166.111.143.18校外用户访问ln1:166.111.143.19严禁用户在登录节点编译及运行程序计算节点：共计740个：分37个刀片箱。测试节点：c01b02、c01b03（用户可以访问）计算节点：c01b08~c01b20,c02bxx~c37bxx
3、（用户无法直接访问）登录方法：使用ssh相关协议软件访问机器sshc01b02/sshc01b03访问测试节点培训内容系统环境介绍Linux常用命令Vi编辑器的使用环境变量设置Shell脚本的简介目录操作ls:显示目录下所有文件及目录ls–al/ll(注意隐藏文件)在WORK目录及其子目录下，文件数较多时，请尽量不要使用ls，防止登录节点死机cd:从当前目录转移到指定目录cdWORKcd..cd~（~代表/home/username）pwd:显示当前目录的绝对路径mkdir:创建子目录mkdirtestrm
4、dir:删除子目录rmdirtest/rm–rftest文件操作touch:创建文件touchaacp:复制文件cpaaaa.bak(修改文件之前，养成备份的习惯)cpaaWORK/cp–rtestWORK(-r为目录拷贝)cd/apps/course;cp-rcourse/~/mv:移动文件mvaa./WORK/mvaa.bakbbrm:删除文件rmbb（不要在~使用rm–rf*,删除自家目录的隐藏文件）文件显示先进入course目录：cd~/linjiao/coursecat:显示文件/合并文件catP
5、OTCARcatlist1list2>list3more:分页显示文件morePOTCARhead:显示文件头部headPOTCARhead-n20POTCARtail:显示文件尾部tailPOTCARtail–n20POTCAR其他文件相关命令ln:创建连接文件(cdWORK/linjiao)ln-s~/linjiao/course/runrunln–s~/linjiao/course/vasp.Hg/vasp.Hgdiff:比较文本文件(cd~/linjiao/course)diffjobjob.bak
6、grep:文本搜索工具grepmpi*.cfind:递归搜索目录下文件find~-name*.txtfind~/-name*.txt–execrm{};(注意rm与{}与都有空格,以;为结尾)正则表达式操作符名称操作符使用举例意义支持的工具析取
7、x
8、y
9、zx,y或者zawk,egrep任意字符./L..e/Love,Live,…所有工具字符串首字符^^x以字符x开始的串所有工具连接xyzxyz所有工具字符串尾字符$x$以字符x结束的串所有工具转义字符\**sed,vi组合()或()(xy)+xy,
10、xyxy,…所有工具可选?xy?x,xyawk,egrep重复(零次或更多)*xy*x,xy,xyy,xyyy,…所有工具重复(一次或更多)+xy+xy,xyy,xyyy,…所有工具集合[][^][Hh]ello[^A-KM-Z]ovehelloLove,HelloLove所有工具正则表达式举例例四：任意一個字元.与重复字元*：grep-n'g..d'regular_express.txtgrep-n'ooo*'regular_express.txtgrep-n'goo*g'regular_express.
11、txtgrep-n'g*g'regular_express.txtgrep-n'[0-9][0-9]*'regular_express.txt例五：限定连续字符范围{}grep-n'o{2}'regular_express.txtgrep-n'go{2,5}g'regular_express.txtgrep-n'go{2,}g'regular_express.txt例一：搜寻特定字串：grep-n't
