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1、代谢组学在肿瘤研究中的应用2012-3-13代谢组学概况代谢与肿瘤的关系代谢组学在肿瘤研究中的应用1.代谢组学1-1代谢组学的定义代谢组学(metabonomics):某一生物或细胞所有低分子质量代谢产物进行定性和定量检测,分析活细胞中代谢物谱变化的研究领域生物标本:血液、尿液等体液,组织、细胞提取物、细胞培养液1-2代谢组学分析技术-NMRNMR光谱:NMR技术是最早被用于代谢组学研究的技术之一.其利用原子核在磁场中的能量变化来获得相关信息。目前常用的有1H-NMR、13C-NMR和31P-NMR.1-2代谢组学分析技术-NMR1-2代谢组学分析技
2、术-NMR1-2代谢组学分析技术-NMRWarburg,O.Ontheoriginofcancercells.Science123,309–314(1956)TheWarburgEffect1-2代谢组学分析技术-MSMS:MassSpectrometry,质谱基本原理是:将样品中各组分电离成离子束,进入质量分析器聚集而得到MS图谱,以确定其质量。1-2代谢组学分析技术-MS1-2代谢组学分析技术-MSMS:MassSpectrometry,质谱需联合色谱技术对样品进行前期分离(1)GC—MS联用:GC技术是以气体作为流动相的色谱法.常用于分离挥发性
3、化合物。(2)LC—MS联用:LC技术是以液体作为流动相的色谱法.适用于分离低挥发性或非挥发性、热稳定性差的物质。2.代谢与肿瘤的关系2-1Tumorglucosemetabolicphenotypes:GlucoseglycolysisandoxidativephosphorylationWarburg,O.Ontheoriginofcancercells.Science123,309–314(1956)TheWarburgEffect2-2Tumorglucosemetabolicphenotypes:Thepentosephosphatepat
4、hway2-3Tumorlipidmetabolicphenotypes:SimplifiedoverviewoftumorlipidmetabolismJournalofNuclearMedicine2008,Vol.49No.Suppl_243S-63S2-4Tumoraminoacidmetabolicphenotypes:Regulationofglycolysis,glutaminolysisanddenovonucleotidebiosynthesisintumorcells.CurrentOpinioninGenetics&Develo
5、pmentVolume19,Issue1,February2009CellSeptember5,2008,134,703-707CancerCellJune2008,13,472-4822.1P53与肿瘤代谢2-1.p53intumorcellmetabolism:glycolysisFigure1Thethreemetabolicfatesofglucoseincellsandtheroleforp53inglucosemetabolismnaturecellbiologyVOLUME13
6、NUMBER3
7、MARCH2011Bensaad,K.et
8、al.Cell126,107–120(2006).2-1p53intumorcellmetabolism:glycolysisOnetargetofp53knowntoaffectglucoseglycolysisisTIGAR2-1p53intumorcellmetabolism:glycolysisOnetargetofp53knowntoaffectglucoseglycolysisisTIGAR2-1p53intumorcellmetabolism:glycolysisOnetargetofp53knowntoaffectglucosegly
9、colysisisTIGARBensaad,K.etal.Cell126,107–120(2006)thefourgenes(pfkfb1–4)encodingtheenzyme6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase(PFK-2/FBPase-2)2-1p53intumorcellmetabolism:oxidativephosphorylationp53Cell126,July14,2006Onetargetofp53knowntoaffectglucoseoxidativephos
10、phorylationisSCO22-1p53intumorcellmetabolism:oxidative